2001 Fiscal Year Annual Research Report
自己免疫性甲状腺疾患(橋本病)の疾患感受性遺伝子の同定とその機能解析
Project/Area Number |
12307056
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Research Institution | Research Institute, International Medical Center of Japan |
Principal Investigator |
白澤 専二 国立国際医療センター, 研究所, 部長 (10253535)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山本 健 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教授 (60274528)
原田 晴仁 国立国際医療センター, 研究所, 室長 (00271429)
笹月 健彦 国立国際医療センター, 研究所, 所長 (50014121)
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Keywords | 自己免疫性甲状腺疾患 / 疾患感受性遺伝子 / Graves病 / 橋本病 / 連鎖解析 / 罹患同胞対法 / マイクロサテライトマーカー / SNP |
Research Abstract |
本研究では自己免疫性甲状腺疾患であるGrave病(GD)および橋本病(HT)の疾患感受性遺伝子を同定し、自己免疫疾患発症の分子機構を解明することを目的としている。AITDの疾患感受性遺伝子同定のための第1段階として、約400個のマイクロサテライトマーカーを用いた全ゲノムスキャンを、AITDの罹患同胞対を対象として行い、これまでに合計14個の染色体の19個の領域にMLS>1(連鎖の可能性が示唆される)となる領域を検出した。その内、本年度は、8番染色体長腕の8q23-q24領域を中心に解析を進めた。罹患同胞対法では疾患遺伝子座を狭小化することはできないので、患者対照群による相関解析によりnarrow downすることが必要となる。8q23-q24領域の約21Mbについて、ドラフトシークエンスをもとにマイクロサテライトマーカーを検出し、最終的に多型性を示した330個のマイクロサテライトマーカーにより橋本病103例、対照群288例を対象として、アリルによる相関解析を行った。その結果、約30個のマーカーがP<0.05を示したが、あるcontigに存在するマーカーのアリルにおいて非常に強い相関を示した。そのアリル頻度は対照群で9.9%、HTで24.4%、P=10^<-5>、オッズ比=2.9(95%CI:1.8-4.8)であった。更にこのマーカーの存在する近傍約400kbにおいて、データベース上より、SNPを抽出し、最終的に36個のSNPsを用いて、相関解析を行った。4つのSNPs(40-2,23-3,21-6,21-2)で非常に強い相関を示し、さらにこれらのSNPsは連鎖不平衡にあることが判明した。これらの結果は、疾患感受性遺伝子がこの連鎖不平衡を示す約50kbの領域に存在することを示唆するものと考えられる。現在は、この約50kb領域に存在する遺伝子の同定とその構造解析を行っている。
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[Publications] Shirasawa S et al.: "The impact of oncogenes on tumor maintenance"Oncongene-Directed Therapies. (in press). (2002)
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[Publications] Morishima Y et al.: "The clinical significance of HLA allele compatibility in patients transplanted with marrow from a serologically HLA-A, B and DR matched unrelated donor"Blood. (in press). (2002)
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[Publications] Habets G.G et al.: "cDNA array analyses of K-ras-induced gene transcription"Methods Enzymology. 332. 245-260 (2001)
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[Publications] Qian Y et al.: "Formation of brainstem (nor)adrenergic centers and first-order relay visceral sensory neurons is dependent on homeodomain protein Rnx/Tlx3"Genes and Development. 15. 2533-2545 (2001)
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[Publications] Sakai K, et al.: "Identification of susceptibility loci for autoimmune thyroid disease to 5q31-q33 and Hashimoto's thyroiditis to 8q23-q24 by multipoint affected sib-pair linkage analysis in Japanese"Human Molecular Genetics. 10. 1379-1386 (2001)
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[Publications] Miyoshi Y et al.: "A novel autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA16) linked to chromosome 8q22.1-24.1."Neurology. 57. 96-100 (2001)
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[Publications] Wataya M et al.: "Comparative analysis of HLA restriction and cytokine production in hepatitis B surface antigen-specific T cells from low-and high-antibody responders in vaccinated humans"Journal of Human Genetics. 46・4. 197-206 (2001)
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[Publications] Ono T et al.: "Organ-specific autoimmunity in mice whose T cell repertoire is shaped by a single antigenic peptide"Journal of Clinical Investigation. 108. 1589-1596 (2001)
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[Publications] Fukui Y et al.: "Haematopoietic cell-specific CDM family protein DOCK2 is essential for lymphocyte migration"Nature. 412. 826-831 (2001)
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[Publications] Wataya H et al.: "Quantitation of HLA-A^*0201 bound tumor associated antigens on a peptide pulsed B cell line"Human Immunology. 62. 125-132 (2001)
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[Publications] Tsuneizumi M et al.: "Overexpression of the EBAG9 gene at 8q23 associated with early-stage breast cancers"Clinical Cancer Research. 7. 3526-3532 (2001)
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[Publications] Harada H et al.: "Molecular cloning, tissue expression, and chromosomal assignment of a novel gene encoding a subunit of the human signal-recognition particle"Journal of Human Genetics. 46. 70-75 (2001)
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[Publications] Harada H et al.: "Identification of DMC1, a novel gene in the TOC region on 17q25.1 that shows loss of expression in multiple human cancers"Journal of Human Genetics. 46. 90-95 (2001)