核内構造体とのインタープレイによるクロマチン動構造の制御

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Dynamic chromatin structure and function
• Project/Area Number: 25116009
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 斉藤 典子 熊本大学, 発生医学研究所, 准教授 (40398235)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 原田 昌彦 東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70218642)
• Project Period (FY): 2013-06-28 – 2018-03-31
• Keywords: クロマチン動構造 / 核内構造 / 画像解析 / 核骨格 / 核内非コードRNA / siRNAスクリーニング

Outline of Annual Research Achievements

細胞核内でクロマチンは、核小体、核スペックル、核骨格など様々な構造体に囲まれて存在する。核内構造体は、遺伝子の転写、複製、損傷修復などの核内事象に関わる因子を豊富に含み、それらを周囲に供給する、RNA-タンパク質巨大複合体である。本研究では、これらの構造体が核内３次元空間でのクロマチン制御にどのように機能するか、また、疾患にどのように関わるかについて明らかにする。核内構造体とクロマチンをつなぐ因子を、核-クロマチンインターフェース（I/F）因子と位置づけて、これらの分子機能解析を行う。近年、核内に停留するタイプの非コードRNAが核内構造体の形成の鍵であることが示唆されている。本研究では、乳がんの治療抵抗性に関わる核内非コードRNAを同定し、これがRNAクラウドとよばれる新規の核内構造体を形成すること、がん細胞の増殖に必要な転写制御にかかわることを見いだした。また、核内最大の構造体である核小体に関して、その形成に関わる因子を同定するために、siRNAライブラリーを用いて、減弱することによって核小体の形態が不全となるI/F 因子を15程度、同定した。これらがクロマチン制御や遺伝子の核内配置、転写へどのように機能するかを分子解明することが可能となった。またさらに、既知のI/F因子である核内アクチン関連タンパク質の機能解析をすすめている。

Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

前年度の研究成果に基づき、また、国内外の研究状況に柔軟に対応しながら、動的クロマチンの維持や制御に関する研究を行った。まず、乳がんのホルモン治療抵抗性を再現する細胞モデルにおいて、がん細胞の増殖に必要な転写を活性化する、新規核内非コードRNA、エレノアを同定した。エレノアは安定にクロマチンに相互作用し、培養乳がん細胞および、疾患組織の核内でRNAクラウドと呼ばれる新規の核内構造体を形成することを見いだした。クロマチン内のゲノムDNA上で転写が起きることで、局所的に非コードRNAが蓄積し、それが、核内構造体の形成の種となる可能性も示唆した。
また、核内最大の構造体である核小体の形成に関わる因子を同定するために、画像解析とsiRNAライブラリーを用いたハイコンテントスクリーニングを行い、15の候補因子を同定した。機械学習を用いた画像解析により、これらの因子の減弱がひきおこす核小体の形態について定量的分類を行い、３種類に分類した。各クラスに属する因子群は共通した機能を持つ可能性が示唆された。
さらに、IF因子の一つである核内アクチンファミリーに結合するbicycle peptideのスクリーニングを行い、Arp5およびArp8に結合するbicycle peptideを単離し、詳細解析を行った。
これらの成果は、印刷中のものを含み8報の論文として発表した。一部は、所属する研究機関のホームページや報道などで、一般社会にも発信した。

Strategy for Future Research Activity

今までの研究成果をもとに、核内構造体がクロマチンの構造や機能にどのように関わっているかについて、解明をすすめる。
まず、乳がんのホルモン治療耐性（再発）に関わる非コードRNAがクロマチンをどのように制御するかについて、詳細な分子メカニズムを検証する。
また、核小体構造の形成に関わる候補因子15のうち、ノックダウンすることで顕著な細胞表現型を示すもの、疾患に関連するものを選択する。特に遺伝子の核内配置やクロマチン構造の制御に関わる可能性などについて、細胞内での分子機能を解析する。研究の過程で得られた種々の核小体形態の画像ライブラリーを用いて、遺伝子機能と核内構造体の形態の関連を探り、さらなる画像解析技術を確立する。
また、核アクチン関連タンパク質に特異的に結合するbicycle peptideを利用し、in vitroおよびin vivoの実験系を用いて機能を阻害し、それに伴う遺伝子機能や核内構造の変化を解析する。
適切な局面で、これらの一部は新学術領域内での共同研究としてもすすめる。

Research Products

• [Journal Article] A cluster of noncoding RNAs activates the ESR1 locus during breast cancer adaptation (2015)
  • Author(s): Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Fujiwara, S., Matsumori, H., Maehara, K., Ohkawa, Y., Iwase, H., Saitoh, N., and Nakao, M.
