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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Comparative study of plant populations using big-data in projection matrix models

Research Project

Project/Area Number 15H04418
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

高田 壮則  北海道大学, 地球環境科学研究院, 特任教授 (80206755)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横溝 裕行  国立研究開発法人国立環境研究所, 環境リスク・健康研究センター, 主任研究員 (30550074)
深谷 肇一  統計数理研究所, データ科学研究系, 外来研究員(JSPS特別研究員) (30708798)
大原 雅  北海道大学, 地球環境科学研究院, 教授 (90194274)
金子 有子  東洋大学, 文学部, 准教授 (90280817)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords生態学 / 植物 / ビッグデータ / 推移行列モデル / 個体群統計
Outline of Annual Research Achievements

植物の生活史行列に関するデータベース(COMPADRE)を用いた研究を3件行った。前年度に準備された約7000個の植物集団の生活史行列を用いて、(1)過去の弾性度解析の検証、個体群成長率と弾性度の関係の解析を行い、(2)外来植物の個体群増加率および弾性度と導入後経過時間との関係についての解析結果を国際学術誌に公表した。また、(3)分担者所蔵の樹木の生活史行列を用いて、種子の豊凶と台風による死亡率の増加の影響を解析した。そのため、研究打ち合わせ会議を三回行なった。
「過去の弾性度解析の検証、個体群成長率と弾性度の関係の解析」においては、データベースに含まれる植物集団生活史行列の個体群成長率、弾性度を求め、植物の生活史形態(多回繁殖型・一回繁殖型植物)や生活史行列のサイズに依存して弾性度の値が大きく異なること、過去の弾性度解析の結果と類似点が見られることがわかった。弾性度の値は個体群成長率とは無相関であった。また、それらの実際の生物集団の結果と、ランダムに要素を与えた生活史行列の結果の比較を行なうことによって、突然変異の結果生じるランダム生活史行列の弾性度は現存する植物集団の弾性度の結果と大きく異なることが示された。その解析結果を国際学術誌に査読付き学術論文として発表した。
「外来植物の個体群増加率と導入からの経過時間との関係の解析」では、昨年度に得られた成果を国際学術誌に学術論文として発表した。「種子の豊凶と台風による死亡率の増加の影響の解析」では、種子の豊凶と台風の襲来が確率的に訪れる時の数理モデルを開発し、個体群増加率が最大になる豊作頻度と台風頻度を求めることに成功した。そのモデルの枠組みを用いて、台風の襲来頻度によっては、最適な種子の豊作頻度が存在することが明らかになり、樹木の最適戦略として豊凶を理解する理論的基盤を構築した。この成果については現在論文投稿を準備中である。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Oxford University(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Oxford University
  • [Int'l Joint Research] Oregon University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Oregon University
  • [Journal Article] A cautionary note on elasticity analyses in a ternary plot using randomly generated population matrices.2018

    • Author(s)
      T. Takada, Y. Kawai, R. Salguero-Gomez
    • Journal Title

      Population Ecology

      Volume: 60 Pages: -

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Skewed male reproductive success and pollen transfer in a small fragmented population of the heterodichogamous tree Machilus thunbergii2018

    • Author(s)
      Watanabe Shuntaro、Takakura Koh-Ichi、Kaneko Yuko、Noma Naohiko、Nishida Takayoshi
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 131 Pages: -

    • DOI

      10.1007/s10265-018-1018-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The influence of time since introduction on the population growth of introduced species and the consequences for management2017

    • Author(s)
      Yokomizo Hiroyuki、Takada Takenori、Fukaya Keiichi、Lambrinos John G.
    • Journal Title

      Population Ecology

      Volume: 59 Pages: 89~97

    • DOI

      10.1007/s10144-017-0581-6

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The analysis of an effect of seed propagation on defense strategy against pathogen transmission within clonal plant population using lattice model2017

    • Author(s)
      Sakai Yuma, Takada Takenori
    • Journal Title

      Journal of Theoretical Biology

      Volume: 427 Pages: 65~76

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2017.05.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reproductive biology of Clintonia udensis2017

    • Author(s)
      Yoshima Ayako、Ohara Masashi
    • Journal Title

      Plant Species Biology

      Volume: 32 Pages: 471~476

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12170

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reproductive compensation of a perennial plant Sanguisorba tenuifolia to herbivory by Phengaris teleius2017

    • Author(s)
      Uchida Yoko、Ohara Masashi
    • Journal Title

      Plant Species Biology

      Volume: 33 Pages: 51~58

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12195

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quaternary range-shift history of Japanese wingnut (Pterocarya rhoifolia) in the Japanese Archipelago evidenced from chloroplast DNA and ecological niche modeling2017

    • Author(s)
      Sugahara Kanako、Kaneko Yuko、Sakaguchi Shota、Ito Satoshi、Yamanaka Keisuke、Sakio Hitoshi、Hoshizaki Kazuhiko、Suzuki Wajirou、Yamanaka Norikazu、Isagi Yuji、Momohara Arata、Setoguchi Hiroaki
    • Journal Title

      Journal of Forest Research

      Volume: 22 Pages: 1~12

    • DOI

      10.1080/13416979.2017.1351837

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 一回繁殖型多年生草本オオウバユリの繁殖特性―種子繁殖と栄養繁殖の寄与に関する集団間比較2018

    • Author(s)
      大嶋希美・早船琢磨・大原雅
    • Organizer
      第65回日本生態学会全国大会
  • [Presentation] Elasticity analysis in semelparous species using random population matrices and COMPADRE Plant Database.2018

    • Author(s)
      T. Takada
    • Organizer
      5-th Annual meeting of Evolutionary Demography Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Flow matrices describing inter-stage flows of individuals: Application to comparative demographic analysis of introduced and native plant populations.2018

    • Author(s)
      H. Yokomizo, T. Takada, K. Fukaya, J. Lambrinos
    • Organizer
      5-th Annual meeting of Evolutionary Demography Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 個体の流れと弾性度に着目した在来種と外来種の比較2018

    • Author(s)
      横溝 裕行,高田 壮則, 深谷 肇一, John G. Lambrino
    • Organizer
      第65回日本生態学会
  • [Presentation] 渓畔林樹種2種の系統地理と分布の変遷2018

    • Author(s)
      金子有子
    • Organizer
      日本生態学会第65回全国大会
    • Invited
  • [Presentation] Theoretical Analysis of Population Projection in Random Matrix Models.2017

    • Author(s)
      T. Takada
    • Organizer
      12th International Congress of Ecology
    • Int'l Joint Research
  • [Book] サンプリングって何だろう : 統計を使って全体を知る方法2018

    • Author(s)
      深谷 肇一、稲垣 佑典、廣瀬 雅代
    • Total Pages
      128(79:121)
    • Publisher
      岩波書店
    • ISBN
      400029671X
  • [Book] 琵琶湖岸からのメッセージ2017

    • Author(s)
      西野 麻知子、秋山 道雄、中島 拓男
    • Total Pages
      248
    • Publisher
      サンライズ出版
    • ISBN
      9784883256242
  • [Remarks] 生物集団データベース

    • URL

      http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~takada/database/

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-10-07  

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