1996 Fiscal Year Annual Research Report
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07680743
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Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Research Institution | Saga University |
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Principal Investigator |
野口 義夫 佐賀大学, 理工学部, 教授 (00253576)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
堂薗 浩 佐賀大学, 理工学部, 助教授 (00217613)
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| Keywords | クローン・パネル / ハイブリダイズ / クローン・ライブラリー / 塩基配列決定法 / ニューラル・ネットワーク / 遺伝的アルブリズム |
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| Research Abstract |
前年度で行った、SBH(Sequencing by Hybridization)法による塩基配列決定法の小規模モデルの、改良法として以下の手法を試みた。
1)ニューラル・ネットワークによる生物学的機能と塩基配列の対応検索。結果:生物学的機能のデータベース不足のため、有意義な結果が出なかった。来年度も使用可能なデータベースを入手し、再試行を行う。
2)SBH法で連結しない部分塩基配列を、GA(Genetic Algorithms)法で、連結可能性を探索する方法を考案したが、現在その有効性を検討中である。
(小規模モデルの概要)
イ)10-merの標的DNA。
ロ)3-mer64種の組み合わせ中、10種でハイブリダイズ。
ハ)約1000個で構成されたクローン・ライブラリー(10-merのクローン)。
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