  • Journal Title: Nat. Commun. Volume: - Pages: 印刷中
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Nuclear actin activates human transcription factor genes including the OCT4 gene (2015)
  • Author(s): Yamazaki, S., Yamamoto, K., Tokunaga, M., Sakata-Sogawa, K., and Harata, M.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem. Volume: 79 Pages: 242-246
  • DOI: 10.1080/09168451.2014.972332
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] アクチンファミリーによる細胞核・クロマチンの機能構造形成 (2015)
  • Author(s): 山崎祥他、尾間由佳子、原田昌彦
  • Journal Title: ナノ学会会報 Volume: 13 Pages: 73-77
• [Journal Article] Computational image analysis of colony and nuclear morphology to evaluate human induced pluripotent stem cells (2014)
  • Author(s): Tokunaga, K., Saitoh, N., Goldberg, I. G., Sakamoto, C., Yasuda, Y., Yoshida, Y., Yamanaka, S., and Nakao, M.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 4 Pages: 6996
  • DOI: 10.1038/srep06996.
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] DNA binding properties of the actin-related protein Arp8 and its role in DNA repair (2014)
  • Author(s): Osakabe, A., Takahashi, Y., Murakami, H., Otawa, K., Tachiwana, H., Oma, Y., Hitoshi Nishijima, H., Shibahara, K., Kurumizaka, H., Harata, M.
  • Journal Title: PLoS One Volume: 9 Pages: e108354
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0108354
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] SWR1 and INO80 chromatin remodelers contribute to DNA double-strand break perinuclear anchorage site choice (2014)
  • Author(s): Horigome, C., Oma, Y., Konishi, T., Schmid, R., Marcomini, I., Hauer, M.H., Dion, V., Harata, M., and Gasser, S.M.
  • Journal Title: Mol Cell Volume: 55 Pages: 626-639
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2014.06.027
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Nuclear actin filaments recruit cofilin and actin-related protein 3, and their formation is connected with a mitotic block (2014)
  • Author(s): Kalendova, A., Kalasova, I., Yamazaki, S., Ulicna, L., Harata, M., and Hozak, P.
  • Journal Title: Histochem Cell Biol Volume: 142 Pages: 139-152
  • DOI: 10.1007/s00418-014-1243-9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Possible involvement of LKB1-AMPK signaling in non-homologous end joining (2014)
  • Author(s): Ui, A., Ogiwara, H., Nakajima, S., Kanno, S., Watanabe, R., Harata, M., Okayama, H., Harris, C.C., Yokota, J., Yasui, A., and Kohno, T.
  • Journal Title: Oncogene Volume: 33 Pages: 1640-1648
  • DOI: 10.1038/onc.2013.125
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Reorganization of damaged chromatin by the exchange of histone variant H2A.Z-2 (2014)
  • Author(s): Nishibuchi, I., Suzuki, H., Kinomura, A., Sun, J., Liu, N.A., Horikoshi, Y., Shima, H., Kusakabe, M., Harata, M., Fukagawa, T., and Tashiro, K.
  • Journal Title: Int J Radiat Oncol Biol Phys Volume: 89 Pages: 736-744
  • DOI: 10.1016/j.ijrobp.2014.03.031
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Improvement of the transformation efficiency of Sacchaaromyces cerevisiae by altering carbon sources in pre-culture (2014)
  • Author(s): Konishi, T., and Harata, M.
