ヒト口腔内感染部位における偏性嫌気性グラム陽性桿菌の多様性とその病原因子

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11671798
• Research Institution: Niigata University
• Principal Investigator: 中澤 太 新潟大学, 歯学部, 助教授 (60115053)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 佐藤 尚美 新潟大学, 歯学部, 助手 (20018427) ; 星野 悦郎 新潟大学, 歯学部, 教授 (90124619) ; 奥田 一博 新潟大学, 歯学部・附属病院, 講師 (00169228) ; 吉江 弘正 新潟大学, 歯学部, 教授 (20143787)
• Keywords: 新細菌属・種 / 16S rDNA sequence / Mogibacterium timidum / Mogibacterium neglectum / Mogibacterium diversum / Mogibacterium vescum / Mogibacterium pumilum / Cryptobacterium curtum

Research Abstract

本研究の科学研究費交付申請書「本年度の研究実施計画」と対応
1:未同定株菌体や標準株から、そのDNAを抽出し各DNAのG+C含量を定量し相互に比較検討した。
2:前記のDNAを用いDNA-DNAハイブリダイゼーション法により、菌株相互のDNA-DNA相同性(%)を明らかにした。3,4:PCR法に続くアガロース電気泳動法で、各菌株の16S-rDNAを得、そのシークエンスを明らかにした。5:得られた16S-rDNAシークエンスデータと、ジーンバンクから入手出来る既報のデータを使い、未同定偏性嫌気性グラム陽性桿菌相互の系統発生学的相違を明らかにした。
上記の研究結果から、これまでの報告にはない新しい細菌種として、Cryptobacterium curtum, Mogibacterium pumilum, Mogibacterium vescum, Mogibacterium diversum, Mogibacterium neglectumを、また、従来Eubacterium timidumとされていた細菌種は、新しくMogibacterium timidumとする事の妥当性を、国際専門雑誌に報告した。更に、これらの標準株はAmericam Type Culture Collection (ATCC)へ、その16S-rDNA sequenceはジーンバンクへ、それぞれ登録を完了している。また、これらの研究成果から、各新菌種に対する特異的primerを構築し、臨床資料から、PCRによる検出を試み、その有効性を確認している。
今後は、これまで得られ研究成果を総括し、2001年3月の米国歯科研究学会(AADR)にて報告し、米国バージニア大学のDr.Moor等の関連研究者のレビューを受け、平成13年度における本研究遂行の効率化を図りたい。

Research Products

• [Publications] T.Tamura,: "Phylogenetic characterization of 16S rDNA from Pseudoramibacter alactolyticus clinical isolates."International Endodontic Journal. (発表予定). (2001)
• [Publications] S.E.POCO,JR.: "Polyphasic Characterization of Mogibacterium Species Isolated from Human Oral Cavities"Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] F.NAKAZAWA: "Diversity of Oral Asaccharolytic, Anaerobic, Gram-Positive Rods"Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] S.E.POCO,JR.: "Development of l6S rDNA-based PCR assay for detecting Mogibacterium species."Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] F.NAKAZAWA: "Proposal of novel genera for asaccharolytic, anaerobic Eubacterium species"Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] S.E.POCO,JR.: "PCR detection of Mogibacterium from subgingival plaque of humans."Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] M.Sato,: "Isolation of So-called 'Jodococcus (Miller) from dental plaque"Journal of Dental Research. (発表予定). (2001)
• [Publications] 佐藤尚美: "Eubacterium saburreum T15多糖質抗原の2次元NMRによる構造解析"日本細菌学会雑誌. (発表予定). (2001)
• [Publications] Futoshi Nakazawa: "Description of Mogibacterium pumilum gen.nov.,sp.nov.and Mogibacterium vescum gen.nov.,sp.nov.and reclassification of Eubacterium timidum (Holdeman et al.1980) as Mogibacterium timidum gen.nov.,comb.nov."International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50・2. 649-688 (2000)
• [Publications] 中澤太: "口腔由来の糖非分解性偏性嫌気性グラム陽性桿菌とその新しい分類"新潟歯学会誌. 30・1. 71-73 (2000)
• [Publications] Tsuyoshi Hashimura: "Phylogenetic analysis of 16S rDNA of Eubacterium exiguum and the species-specific region for primer designation."Japanese Journal of Oral Biology. 42・6. 555-562 (2000)
• [Publications] F.NAKAZAWA: "Taxonomic characterization of Novel Asaccharolytic Gram-positive Rods from Human Oral Cavities."Journal of Dental Research. 79. 395 (2000)
• [Publications] 田村貴彦: "う蝕象牙質、歯周ポケットから高頻度に検出されるPseudoramibacter alactolyticus の遺伝学的多様性"日本歯科保存学会雑誌. 43. 79 (2000)
• [Publications] S.E.POCO,JR.: "Proposal of Mogibacterium diversum sp.nov.and Mogibacterium neglectum sp.nov.,Novel Asaccharolytic Anaerobic Gram-Positive Rods from Oral Cavities."Japan Journal of Oral Biology. 42. 169 (2000)
• [Publications] Futoshi Nakazawa: "Cryptobacterium curtum gen.nov.,sp.nov.,a New Genus of Gram-positive Anaerobic Rod Isolated from Human Oral Cavities"International Journal of Systematic Bacteriology. 49. 1193-1200 (1999)
• [Publications] F.NAKAZAWA: "Proposal of Mogibacterium pumilum and M.vescum gen.nov.,sp.nov."Journal of Dental Research. 78. 419 (1999)
• [Publications] 中澤太: "新しい糖非分解性グラム陽性桿菌のl6S-rDNA sequence解析"歯科基礎医学会雑誌. 41. 404 (1999)
• [Publications] Salam,A.,: "Eubacterium saphenum and the cytokine productions by γ δ T cells in mice"新潟歯学会雑誌. 29・2. 89 (1999)
• [Publications] 田村貴彦: "Pseudoramibacter alactolyticusにおける遺伝学的多様性"新潟歯学会雑誌. 29・2. 88-89 (1999)
• [Publications] 橋村剛志: "Eubacterium exiguum 16S rDNA sequence解析とPCR法による歯内病巣からの検出"新潟歯学会雑誌. 29・2. 89 (1999)