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2004 Fiscal Year Annual Research Report

プロテオミクスを基盤とした植物分子育種

Research Project

Project/Area Number 13GS0023
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

島本 功  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (10263427)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高山 誠司  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教授 (70273836)
小泉 望  奈良先端科学技術大学院大学, 遺伝子教育研究センター, 助教授 (20252835)
明石 欣也  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手 (20314544)
森川 弘道  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (00089129)
平野 久  横浜市立大学, 木原生物学研究所・大学院総合理学研究科, 教授 (00275075)
Keywords植物 / ゲノム / プロテオミクス / ストレス / 分子育種 / イネ / 信号伝達 / タンパク質相互作用
Research Abstract

耐病性反応において働く低分子量Gタンパク質OsRac1の下流で機能すると考えられるタンパク質を、2次元電気泳動を用いたdifferential display法により、LC/MS/MSにより約200個同定した。免疫沈降により得たOsRac1を形成する複合体の構成タンパク質を解析し新規なタンパク質を同定した。さらに、OsRac1 affinity chromatographyによりOsRac1のエフェクター候補を多数同定した。
蛋白質を二次元電気泳動で分離し、NHSエステルで化学修飾したダイヤモンド様炭素被膜処理基板にブロットして多数の蛋白質を固定化したプロテインチップを作製した。このチップを用いてコムギ種子蛋白質間の相互作用を解析する実験を行った。タンデムアフィニティー精製や免疫沈殿法によって蛋白質複合体を精製して蛋白質間相互作用を解析する系を確立する研究を行った。
アブラナ科植物の自家不和合性反応におけるSRK受容体キナーゼ下流のリン酸化カスケードの解明を目的としている。本年度は、SRKの活性化機構を解明する目的で、大腸菌発現SRK融合タンパク質のリン酸化部位を解析し、5カ所のリン酸化セリン・スレオニン残基を同定した。
二酸化窒素(4ppm)を含むまたは含まない大気中、自然光下で栽培(4週間)したシロイヌナズナのシュートおよび根からタンパク質を抽出し、二次元ゲル電気泳動法でタンパク質スポット(蛍光染色)を分離、ゲル内消後peptide mass finger printing法により、タンパク質の同定を図った。その結果、シュートでは、約1000個のタンパク質スポットのうち、50-100個が、二酸化窒素曝露により、シグナルが減少または増加した。これまでに、半数以上のタンパク質が同定された。

  • Research Products

    (22 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (21 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Proteome analysis of programmed cell death and defense signaling using the rice lesion mimic mutant cdr 2.2005

    • Author(s)
      H.Tsunezuka
    • Journal Title

      Mol.Plant Microbe Interact. 18

      Pages: 52-59

  • [Journal Article] The role of glycosylation in the function of a 48-kDa glycoprotein from carrot.2005

    • Author(s)
      C.Shang
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 328

      Pages: 144-149

  • [Journal Article] Self-incompatibility in plants. Annu. Rev.2005

    • Author(s)
      S.Takayama
    • Journal Title

      Plant Biol. 56

      Pages: 467-489

  • [Journal Article] Conversion of functional specificity in Qb-SNARE VTI1 homologues of Arabidopsis.2005

    • Author(s)
      M.Niihama
    • Journal Title

      Current Biology (in press)

  • [Journal Article] Sugar responsible and tissue specific expression of a gene encoding AtCIPK14, an Arabidopsis CBL-interacting protein kinase.2005

    • Author(s)
      EJ.Lee
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem. 69

      Pages: 242-245

  • [Journal Article] Unfolded protein response followed by induction of cell death in cultured tobacco cells treated with tunicamycin.2005

    • Author(s)
      Y.Iwata
    • Journal Title

      Planta. 220

      Pages: 804-807

  • [Journal Article] An Arabidopsis transcription factor, AtbZIP60, regulates the endoplasmic reticulum stress response in a manner unique to plants.2005

    • Author(s)
      Y.Iwata
    • Journal Title

      PNAS (in press)

  • [Journal Article] Downregulation of metallothionein, a reactive oxygen scavenger, by the small GTPase OsRac1 in rice.2004

    • Author(s)
      H-L.Wong
    • Journal Title

      Plant Physiol. 135

      Pages: 1447-1456

  • [Journal Article] An E2F regulated reporter construct is transcriptionally activated following the transient expression of cyclin D in plants.2004

    • Author(s)
      K.Kawamura
    • Journal Title

      Plant Biotech. 21

      Pages: 289-293

  • [Journal Article] Interaction of a 43-kDa receptor-like protein with a 4-kDa hormone-like peptide in soybean.2004

    • Author(s)
      K.Hanada
    • Journal Title

      Biochemistry 43

      Pages: 12105-12112

  • [Journal Article] Protein extraction from mature rice leaves for two-dimensional gel electrophoresis and its application in proteome analysis.2004

    • Author(s)
      N.Islam
    • Journal Title

      Proteomics 4

      Pages: 1903-1908

  • [Journal Article] Identification of three phosphorylation sites of alpha 7 subunit in yeast 20S proteasome in vivo using mass spectrometry.2004

    • Author(s)
      Y.Iwafune
    • Journal Title

      Arch.Biochem.Biophys. 431

      Pages: 9-15

  • [Journal Article] Changes of protein profiles during pollen development in Lilium longiflorum.2004

    • Author(s)
      H.Miki
    • Journal Title

      Sex Plant Reprod. 16

      Pages: 209-214

  • [Journal Article] Mass spectrometric analysis of posttranslational modifications of a carrot extracellular glycoprotein.2004

    • Author(s)
      C.Shang
    • Journal Title

      Biochemistry 43

      Pages: 6281-6292

  • [Journal Article] Mass spectrometric analysis of expression of ATPase Subunits encoded by duplicated genes in the 19S regulatory particle of rice 26S proteasome.2004

    • Author(s)
      T.Shibahara
    • Journal Title

      Arch.Biochem.Biophys. 421

      Pages: 34-41

  • [Journal Article] Technical aspects of functional proteomics in plants.2004

    • Author(s)
      H.Hirano
    • Journal Title

      Phytochemistry. 65

      Pages: 1487-1498

  • [Journal Article] Potent hydroxyl radical-scavenging activity of drought-inducedtype-2 metallothionein in wild watermelon.2004

    • Author(s)
      K.Akashi
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 323

      Pages: 72-78

  • [Journal Article] Gravity sensing and signaling.2004

    • Author(s)
      M.Morita
    • Journal Title

      Current Opinion in Plant Biology 7/6

      Pages: 712-718

  • [Journal Article] Formation of unidentified nitrogen in plants : an implication for a novel nitrogen metabolism.2004

    • Author(s)
      H.Morikawa
    • Journal Title

      Planta 219

      Pages: 14-22

  • [Journal Article] Three distinct Arabidopsis hemoglobins exhibit peroxidase-like activity and differentially mediate nitrite-dependent protein nitration.2004

    • Author(s)
      A.Sakamoto
    • Journal Title

      FEBS Lett. 572

      Pages: 27-32

  • [Journal Article] Transcriptional activation of tobacco E2F is repressed by co-transfection with the retinoblastoma-related protein ; cyclin D expression overcomes this repressor activity.

    • Author(s)
      K.Uemukai
    • Journal Title

      Plant Mol.Biol. (in press)

  • [Book] 新版 分子レベルからみた植物の耐病性-ポストゲノム時代の植物免疫研究2004

    • Author(s)
      島本 功ら編
    • Publisher
      秀潤社

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Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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