  • Journal Title: Biosci Biotechnol Biochem Volume: 78 Pages: 1090-1093
  • DOI: 10.1080/09168451.2014.915730
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 機械学習による細胞形態の分類と推定 (2014)
  • Author(s): 斉藤典子、坂本智代美、松森はるか、中尾光善、Ilya G. Goldberg
  • Journal Title: バイオ画像解析 手とり足とりガイド Volume: - Pages: 195-207
• [Journal Article] クロマチン構造と核異型 (2014)
  • Author(s): 安田洋子、斉藤典子、藤原沙織、Mohamed O. Abdalla、松森はるか、坂本智代美、中尾光善
  • Journal Title: 病理と臨床 Volume: 132 Pages: 789-795
• [Presentation] DNA二重鎖切断領域の核膜近傍への移動におけるSWR1およびINO80クロマチンリモデリング複合体の役割 (2015)
  • Author(s): 尾間由佳子、折原行希、小西辰紀、堀籠智洋、Susan M.GASSER、原田昌彦
  • Organizer: 日本農芸化学会2015年度大会
  • Place of Presentation: 岡山大学 （岡山県・岡山市）
  • Year and Date: 2015-03-27
• [Presentation] DNA損傷依存的姉妹染色分体間接着への核膜タンパク質の関与 (2015)
  • Author(s): 折原行希、尾間由佳子、小西辰紀、堀籠智洋、Susan M. GASSER、原田昌彦
  • Organizer: 日本農芸化学会2015年度大会
  • Place of Presentation: 岡山大学（岡山県・岡山市）
  • Year and Date: 2015-03-27
• [Presentation] Actin family proteins involved in the functional organization of chromatin and the nucleus (2015)
  • Author(s): Oma, Y., Takahashi, Y., Murakami, H., Horigome, C., Gasser, S.M., Osakabe, A., Kurumizaka, H., Harata, M.
  • Organizer: Understanding the genome III - G60 Symposium
  • Place of Presentation: Chexbres, Switzerland
  • Year and Date: 2015-03-20
• [Presentation] ハイコンテントスクリーニングによる核小体の形成と維持に関わる分子の同定 (2015)
  • Author(s): 松森はるか、徳永和明、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第3回リボソームミーティング
  • Place of Presentation: ANAホリデイ・イン リゾート宮崎（宮崎県・宮崎市）
  • Year and Date: 2015-03-17
• [Presentation] アクチンファミリーArp5, Arp8によるINO80クロマチンリモデリング複合体の機能制御 (2015)
  • Author(s): 村上寛和、高橋裕一朗、越阪部晃永、西嶋仁、柴原慶一、胡桃坂仁志、原田昌彦
  • Organizer: 冬の若手ワークショップ2015＠伊香保
  • Place of Presentation: ホテル松本楼（群馬県・渋川伊香保町）
  • Year and Date: 2015-02-06
• [Presentation] Multiple non-coding RNAs Eleanors, create a large active chromatin domain of the ESR1 locus during breast cancer cell adaptation (2014)
  • Author(s): Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Fujiwara, S and Nakao, M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-19
• [Presentation] Identification of regulators for the nucleolar formation by high-content siRNA screening (2014)
  • Author(s): Matsumori, H., Tokunaga, K., Nakao, M., Saitoh N.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-19
• [Presentation] Non-coding RNAs from nearby the ESR1 locus may function as a chromatin regulator in breast cancer cell adaptation to estrogen deprivation (2014)
  • Author(s): Fujiwara, S., Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Iwase, H., and Nakao, M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-18
• [Presentation] Evaluation of the nuclear shapes in human cancer tissue (2014)
  • Author(s): Yasuda, Y., Tokunaga, K., Sakamoto, C., Saitoh, N., and Nakao M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Kumamoto, Japan
  • Year and Date: 2014-12-18
• [Presentation] Role of actin family proteins in the functional organization of chromatin and the nucleus (2014)
  • Author(s): Yamazaki, S., Yamamoto, K., Oma, Y., Hozak, P., Gasser, S. and Harata, M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-18
• [Presentation] Involvement of nuclear filamentous-actin in the regulation of transcription (2014)
  • Author(s): Yamazaki, S., Yamamoto, K., Sakata-Sogawa, K., Tokunaga, M. and Harata, M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-18
• [Presentation] Behavior of nuclear actin in cell differentiation (2014)
  • Author(s): Yamamoto, K., Yamazaki, S., Sakata-Sogawa, K., Tokunaga, M. and Harata, M.
