2002 Fiscal Year Annual Research Report
全ゲノム連鎖解析による小児気管支喘息・アトピー関連遺伝子の同定
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14570721
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| Research Institution | Tsukuba College of Technology |
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Principal Investigator |
柴崎 正修 筑波技術短期大学, 鍼灸学科, 教授 (30049233)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
有波 忠雄 筑波技大学, 基礎医学系, 助教授 (10212648)
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| Keywords | 全ゲノム解析 / 気管支喘息 / アトピー / 遺伝子 / 遺伝子変質 / DNA / 多型 / 遺伝子多型 |
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| Research Abstract |
日本人喘息の全ゲノム解析で連鎖が証明された4q35、5q31-q33領域の候補遺伝子haematopoietic prostaglandin D synthase(HPGDS)、serine protease inhibitor, Kazal type, 5(SPINK5)、Interleukin 12B(IL12B)、hepatitis A virus cellular receptor 1(HAVCR1)の遺伝子多型とアレルギー疾患との関連解析を行い以下の成績を得た。HPGDSにはIVS+11A/C多型が検出された。TDT解析で11Aアリルが喘息患者に有意に多く伝達されていた。SPINKS5にはAsp106Asn、Asn368Ser、Asp368Asn、Glu420Lyn、Glu825Aspの5種の多型が検出された。それぞれの多型のTDT解析をアトピー性皮膚炎で検索した。p値は0.39、0.0046、0.1、0.009、0.64であり、Asp368SerとGlu420Lys多型が有意に高い伝達率を示した。IL12Bには226Ser/Asnと1188A/Cの多型が検出された。喘息におけるTDT解析ではそれぞれのp値は0.45と0.92、カモガヤ花粉症では0.26と0.85であり、伝達不平衡を示唆する証拠は得られなかった。HAVCRには、-1634A/G、-1606A/C、-1547G/C、-1453G/A、exon4ins/del、IVS9+9G/Aの6箇所に多型が検出された。喘息患者でのTDT解析のp値は0.47、1、0.79、0.79、>0.1、0.35であり、伝達不平衡を示す結果は得られなかった。
HPGD2多型が気道過敏性の個体差に影響を与えている可能性を示唆した。SPINKS5のASP368SerとGlu420Lys変異がアトピー性皮膚炎に影響を与えている可能性が示唆された。
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[Publications] Noguchi E, Shibasaki M et al.: "The promoter polymorphism in the eosinophil cationic protein gene and its influence on the serum eosinophil cationic protein level"Am J Respir Crit Care Med. 167. 180-4 (2003)
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[Publications] Noguchi E, Shibasaki M et al.: "Association between TNFA polymorphism and the development of asthma in the Japanese population"Am J Respir Crit Care Med. 166. 45-46 (2002)
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[Publications] Ito S, Noguchi E, Shibasaki M et al.: "Association between plasma platelet-activating factor acetylhydrolase deficiency and increased risk of childhood atopic asthma"J.Human Genet. 47. 99-102 (2002)
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[Publications] Yokouchi Y, Shibasaki M et al.: "A genome-wide linkage analysis of orchard grass-sensitive childhood seasonalal lergic rhinitis"Genes Immun.. 3. 9-13 (2002)
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[Publications] Noguchi E, Shibasaki M et al.: "polymorphisms of haematopoietic prostaglandin D synthase and human prostanoid DP receptor genes"Clin Exp Allergy. 32(1). 93-96 (2002)
