1993 Fiscal Year Annual Research Report

演繹データベースの手法を用いたCADシステムの高機能化に関する研究

Research Project

Project/Area Number	03452291
Research Institution	KYUSHU UNIVERSITY
Principal Investigator	牛島和夫九州大学, 工学部, 教授 (40037750)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	高木利久東京大学, 医科学研究所, 助教授 (30110836) 坂本憲広九州大学, 工学部, 助手 (00253485) 佐藤賢二九州大学, 工学部, 助手 (10215783)
Keywords	高機能データベース / 演繹データベース / CADデータ / オブジェクト指向データベース / ゲノムデータ / 演繹オブジェクト指向データベース
Research Abstract	本研究では、前年度までに、演繹データベースの手法を応用することによる、従来型のデータベースシステムの高機能化に関する研究を行ってきた。CADデータベースに対する応用については所期の目的を達することができたので、今年度は、CADデータベースよりもさらに大規模で複雑なデータを持ち、高度な解析処理要求のあるゲノムデータベースについて、演繹データベースの手法を応用し、高機能化を図った。ゲノムデータは、実験結果、生物学的知識、関連文献などの多種多様のデータが複雑に関連し合っており、関係データベースでの管理は困難であり、オブジェクト指向データベースを用いて管理することが望ましい。そこで、本研究では、演繹データベースの手法をオブジェクト指向データベースに採り入れた演繹オブジェクト指向データベースの枠組みを構築した。演繹オブジェクト指向データベースについては、理論的な研究は多いが、本研究の様にそれを実際に開発した研究はほとんどない。本研究では、クラス・アトムとメソット・タームという新しい概念を提案した。これにより、演繹データベースとオブジェクト指向データベースの統合が容易になった。さらに、演繹オブジェクト指向データベースの実用面での有効性、問題点について検討した。先ず、ゲノムをオブジェクト指向技術に基づいてモデル化し、ゲノムを表現するための80を超えるクラスを新しく作った。それらのクラスを用いて、米国のGenBankおよびGDBに集められているヒトゲノムデータ(約150MB)を演繹オブジェクト指向データベース上に実現し、評価した。その結果、演繹オブジェクト指向データベースはデータ表現および質問記述ともに高い自由度を有しており、CADデータ、ゲノムデータを始めとして、複雑なデータ構造を持ちかつ柔軟な検索処理を必要とするデータノ管理に適していることが明らかになった。

Research Products

(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] Kazuo Ushijima,et al.: "A Deductive Language in Object-Oriented Database for Genome Analysis" Proceeding of International Symposium on Next Generation Database Systems and Their Applications. 123-129 (1993)
[Publications] Norihiro Sakamoto,et al.: "Development of Overlapping Database and Application to Signal Sequence of the Human Genome" Computer Applicatons in the Biosciences. 9. 427-434 (1993)
[Publications] Kenji Saitou,et al.: "A Deductive Database System PACADE for Analyzing 3-D and Secondary Structure of Protein" Computer Applications in the Biosciences. 9. 259-266 (1993)
[Publications] Norihiro Sakamoto,et al.: "Object-Oriented Database with Rule-Based Query Interface for Genomic Computation" Proceeding of the 3rd International Symposium on Database Systems forAdvanced Applications. 65-72 (1993)
[Publications] Kenji Satou,et al.: "Similar Structure Search in a Deductive Database" Proceeding of the InternationalSymposium on Database Systems for Advanced Applications. 130-137 (1993)
[Publications] Toshihisa Takagi,et al.: "Development of an Integrated Database for Genome Mapping and Nucleotide Sequences" Proceedings of the 27th Hawaiian International Conference on System Sciences. 5. 68-76 (1994)

1993 Fiscal Year Annual Research Report

演繹データベースの手法を用いたCADシステムの高機能化に関する研究

Principal Investigator

牛島 和夫 九州大学, 工学部, 教授 (40037750)

Research Products

[Publications] Kazuo Ushijima,et al.: "A Deductive Language in Object-Oriented Database for Genome Analysis" Proceeding of International Symposium on Next Generation Database Systems and Their Applications. 123-129 (1993)

[Publications] Norihiro Sakamoto,et al.: "Development of Overlapping Database and Application to Signal Sequence of the Human Genome" Computer Applicatons in the Biosciences. 9. 427-434 (1993)

[Publications] Kenji Saitou,et al.: "A Deductive Database System PACADE for Analyzing 3-D and Secondary Structure of Protein" Computer Applications in the Biosciences. 9. 259-266 (1993)

[Publications] Norihiro Sakamoto,et al.: "Object-Oriented Database with Rule-Based Query Interface for Genomic Computation" Proceeding of the 3rd International Symposium on Database Systems forAdvanced Applications. 65-72 (1993)

[Publications] Kenji Satou,et al.: "Similar Structure Search in a Deductive Database" Proceeding of the InternationalSymposium on Database Systems for Advanced Applications. 130-137 (1993)

[Publications] Toshihisa Takagi,et al.: "Development of an Integrated Database for Genome Mapping and Nucleotide Sequences" Proceedings of the 27th Hawaiian International Conference on System Sciences. 5. 68-76 (1994)

牛島和夫九州大学, 工学部, 教授 (40037750)