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2016 Fiscal Year Annual Research Report

表現型責任細胞の包括的な同定を目指す次世代型マウス遺伝学の開発

Research Project

Project/Area Number 15H05650
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

洲崎 悦生  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 講師 (10444803)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords次世代マウス遺伝学 / 概日時計 / 組織透明化
Outline of Annual Research Achievements

本研究計画では、高速な「交配なし遺伝学(次世代型マウス遺伝学)」と、高速な「全脳イメージング(CUBIC)」技術を組み合わせ、表現型の表出に関わる責任細胞を同定する技術(個体レベルのシステム要素同定技術)の開発を目的としている。
本年度は、所属先及び理化学研究所の共同研究者らとともに稼働させたESマウス作製系を利用し、次世代型マウス遺伝学の実証実験を完了させ報告した(Ode, Ukai, Susaki et al. Mol Cell 65: 176-190, 2017, co-first)。本論文では、概日時計遺伝子Cry1及びCry2のダブルノットマウス(24時間の行動リズムが消失する表現型を示す)にCry1のレスキューカセットをノックインし、表現型の回復を個体の行動レベルで観察する系を開発した。最終的に、転写制御領域やCry1タンパク質中の変異体を含む合計20種類のレスキューカセットを準備して、Cry1/Cry2ダブルノックアウトバックグラウンドにノックインし、交配なしに解析個体を作製して行動解析を行うことに成功した。
その他、ESマウス作製系の代替・補完的技術と位置付けているアデノ随伴ウイルスを用いた細胞ラベリング系について、ウイルスインジェクションシステムを所属先に初めて導入し稼働させた。また、組織透明化と組織学的染色法を組み合わせ、細胞種を3次元データから同定する技術の開発のため、30種類以上の抗体や染色剤をテストし、CUBICとのコンパチビリティを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究計画では「個体レベルのシステム生物学」の実現のため、2つの基盤技術の確立を目標としている。このうち、高速な「交配なし遺伝学(次世代型マウス遺伝学)」の確立および実証実験について、計画2年目までに完了させ論文報告した(Ode, Ukai, Susaki et al. Mol Cell 65: 176-190, 2017, co-first)。「全脳イメージング(CUBIC)」技術については、初年度にプロトコル論文(Susaki et al. Nature Protocols 10: 1709-1727, 2015)および関連技術を網羅的にまとめた英文総説(Susaki and Ueda. Cell Chemical Biology 23: 137-157, 2016)を発表した。特に後者については、網羅的な細胞・細胞回路解析技術が「個体レベルのシステム生物学」に資することを初めて提唱した。加えて、アデノ随伴ウイルスや3次元組織学技術の導入・開発を進めており、さらに応用例を蓄積するために研究を展開させる準備を進めている。以上の内容から、現在までに概ね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

本研究計画が目標とする、個体レベルのシステム要素同定を実現するため、細胞種同定のための3次元細胞ラベリング技術開発、AAV等のウイルスベクターの活用、3次元組織学的手法の開発、Creマウスをもちいた特定細胞種の遺伝学的ラベリングと3次元イメージングなどを開発要素として検討しており、順次検証を進める。また、3次元イメージング後の画像解析に必要な解像度を得るために、現行の顕微鏡セットアップでは撮影時間がかかりすぎることが問題となっており、3次元イメージングの高速化についても取り組む。

  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 7 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Knockout-Rescue Embryonic Stem Cell-Derived Mouse Reveals Circadian-Period Control by Quality and Quantity of CRY1.2017

    • Author(s)
      Ode KL*, Ukai H*, Susaki EA*, Narumi R, Matsumoto K, Hara J, Koide N, Abe T, Kanemaki MT, Kiyonari H, Ueda HR. *co-first
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 65 Pages: 176-190

    • DOI

      http://doi.org/10.1016/j.molcel.2016.11.022

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Comprehensive cell and cell circuit analysis of whole organ/body toward the organism-level systems biology2017

    • Author(s)
      洲崎悦生、上田泰己
    • Organizer
      SUNPOSIUM, Max Planck Florida Institute2017
    • Place of Presentation
      米国フロリダ
    • Year and Date
      2017-02-13 – 2017-02-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CUBIC: A Platform for Cell-Omics Analysis Toward the Organism-Level Systems Biology2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      NUS-JST(PRESTO) joint workshop
    • Place of Presentation
      国立シンガポール大学/バイオポリス、シンガポール
    • Year and Date
      2016-12-09 – 2016-12-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CUBIC: cell-omics analysis of whole organ/body toward the organism-level systems biology2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      国立台湾大学-東京大学ジョイントワークショップ
    • Place of Presentation
      国立台湾大学、台北
    • Year and Date
      2016-12-01 – 2016-12-01
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CUBIC: cell-omics analysis of whole organ/body toward the organism-level systems biology2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      International Conference on Single Cell Research 2016
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2016-11-17 – 2016-11-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による個体レベルのシステム生物学の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第4回細胞凝集研究会2016
    • Place of Presentation
      札幌 全日空ホテル
    • Year and Date
      2016-09-09 – 2016-09-09
    • Invited
  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による個体レベルのシステム生物学の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      JASIS2016 ライフサイエンスイノベーションゾーン 基調講演
    • Place of Presentation
      幕張メッセ 千葉
    • Year and Date
      2016-09-08 – 2016-09-08
    • Invited
  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による個体レベルのシステム生物学の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      京都バイオ計測センターシンポジウム: 「食・ヘルスケアから未病診断への新しいバイオ計測―デイープラーニングをめざして」
    • Place of Presentation
      京都市産業技術研究所京都リサーチパーク・産技研ホール
    • Year and Date
      2016-08-02 – 2016-08-02
    • Invited
  • [Presentation] 個体システム生物学実現に向けた全身全細胞解析技術2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第37回日本炎症・再生医学会
    • Place of Presentation
      京都市みやこメッセ
    • Year and Date
      2016-06-16 – 2016-06-16
    • Invited
  • [Book] 医学のあゆみ2016

    • Author(s)
      茂田 大地, 金子 みずほ, 洲崎 悦生, 上田 泰己
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      医歯薬出版株式会社
  • [Book] 内分泌・糖尿病・代謝内科2016

    • Author(s)
      勝俣 敬寛, 洲崎 悦生, 上田 泰己
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      科学評論社
  • [Remarks] 体の一日を刻むタイマー機構を発見 -遺伝子導入マウス個体高速作成法を用いた概日時計周期長制御の解明-

    • URL

      http://www.m.u-tokyo.ac.jp/news/admin/release_20161223.pdf

  • [Remarks] 体の一日を刻むタイマー機構を発見 -遺伝子導入マウス個体高速作成法を用いた概日時計周期長制御の解明-

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2016/20161223_1/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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