2017 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of breast cancer tissue diversity by integration analysis of minimum unit omics
| Project/Area Number |
15H04294
|
|---|
| Research Institution | Kanazawa University |
|---|
Principal Investigator |
後藤 典子 金沢大学, がん進展制御研究所, 教授 (10251448)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
東條 有伸 東京大学, 医科学研究所, 教授 (00211681)
島村 徹平 名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授 (00623943)
岡本 康司 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (80342913)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | がん幹細胞 / 乳がん / RNAシークエンス / シングルセル |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
研究実績の概要トリプルネガティブタイプ乳がん臨床検体のうち、スフィア培養とPDXの両方がそろっている検体を使った。#69番のトリプルネガティブ乳がん細胞のストックより、がん細胞をスフェロイド培養し、Neuropilin1 (NP1)抗体で分離し、NP1を高発現する細胞群と、NP1陰性の細胞群をソーティングにより分離、国立がん研究センターに設置してあるフリューダイムC1 Single-Cell Auto Prepシステムを用いて９６wellプレートにがん細胞をシングルセルに分離し、RNAを抽出した。サンプルは、東京大学新領域創成研究科へ送り、RNAシークエンスを行い、データ解析は名古屋大学と共同で行った。
RNAシークエンス解析の結果、NP1高発現群は、NP1低発現群に比較して、細胞内遺伝子発現レベルのばらつきがより大きいことがわかった。このことを親玉がん幹細胞を頂点とするヒエラルキーにして考えてみれば、ヒエラルキーの頂点に近いほうがより均一な細胞集団が少なく、細胞相互のばらつきが大きい傾向になることが推測される。そのため、NP1高発現群は、比較的細胞間の均一性の高いNP1低発現群に比較して、ヒエラルキーの頂点に近い、言い換えれば親玉がん幹細胞に近い細胞群であるといえる。このことは予想されたことではあるが、再発見である。
さらに、もう一つの検体も同様に解析を行い、RNAシークエンス解析まで行った。こちらにおいても同様の結果を得た。
NP1高発現群には、期待通り幹細胞性に関わる遺伝子群が濃縮されていた他、神経の反発シグナルに関わる分子などが濃縮されており、興味深い分子が多々得られた。
|
| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] ntratumoral bidirectional transitions between epithelial and mesenchymal cells in triple-negative breast cancer2017
Author(s)
Yamamoto M, Sakane K, Tominaga K, Gotoh N, Niwa T, Kikuchi Y, Tada K, Goshima N, Semba K, Inoue J-I
-
Journal Title
Cancer Sci,
Volume: 108
Pages: 1210-1222
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] The RB-IL-6 axis controls self-renewal and endocrine therapy resistance by fine-tuning mitochondrial activity.2017
Author(s)
Kitajima S, Yoshida A, Kohno S, Suzuki S, Nagatani N, Li F, Nishimoto Y, Sasaki N, Muranaka H, Wan Y, Thai T, Okahashi N, Matsuda F, Shimizu H, Nishiuchi T, Suzuki Y, Tominaga K, Gotoh N, Suzuki M, Ewen M, Barbie D, Hirose O, Tanaka T, Takahashi C.
-
Journal Title
Oncogene
Volume: 26
Pages: 5145-5157
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] An autocrine/paracrine circuit of growth differentiation factor (GDF) 15 has a role for maintenance of breast cancer stem-like cells.2017
Author(s)
Sasahara A, Tominga K, Nishimura T,Yano M, Kiyokawa E, Noguchi Miki, Noguchi Masakuni, Kanauchi H, Ogawa T, Minato H, Tada K, Seto Y, Tojo A, Gotoh N.
-
Journal Title
Oncotarget,
Volume: 8
Pages: 24869-24881
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] ddiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells.2017
Author(s)
Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji E, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada K, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N.
-
Journal Title
Oncogene
Volume: 36
Pages: 1276-1286
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