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: Hiroshima, Japan
  • Year and Date: 2014-12-18
• [Presentation] ESR1遺伝子座近傍のnon-coding RNAは乳がん細胞のエストロゲン枯渇耐性獲得に関連している (2014)
  • Author(s): 藤原沙織.、斉藤典子、冨田さおり、モハメド・オサマ・アブダラ、岩瀬弘敬、中尾光善
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] 核内アクチンフィラメントの転写制御への関与とその分子機構の解析 (2014)
  • Author(s): 山崎祥他、山本浩志、十川久美子、徳永万喜洋、原田昌彦
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] ハイコンテントスクリーニングと類似度解析による核小体形成メカニズムの解明 (2014)
  • Author(s): 松森はるか、徳永和明、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] 腫瘍組織における細胞形態の数量的解析 (2014)
  • Author(s): 安田洋子、徳永和明、坂本智代美、斉藤典子、中尾光善
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会 合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] 遺伝子欠損細胞を用いたヒストンバリアントH2A.Zのドメイン機能解析 (2014)
  • Author(s): 奥裕之、日下部将之、胡桃坂仁志、原田昌彦
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] H2A.Zのアセチル化修飾によるゲノム制御機構解析 (2014)
  • Author(s): 日下部将之、奥裕之、堀哲也、深川竜郎、胡桃坂仁志、原田昌彦
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合同開催
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル（広島県・廿日市市）
  • Year and Date: 2014-12-16
• [Presentation] Roles of nuclear filamentous-actin in transcriptional regulation (2014)
  • Author(s): Yamazaki, S., Yamamoto, K., Sakata-Sogawa, K., Tokunaga, M. and Harata M.
  • Organizer: The 2014 ASCB/IFCB Meeting
  • Place of Presentation: Philadelphia, USA
  • Year and Date: 2014-12-07
• [Presentation] Nucleocytoplasmic relocation of actin in cell differentiation (2014)
  • Author(s): Yamamoto, K., Yamazaki, S., Sakata-Sogawa, K., Tokunaga, M. and Harata, M.
  • Organizer: The 2014 ASCB/IFCB Meeting
  • Place of Presentation: Philadelphia, USA
  • Year and Date: 2014-12-07
• [Presentation] Nuclear actin and ARPs involved in the functional organization of chromatin (2014)
  • Author(s): Harata, M.
  • Organizer: The 2014 ASCB/IFCB Meeting
  • Place of Presentation: Philadelphia, USA
  • Year and Date: 2014-12-06
  • Invited
• [Presentation] 乳がん細胞における非コードRNAクラウドを介したESR1 遺伝子座の活性化 (2014)
  • Author(s): 斉藤典子、冨田さおり、モハメド・オサマ・アブダラ、藤原沙織、松森はるか、中尾光善
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-27
• [Presentation] 乳がん細胞のエストロゲン枯渇耐性獲得におけるESR1クロマチンドメイン由来non-coding RNAの解析 (2014)
  • Author(s): 藤原沙織、斉藤典子、冨田さおり、モハメド・オサマ・アブダラ、岩瀬弘敬、中尾光善
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-27
• [Presentation] アクチンファミリータンパク質Arp5およびArp8によるヒトINO80クロマチンリモデリング複合体の機能制御 遺伝子破壊細胞とbicyclic peptidesを用いた解析 (2014)
  • Author(s): 高橋 裕一朗、村上寛和、加藤 恭丈、Andrey Brydum、Davide Bertold、Raphael Gubeli、西嶋 仁、柴原 慶一、五十嵐 和彦、Christian Heinis、原田 昌彦
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-27
• [Presentation] ハイコンテントスクリーニングによる核小体制御因子の同定とその分子機構の解明 (2014)
  • Author(s): 松森はるか、徳永和明、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-26
• [Presentation] DNA二本鎖切断の核膜結合部位決定におけるクロマチン再構成の役割 (2014)
  • Author(s): 堀籠智洋、尾間由佳子、小西辰紀、Roger Schmid、Isabella Marcomini、Michael Hauer、Vincent Dion、原田昌彦、Susan M. Gasser
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-26
• [Presentation] 癌組織における細胞形態の定量的解析 (2014)
  • Author(s): 安田洋子、徳永和明、坂本智代美、斉藤典子、中尾光善
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-26
• [Presentation] DNA損傷修復におけるアクチンファミリーArp8の機能解析 (2014)
  • Author(s): 村上寛和、高橋裕一朗、越阪部晃永、西嶋仁、柴原慶一、胡桃坂仁志、原田昌彦
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-26
• [Presentation] Analysis of Long Range Chromatin Interactions of the ESR1 Locus in Endocrine Therapy Resistant Breast Cancer Cells (2014)
  • Author(s): Abdalla, M. O. A, Saitoh, N., Tomita, S., Fujiwara, S., Maehara, K., Ohkawa, Y., and Nakao, M.
