2016 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of control mechanisms of transcriptional checkpoint during Pol II elongation, termination, and recycle
Project Area | Integral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches |
Project/Area Number |
24118002
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Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
Principal Investigator |
山口 雄輝 東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (50345360)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田村 智彦 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (50285144)
高橋 秀尚 北海道大学, 医学研究科, 講師 (30423544)
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Project Period (FY) |
2012-06-28 – 2017-03-31
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Keywords | 遺伝子 / 発現制御 / 発生・分化 / 生体生命情報学 / 酵素 |
Outline of Annual Research Achievements |
山口らは、Pol IIが辿る複数の転写終結・3’プロセシング経路の選択機構の解明を目指して、転写伸長因子NELF、キャップ結合因子CBC、エキソソーム補因子MTR4のノックダウンがポリ(A)付加に及ぼす影響をゲノムワイドで解析し、3つの因子が驚くほど類似の機構でポリ(A)付加部位を制御していることを明らかにした。山口はさらにダイナミックな転写複合体の新規解析法の開発を進めており、細胞内のin situで目的因子の周辺因子をビオチン化し、アビジンビーズ精製することで同定する新規プロテオミクス手法の基盤を確立した。 田村らは、27年度までに明らかにした「血球分化におけるエンハンサーと遺伝子間の多段階かつ双方向性の活性化」の機構をさらに解析した。まず、相互活性化を担う候補分子としてCBP/p300を見出した。さらに、この活性化機構の普遍性を、ヒト検体ならびにマウス生体由来の血球細胞のChIP-seqやクロマチン高次構造データを用いて検討した。その結果、複数の血球分化系において双方向性の活性化に特徴的なエピゲノム制御を受ける遺伝子群が確認され、その普遍性が明らかとなった。 高橋らは、メディエーター転写複合体のサブユニットMed26が、2つの異なる転写伸長因子複合体Super elongation complex(SEC)やLittle elongation complex(LEC)と結合し、SECをmRNAにポリ(A)のある通常の遺伝子領域に、LECをsmall nuclear RNA遺伝子や複製依存性ヒストン遺伝子などのポリ(A)のない特異な遺伝子領域にリクルートし、転写終結も制御する可能性を示唆した。
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Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Down-regulation of Irf8 by Lyz2-cre/loxP accelerates osteoclast differentiation in vitro2016
Author(s)
Saito E., Suzuki D., Kurotaki D., Mochizuki A., Manome Y., Suzawa T., Toyoshima Y., Ichikawa T., Funatsu T., Inoue T., Takami M., Tamura T., Inagaki K., Kamijo R
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Journal Title
Cytotechnology
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Lyn Kinase suppresses the transcriptional activity of IRF5 in the TLR-MyD88 pathway to restrain the development of autoimmunity2016
Author(s)
Ban T., Sato G.R., Nishiyama A., Akiyama A., Takasuna M., Umehara M., Suzuki S., Ichino M., Matsunaga S., Kimura A., Kimura Y., Yanai H., Miyashita S., Kuromitsu J., Tsukahara K., Yoshimatsu K., Endo I., Yamamoto T., Hirano H., Ryo A., Taniguchi T., Tamura T.
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Journal Title
Immunity
Volume: 45
Pages: 319-332
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Ribophorin II is involved in the tissue factor expression mediated by phosphatidylserine-dependent antiprothrombin antibody on monocytes.2016
Author(s)
Fujieda Y., Amengual O., Matsumoto M., Kuroki K., Takahashi H., Kono M., Kurita Y., Otomo K., Kato M., Oku K., Bohgaki T., Horita T., Yasuda S., Maenaka K., Hatakeyama S., Nakayama K.I. and Atsumi T.
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Journal Title
Rheumatology
Volume: 55
Pages: 1117-1126
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2.2016
Author(s)
Hayashi M, Maehara K, Harada A, Semba Y, Kudo K, Takahashi H, Oki S, Meno C, Ichiyanagi K, Akashi K, Ohkawa Y.
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Journal Title
J. Cell. Biochem.
Volume: 117
Pages: 780-792
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The novel heart-specific RING finger protein 207 is involved in energy metabolism in cardiomyocytes2016
Author(s)
Mizushima W, Takahashi H, Watanabe M, Kinugawa S, Matsushima S, Takada S, Yokota T, Furihata T, Matsumoto J, Tsuda M, Chiba I, Nagashima S, Yanagi S, Matsumoto M, Nakayama K, Tsutsui H, Hatakeyama S
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Journal Title
J. Mol. Cell. Cardiol.
Volume: 100
Pages: 43-53
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 樹状細胞へ運命決定された早期前駆細胞の発見2017
Author(s)
川瀬 航, 黒滝 大翼, 中林 潤, Herbert C.Morse III, Keiko Ozato, 鈴木 穣, 田村 智彦
Organizer
冬の若手ワークショップ2017
Place of Presentation
一宮シーサイドオーツカ(千葉県一宮町)
Year and Date
2017-01-30
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[Presentation] A critical link between Lyn-mediated suppression of the TLR-MyD88-IRF5 pathway and the development of SLE-like disease2016
Author(s)
Ban T., Sato G.R., Nishiyama A., Akiyama A., Takasuna M., Umehara M., Suzuki S., Ichino M., Matsunaga S., Kimura A., Kimura Y., Yanai H., Miyashita S., Kuromitsu J., Tsukahara K., Yoshimatsu K., Endo I., Yamamoto T., Hirano H., Ryo A., Taniguchi T., Tamura T.
Organizer
The Annual Meeting of the American Association of Immunologists
Place of Presentation
シアトル市(アメリカ合衆国)
Year and Date
2016-05-16
Int'l Joint Research
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