1996 Fiscal Year Annual Research Report

二成分制御系タンパクとシグマ因子による遺伝子発現調節機構

Research Project

Project/Area Number	08454245
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	牧野耕三大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20181620)
Keywords	転写活性化因子 / PhoB / リン酸レギュロン / リン酸ボックス / RNAポリメラーゼ / σ^<70>サブユニット / DNA結合 / PCRmutagenesis
Research Abstract	"二成分制御系"とはセンサーとレギュレーターという二種類のタンパクが一対となって構成されており、外界の刺激に応答し遺伝子発現を調節する系である。大腸菌では培地中のリン酸欠乏によりにセンサー"PhoR"とレギュレーター"PhoB"に依存して転写誘導のおこる31個以上の遺伝子群があり、これらは総称してリン酸レギュロンと呼ばれている。これら遺伝子群のプロモーター領域にはレギュレーターである転写活性化因子PhoBのDNA結合認識配列であるリン酸ボックスが存在している。このリン酸レギュロンの発現を特異的に減少させるRNAポリメラーゼ変異体の分離に成功し、その変異部位がRNAポリメラーゼのσ^<70>サブユニットのhelix-turn-helix上の第一helixにあることが判明し、PhoBとの相互作用点と考えられた。また、σ^<70>サブユニットの第一helixに部位特異的変異の導入を行い、各種の変異型σ^<70>を分離精製しin vitro転写実験をおこなった結果もこの領域がPhoBとの相互作用点であることを支持した。PhoBについては、N-末端側(リン酸受容ドメイン)がC-末端側の転写活性ドメインの機能を制御していること、またC-末端側の転写活性化ドメインにはDNA結合(リン酸ボックスとの結合)とRNAポリメラーゼとの相互作用という少なくとも2つのサブドメインがあること、DNA結合モチーフはHTHでありリン酸ボックス内のTGNCA配列を認識していること等を明らかにした。さらに、PhoBとRNAポリメラーゼとの相互作用には、PhoBのHTHモチーフのTurn構造が使われていることや、PhoBがリン酸ボックスに結合するとDNAは彎曲することを明らかにした。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Makino,K.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)
[Publications] Oshima,T.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3. 211-223 (1996)
[Publications] Suzuki,M.: "Multi-helical DNA-binding domains : their structures and modes of DNA-binding" Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)
[Publications] Aiba,H.: "A 570 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 28.0-40.7 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).
[Publications] Itoh,T.: "A 460 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 40.7-50.1 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).
[Publications] Yamamoto,Y.: "A 800 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.1-68.0 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).
[Publications] 牧野耕三: "癌研究法ハンドブック" 中外医学社(in press),

1996 Fiscal Year Annual Research Report

二成分制御系タンパクとシグマ因子による遺伝子発現調節機構

Principal Investigator

牧野 耕三 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20181620)

Research Products

[Publications] Makino,K.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)

[Publications] Oshima,T.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3. 211-223 (1996)

[Publications] Suzuki,M.: "Multi-helical DNA-binding domains : their structures and modes of DNA-binding" Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)

[Publications] Aiba,H.: "A 570 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 28.0-40.7 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

[Publications] Itoh,T.: "A 460 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 40.7-50.1 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

[Publications] Yamamoto,Y.: "A 800 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.1-68.0 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

[Publications] 牧野耕三: "癌研究法ハンドブック" 中外医学社(in press),

牧野耕三大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20181620)