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2014-11-25
• [Presentation] Roles of actin family proteins in chromatin and nuclear organizaion for DNA repair (2014)
  • Author(s): Oma, Y., Takahashi, Y., Murakami, H., Horigome, C., Gasser, S., Osakabe, A., Kurumizaka, H. and Harata, M.
  • Organizer: The 9th 3R symposium
  • Place of Presentation: Shizuoka, Japan
  • Year and Date: 2014-11-19
• [Presentation] The ESR1 gene activation is mediated by novel non-coding RNAs Eleanors in breast cancer cell adaptation (2014)
  • Author(s): Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Fujiwara, S., and Nakao, M.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conferences, RNA Biology
  • Place of Presentation: Suzhou, China
  • Year and Date: 2014-11-13
• [Presentation] Non-coding RNAs from ESR1 chromatin domain are involved in breast cancer adaptation to estrogen deprivation (2014)
  • Author(s): Fujiwara, S., Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Iwase, H., and Nakao, M.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conferences, RNA Biology
  • Place of Presentation: Suzhou, China
  • Year and Date: 2014-11-11
• [Presentation] ヒストンバリアントH2A.ZとINO80クロマチンリモデリング複合体によるクロマチン機能制御 (2014)
  • Author(s): 原田昌彦
  • Organizer: 平成26年度遺伝研研究会
  • Place of Presentation: 国立遺伝学研究所（静岡県・三島市）
  • Year and Date: 2014-10-30
  • Invited
• [Presentation] アクチンファミリーによる細胞核とクロマチンの機能構造制御 (2014)
  • Author(s): 原田昌彦
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2014-10-18
  • Invited
• [Presentation] 遺伝子欠損細胞を用いたヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの機能解析 (2014)
  • Author(s): 日下部将之、松田涼、奥裕之、堀哲也、深川竜郎、胡桃坂仁志、原田昌彦
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2014-10-17
• [Presentation] 核内アクチンダイナミクスの制御機構と機能 (2014)
  • Author(s): 山崎祥他、十川久美子、徳永万喜洋、原田昌彦
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2014-10-16
• [Presentation] 細胞分化における核内アクチンの機能解析 (2014)
  • Author(s): 山本浩志、山崎祥他、十川久美子、徳永万喜洋、原田昌彦
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2014-10-16
• [Presentation] 機械学習を用いた細胞核形態の定量化と細胞状態の評価 (2014)
  • Author(s): 斉藤典子、徳永和明、松森はるか、 安田洋子、Ilya G Goldberg、中尾光善
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2014-10-15
  • Invited
• [Presentation] アクチンファミリーによる細胞核・クロマチンの機能構造形成 (2014)
  • Author(s): 原田昌彦
  • Organizer: 分子科学研究所研究会「細胞核内反応の分子科学」
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（愛知県・岡崎市）
  • Year and Date: 2014-09-27
  • Invited
• [Presentation] Non-coding RNAs from ESR1 chromatin domain are involved in breast cancer adaptation to estrogen deprivation (2014)
  • Author(s): Fujiwara, S., Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., Iwase, H., and Nakao, M.
