2015 Fiscal Year Research-status Report
生殖細胞特異的小分子RNAであるpiRNAの生合成経路の解明
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15K06948
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
西田 知訓 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (10598436)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | piRNA生合成 / PIWIタンパク質 / 生殖細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
piRNA生合成経路は、数多くの因子が関与している。しかし、それら因子の生化学的な機能について未だ不明な点が多く存在する。それら因子の一つであるBmSpn-Eは、RNAへリカースドメインを持つことから、RNAと結合することが考えられる。そこで、BmSpn-EのCLIPを行った。その結果、予想した通りRNAが結合していることが判った。さらに、生合成経路因子のBmQinでも同様にCLIPを行ったところ、RNAが結合していた。現在、それらのRNAをクローニングし、解析中である。これら因子に結合するRNAを同定することで機能の違いを明らかにする糸口になると考えられる。
piRNA生合成経路は、未だ同定されていない新規因子が存在していると考えられる。そこで、BmSpn-E及びBmQinに結合する新規因子の同定のため、スクロースグラジエントで分画後、それぞれの抗体で免疫沈降実験を行った。BmQinに50~20kDa程の小分子が結合していることが判明した。これら因子の同定を進めている。
piRNA生合成経路において、2種類のPIWIタンパク質同士がpiRNAの生成を引き起こしている。その反応過程では、RNAヘリカーゼタンパク質が重要な働きをしている。PIWIタンパク質であるSiwiには、RNAヘリカーゼタンパク質のBmVasaが結合し、反応を促進している。しかし、Ago3に結合する因子は同定されていない。そこで、スクロースグラジエントで分画後、抗体で免疫沈降実験を行った。しかし、Ago3に結合する新規因子の同定には至らなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
BmAgo3に結合するRNAヘリカーゼタンパク質の同定には至らなかったが、BmSpn-E及びBmQinのCLIPを行った結果より、RNAが実際に結合することが判った。さらにそのRNAを解析を進めている段階である。また、BmQinに結合する新規因子が見られた。それら因子を同定し、解析を進めることにより、BmQinの機能を明らかにすることができると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
BmSpn-EとBmQinの解析については、RNAの同定及び新規因子の同定を進め、申請書に記載した通りに実験を進めることで機能を明らかにしていく。
BmAgo3に結合するRNAヘリカーゼタンパク質の同定は、スクロースグラジエントの分画条件が悪かった可能性もあるため、条件検討を更に行っていく。また、ポジティブコントロールとして、Siwi-BmVasaの結合が見られる条件を元にする。
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Research Products
(1 results)
