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2016 Fiscal Year Annual Research Report

進化工学を利用した蛍光プローブの開発研究

Research Project

Project/Area Number 15H05723
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

中井 淳一  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (80237198)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 安藤 恵子  埼玉大学, 理工学研究科, 特任教授 (40221741) [Withdrawn]
根本 直人  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (60509727)
大倉 正道  埼玉大学, 理工学研究科, 准教授 (70369172)
Project Period (FY) 2015-05-29 – 2020-03-31
Keywords脳機能プローブ / 蛍光 / 分子進化 / 分子認識
Outline of Annual Research Achievements

機能的アプタマーを用いた蛍光プローブ開発:緑色蛍光Ca2+プローブG-CaMPの蛍光素子部分を基に作製した改変GFPの両端に、リンカーペプチドを介して基質に結合する2種類のペプチドアプタマーを遺伝子工学的に連結したライブラリーを作製した。
ランダム配列を持つアプタマーを用いた蛍光プローブ開発: 一般に、プローブのスクリーニングのために核酸とタンパク質の対応づけを行う。この目的のために、しばしば核酸とタンパク質を融合させることが行われる。この過程で融合率が低いとライブラリーの収率の低下やライブラリーサイズの低下を引き起こす。我々はelectrophoresis mobility shift assay (EMSA)を用いて融合効率を上げる検討を行った。その結果タンパク質と融合させる核酸の配列を選択することにより、融合効率を高めることができることを見出した。また、種々の融合手法を検討した結果、これまでよりも高効率にDNA配列を、目的タンパク質をコードするDNAに結合させたDNAライブラリーを作成できるようになった。
高速スクリーニング法の確立: セルソーターを用いたスクリーニング法は高速に多数の細胞や細菌、酵母、リポソームなどをスクリーニングし分取することができる。分子をスクリーニングするために、しばしば細胞やリポソームの表面に分子を固定化することが行われる。我々はリポソームにアンカーする新規ペプチドを開発した。さらに、このペプチドを用いて分子を細胞膜やリポソーム膜に効率的に固定化することが可能となった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

測定装置の故障により一部の研究で時間がかかってはいるが、アプタマーを用いたライブラリーの作成や、抗体を用いてのプローブ開発で成果が上がっている。また、スクリーニング方法においてもリポソームにアンカーする新規ペプチドを開発し、このペプチドを用いて分子を細胞膜やリポソーム膜に効率的に固定化することが可能にしており、これらの成果から、全体的にはおおむね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

(1)機能性アプタマーをGFPに結合させた融合タンパク質は、今後蛍光特性についてより詳細に調べるとともに、分子進化の手法を用いてより高性能はプローブへと進化させていく。(2)ランダム配列を持つアプタマーを用いた蛍光プローブ開発に関して、今後さらに高収率なライブラリー作成法を検討していく。(3)高速スクリーニング法開発について、セルソーターによる高速スクリーニング法の詳細を検討して、個々の実験者の実験手技の違いによる影響を少なくした精度の高いスクリーニング法を開発していく。

  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 10 results)

  • [Journal Article] Distinct roles of the two VPS33 proteins in the endolysosomal system inCaenorhabditis elegans2016

    • Author(s)
      Gengyo-Ando Keiko、Kage-Nakadai Eriko、Yoshina Sawako、Otori Muneyoshi、Kagawa-Nagamura Yuko、Nakai Junichi、Mitani Shohei
    • Journal Title

      Traffic

      Volume: 17 Pages: 1197~1213

    • DOI

      10.1111/tra.12430

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Allogeneic transplantation of iPS cell-derived cardiomyocytes regenerates primate hearts2016

    • Author(s)
      Shiba Yuji、Gomibuchi Toshihito、Seto Tatsuichiro、Wada Yuko、Ichimura Hajime、Tanaka Yuki、Ogasawara Tatsuki、Okada Kenji、Shiba Naoko、Sakamoto Kengo、Ido Daisuke、Shiina Takashi、Ohkura Masamichi、Nakai Junichi、Uno Narumi、Kazuki Yasuhiro、Oshimura Mitsuo、Minami Itsunari、Ikeda Uichi
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 538 Pages: 388~391

    • DOI

      10.1038/nature19815

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The integrative role of orexin/hypocretin neurons in nociceptive perception and analgesic regulation2016

    • Author(s)
      Inutsuka Ayumu、Yamashita Akira、Chowdhury Srikanta、Nakai Junichi、Ohkura Masamichi、Taguchi Toru、Yamanaka Akihiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/srep29480

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Olfactory receptor for prostaglandin F2α mediates male fish courtship behavior2016

    • Author(s)
      Yabuki Yoichi、Koide Tetsuya、Miyasaka Nobuhiko、Wakisaka Noriko、Masuda Miwa、Ohkura Masamichi、Nakai Junichi、Tsuge Kyoshiro、Tsuchiya Soken、Sugimoto Yukihiko、Yoshihara Yoshihiro
    • Journal Title