  • Organizer: KEY Forum:From Stem Cells to Organs
  • Place of Presentation: Kumamoto, Japan
  • Year and Date: 2014-09-04
• [Presentation] Analysis of Long Range Chromatin Interactions of the ESR1 Locus in Breast Cancer Under Estrogen Deprivation (2014)
  • Author(s): Abdalla, M. O. A., Saitoh, N., Tomita, S., and Nakao, M.
  • Organizer: Key forum: From Stem Cells to Organs
  • Place of Presentation: Kumamoto, Japan
  • Year and Date: 2014-09-04
• [Presentation] DNA二本鎖切断部位の核内配置におけるクロマチン構造変換複合体の役割 (2014)
  • Author(s): 尾間由佳子、小西辰則、堀籠智洋、折原行希、Susan Gasser、原田昌彦
  • Organizer: 酵母遺伝学フォーラム第47回研究報告会
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂 （東京都・文京区弥生）
  • Year and Date: 2014-09-01
• [Presentation] Novel non-coding RNAs Eleanors, activate the ESR1 locus during breast cancer cell adaptation (2014)
  • Author(s): Saitoh, N., Tomita, S., Abdalla, M. O. A., and Nakao, M.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting: Nuclear Organization and Function
  • Place of Presentation: Cold Spring Harbor, NY, USA
  • Year and Date: 2014-08-21
• [Presentation] High-content RNAi screening for regulators for the nucleolus (2014)
  • Author(s): Matsumori, H., Tokunaga, K., Nakao, M., and Saitoh N.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting: Nuclear Organization and Function
  • Place of Presentation: Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
  • Year and Date: 2014-08-21
• [Presentation] 転写制御におけるヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの機能解析 (2014)
  • Author(s): 日下部将之、松田涼、北村大志、堀哲也、深川竜郎、原田昌彦
  • Organizer: 平成26年度日本薬学会東北支部会
  • Place of Presentation: 東北薬科大学（宮城県・仙台）
  • Year and Date: 2014-07-19
• [Presentation] ER陽性乳がん細胞のエストロゲン枯渇下における遺伝子変化の解析 (2014)
  • Author(s): 藤原沙織、斉藤典子、冨田さおり、モハメド・オサマ・アブダラ、岩瀬弘敬、中尾光善
  • Organizer: 第22回日本乳癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場（大阪府・大阪市）
  • Year and Date: 2014-07-10
• [Presentation] 核内構造体の形成機序と機能 (2014)
  • Author(s): 斉藤典子、松森はるか、モハメド・オサマ・アブダラ、藤原沙織、安田洋子、中尾光善
  • Organizer: 第66回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 新公会堂（奈良県・奈良市）
  • Year and Date: 2014-06-11
  • Invited
• [Presentation] 細胞核形態画像と機械学習を用いた細胞状態の評価 (2014)
  • Author(s): 斉藤典子、松森はるか、安田洋子、坂本智代美、Ilya G Goldberg、中尾光善
  • Organizer: バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2014
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（愛知県・岡崎市）
  • Year and Date: 2014-06-09
• [Presentation] 癌組織における細胞形態の定量的解析 (2014)
  • Author(s): 安田洋子、徳永和明、坂本智代美、斉藤典子、中尾光善
  • Organizer: バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2014
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター (愛知県・岡崎市）
  • Year and Date: 2014-06-09
• [Presentation] Analysis of function of H2A.Z isoforms by using gene knockout cells (2014)
  • Author(s): Kusakabe, M., Matsuda, R., Oku, H., Hori, T., Fukagawa, T., Horikoshi, N., Kurumizaka, H. and Harata., M.
  • Organizer: The EMBO workshop on Histone Variants in 2014
  • Place of Presentation: Strasbourg, France
  • Year and Date: 2014-06-02
• [Remarks] 熊本大学発生医学研究所
  • URL: http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/