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2004 Fiscal Year Annual Research Report

爬虫類と鳥類におけるゲノム構造進化に関する分子細胞遺伝学的研究

Research Project

Project/Area Number 15370001
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

松田 洋一  北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 教授 (70165835)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 梅原 千鶴子  北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 助手 (80291227)
阿形 清和  理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, プロジェクトリーダー (70167831)
Keywords鳥類 / 爬虫類 / ワニ / ESTクローン / FISH / 比較染色体地図 / 染色体相同性
Research Abstract

爬虫類のカメ類やヘビ・トカゲ類では鳥類と同様にマイクロ染色体が存在し,本研究で用いているスッポンとシマヘビではZZ/ZW型の性染色体の分化がみられる。一方、ワニは系統進化学的に最も鳥類に近縁であるにもかかわらず、マイクロ染色体をもたず性染色体の分化もみられない。そこで、今年度は、ワニとニワトリ間の染色体の相同性とマイクロ染色体染色体の消失の過程を明らかにする目的で、ヒト-シャムワニ-ニワトリ間の比較染色体地図の作製を試みた。まず、シャムワニの脳からcDNAライブラリーを作製し、4,948個のnon redundant cDNAクローンを単離して部分配列を決定した。次に、得られたESTクローンについてblastxを用いて相同性検索を行い、49個のヒトオーソログ遺伝子のワニホモログを同定した。そして、ダイレクトR-バンドFISH法を用いて45個の機能遺伝子をワニ染色体上にマッピングすることに成功した。45遺伝子中35遺伝子は5対の大型染色体に、残りの10個は10対の小型染色体上にマップされた。現在、これらの結果に基づいて詳細な比較染色体地図を作製中である。シャムワニ染色体地図を昨年度に本研究で作製されたスッポンとシマヘビの染色体地図と比較し、さらにそれらをヒトとニワトリの染色体地図と比較することによって、有羊膜類における核型進化の過程が明らかにできると予想される。
次に、鳥類の性染色体に対応するワニ染色体を同定する目的で、ニワトリZ連鎖遺伝子であるGHR、RPS6、ACO1、CHD1遺伝子をRT-PCR法を用いてシャムワニよりクローニングし、FISH法を用いて染色体マッピングを行った。その結果、全ての遺伝子はシャムワニの3番染色体短腕にマップされ、ニワトリZ染色体と高い相同性を有することが明らかとなった。

  • Research Products

    (5 results)

All 2004

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] A new family of satellite DNA sequences as a major component of centromeric heterochromatin in owls (Strigiformes).2004

    • Author(s)
      Yamada, K., Nishida-Umehara, C., Matsuda, Y.
    • Journal Title

      Chromosoma 112

      Pages: 277-287

  • [Journal Article] Molecular cytogenetic definition of the chicken genome : the first complete avian karyotype.2004

    • Author(s)
      Masabanda, J.S., Burt, D., Matsuda, Y.et al.
    • Journal Title

      Genetics 166

      Pages: 1367-1373

  • [Journal Article] A comparative karyological study of the blue-breasted quail (Coturnix chinensis, Phasianidae) and California quail (Callipepla californica, Odontophoridae).2004

    • Author(s)
      Shibusawa, M., Nishida-Umehara, C., Matsuda, Y.et al.
    • Journal Title

      Cytogenetic and Genome Research 106

      Pages: 82-90

  • [Journal Article] Karyotypic evolution in the Galliformes : An examination of the process of karyotypic evolution by comparison of the molecular cytogenetic findings with the molecular phylogeny.2004

    • Author(s)
      Shibusawa, M., Nishibori, M., Matsuda, Y.et al.
    • Journal Title

      Cytogenetic and Genome Research 106

      Pages: 111-119

  • [Journal Article] ゲノム構造から見た鳥類と爬虫類の系統進化2004

    • Author(s)
      松田洋一, 梅原千鶴子
    • Journal Title

      生体の科学 55

      Pages: 232-240

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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