      Nature Neuroscience

      Volume: 19 Pages: 897~904

    • DOI

      10.1038/nn.4314

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Calcium imaging reveals glial involvement in transcranial direct current stimulation-induced plasticity in mouse brain2016

    • Author(s)
      Monai Hiromu、Ohkura Masamichi、Tanaka Mika、Oe Yuki、Konno Ayumu、Hirai Hirokazu、Mikoshiba Katsuhiko、Itohara Shigeyoshi、Nakai Junichi、Iwai Youichi、Hirase Hajime
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 7 Pages: 11100~11100

    • DOI

      10.1038/ncomms11100

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A New In Vitro Co-Culture Model Using Magnetic Force-Based Nanotechnology2016

    • Author(s)
      Takanari Hiroki、Miwa Keiko、Fu XianMing、Nakai Junichi、Ito Akira、Ino Kousuke、Honda Hiroyuki、Tonomura Wataru、Konishi Satoshi、Opthof Tobias、van der Heyden Marcel AG、Kodama Itsuo、Lee Jong-Kook
    • Journal Title

      Journal of Cellular Physiology

      Volume: 231 Pages: 2249~2256

    • DOI

      10.1002/jcp.25342

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 高性能な赤色蛍光Ca2+プローブタンパク質2016

    • Author(s)
      大倉正道, 中井淳一
    • Journal Title

      化学工業

      Volume: 67 Pages: 13-20

  • [Presentation] 高速可変焦点機能を備えた新型内視鏡による超深部脳二光子イメージング2017

    • Author(s)
      佐藤正晃, 茂木優貴, 安藤恵子, 大倉正道, 中井淳一
    • Organizer
      第90回日本薬理学会年会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] アルツハイマー病モデルマウス海馬CA1領域における神経回路破綻過程の可視化2017

    • Author(s)
      高村理沙, 水田恒太郎, 関根友紀子, イスラムタンビル, 斉藤貴志, 大倉正道, 中井淳一, 西道隆臣, 林康紀
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
  • [Presentation] Rational design of ultrafast, high-affinity calcium indicators for monitoring neuronal activity.2016

    • Author(s)
      Inoue M, Takeuchi A, Horigane S, Fujii H, Kamijo S, Takemoto-Kimura S, Ohkura M, Gengyo-Ando K, Kano M, Nakai J, Kitamura K, Bito H
    • Organizer
      The 7th International Neural Microcircuit Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Calcium imaging and single cell optogenetic analysis of a neural circuit for generate swimming locomotion of the Ciona intestinalis larva.2016

    • Author(s)
      Horie T, Ohkura M, Shimai K, Horie R, Sasakura Y, Kusakabe TG, Nakai J, Levine MS, Nakagawa M
    • Organizer
      The 22nd International Zoological Meeting Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Tyraminergic regulation of motor neurons: calcium imaging and optogenetic control in freely behaving C. elegans.2016

    • Author(s)
      Gengyo-Ando K, Kagawa-Nagamura Y, Ohkura M, Hashimoto K, Nakai J
    • Organizer
      The 22nd International Zoological Meeting Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] An optogenetic analysis of forward and backward locomotion in C. elegans.2016

    • Author(s)
      Sugioka T, Toyoda N, Gengyo-Ando K, Nakai J, Takagi S
    • Organizer
      CeNeuro2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] チラミンによる線虫運動ニューロン活動の制御.2016

    • Author(s)
      安藤恵子, 永村ゆう子, 大倉正道, 橋本浩一, 中井淳一
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Olfactory receptor for prostaglandin F2a mediates courtship behavior of male zebrafish.2016

    • Author(s)
      Yabuki Y, Koide T, Miyasaka N, Wakisaka N, Masuda M, Ohkura M, Nakai J, Tsuge K, Tsuchiya S, Sugimoto Y, Yoshihara Y
    • Organizer
      The 17th International Symposium on Olfaction and Taste
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 行動上重要な場所の表象は海馬CA1場所地図において優先的に安定化される2016

    • Author(s)
      佐藤正晃, 水田恒太郎, Tanvir Islam, 河野真子, 竹川高志, Daniel Gomez-Dominguez, 山川宏, 大倉正道, 深井朋樹, 中井淳一, 林康紀
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウス大脳皮質メゾスコピック回路機能研究のオール光アプローチ2016

    • Author(s)
      小泉協, 佐藤正晃, 中井淳一, 大倉正道, 林康紀, 八尾寛
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A TIGRE reporter mouse line driving Cre- and tTA-dependent expression of the red calcium indicator R-CaMP1.07.2016

    • Author(s)
      Bethge P, Egolf L, Lorenzo DA, Goniotaki D, Madisen L, Voigt FF, Ohkura M, Nakai J, Zeng H, Aguzzi A, Helmchen F
    • Organizer
      Society for Neuroscience 2016 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

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