1998 Fiscal Year Annual Research Report
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10307011
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Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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| Research Institution | Shinshu University |
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Principal Investigator |
福島 弘文 信州大学, 医学部, 教授 (70135218)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
劉 春燕 信州大学, 医学部, 助手 (80303460)
太田 正穂 信州大学, 医学部, 講師 (50115333)
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| Keywords | PCR / 蛍光色素 / 制限酵素 / 多型 / DIS80 / DNA / RFLP / 塩基配列 |
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| Research Abstract |
DIS80の塩基配列にEcoRIIのcleavage siteがあるため、この制限酵素を用いたPCR-RFLP法とシークエンス分析からすべてのアリル(日本人集団111名)の分析を行った。その結果11種類の型が検出された。切断パターンで最大フラグメントが小さい方から順に、また48bpのフラグメントが無いものをE1からE5、48bpのフラグメントが出現するものをE6からE10、80bpのフラグメントが出現するものをE11と命名した。ホモの9サンプルのうち2サンプルは24(E4)/24(E8)のpseudohomoタイプであり、その他は18(E3)、24(E4)、27(E3)、28(E4)、31(E4)のホモタイプであった。そのpseudohomoタイプは親子間でも証明され、塩基配列からも明らかにされた。EcoRII以外にMspI、及びAvaIIのcleavage siteが存在するため、これらの酵素を用いたサブタイピングを検討したところアリル28及び30では新たな分類が可能であった。
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[Publications] K.Takayanagi et al.: "Automated Profiling of Nine STR Loci : allelo Frequencies in a Japanese population and Paternity cases" Res.Pract.Forens.Med.41. 53-56 (1998)
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[Publications] A.Arakura et al.: "Subtyping and characterization of DIS80 alleles in a Japanese population using PCR-RFLP" Int J Legal Med.111. 183-187 (1998)
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[Publications] 新倉, 明和: "DIS80のPCR-RFLP法によるサブタイピング" DNA多型. 6. 227-229 (1998)
