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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Structural analysis of protein using synchrotron-radiation vacuum-ultraviolet circular dichroism and study of biomolecular interactions

Research Project

Project/Area Number 15K07028
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

松尾 光一  広島大学, 放射光科学研究センター, 准教授 (40403620)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords円二色性 / 放射光 / 蛋白質 / 生体膜相互作用 / 二次構造 / ミエリン鞘 / 薬物輸送
Outline of Annual Research Achievements

放射光を用いた真空紫外円二色性(VUVCD)法を、生体膜存在下でのα1-酸性糖タンパク質(AGP)とミエリン塩基性タンパク質(MBP)の構造研究に応用し、両蛋白質の生体膜との相互作用機構について考察した。
1 生体膜存在下でのAGPの構造解析
細胞内薬物輸送に関わるとされるAGPの天然状態は、βストランドリッチな構造であるが、phosphatidylinositol (PI, 正味電荷:負)リポソーム存在下でVUVCD測定した結果,天然状態では15%であったへリックス含量が53%まで増加することが分かった。アミノ酸配列レベルの二次構造解析を行った結果、薬物結合サイトを含むAヘリックス領域と含まないGヘリックス領域が生体膜と結合可能な部位であることが分かった。これらAとG領域のペプチドを合成しリポソーム存在下でVUVCDスペクトルを測定したところ,Aペプチドのみで構造変化が観測された。A領域は、両親媒性のアミノ酸配列でもあることから、この領域が生体膜と静電的相互作用により結合し、これがトリガーとなり,AGPのβ-α構造転移が誘起されることが示唆された。この結果は、相互作用の初期段階で、薬物結合サイトが崩壊することを示している。
2 生体膜存在下でのMBPの構造解析
神経細胞軸索を取り巻くミエリン鞘のコンパクト化に寄与するMBPは、静電的相互作用により生体膜表面と結合すると考えられる。本年度は、この静電的相互作用を高めると考えられるPI4,5ビスリン酸リポソーム存在下で、VUVCDによるMBPの構造解析を行った。その結果、ヘリックス含量がPIのみよりも増加し、PI存在下では形成されなかった両親媒性ヘリックスが観測された。この結果は、ミエリン化に関わるMBPの生体膜との相互作用には、生体膜頭部の種類だけでなくその正味電荷の強さも大きく寄与することを示唆している。

  • Research Products

    (28 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 12 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] コロラド州立大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      コロラド州立大学
  • [Journal Article] Structural analysis of lysine-4 methylated histone H3 proteins using synchrotron radiation circular dichroism spectroscopy2018

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo, H. Namatame
    • Journal Title

      Chirality

      Volume: 30 Pages: 536-540

    • DOI

      doi.org/10.1002/chir.22849

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ynchrotron-radiation vacuum-ultraviolet circular-dichroism spectroscopy for characterizing the structure of saccharides2018

    • Author(s)
      K. Matsuo, K. Gekko
    • Journal Title

      Glycobiophysics

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circular dichroism spectroscopic study on structural alterations of histones induced by post-translational modifications in DNA damage responses: Lysine-9 methylation of H32017

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo, K. Fujii, A. Yokoya, M. Taniguchi, H. Namatame
    • Journal Title

      J. Radiat. Res

      Volume: 59 Pages: 108-115

    • DOI

      doi.org/10.1093/jrr/rrx068

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vacuum-ultraviolet circular-dichroism study of oligosaccharides using a synchrotron-radiation spectroscopy2017

    • Author(s)
      K. Matsuo
    • Journal Title

      Biomed. Spectrosc. Imaging

      Volume: 6 Pages: 111-121

    • DOI

      DOI: 10.3233/BSI-170169

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conformations of α1-acid glycoprotein fragments in membrane-bound state revealed by vacuum-ultraviolet circular-dichroism spectroscopy2017

    • Author(s)
      K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 111

  • [Journal Article] Studies on structure and amyloid fibril formation of α-Synuclein2017

    • Author(s)
      K. Matsuo, H. Yamamoto, S. Lee, T. Mizobata, K. Gekko, Y. Kawata
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 115-116

  • [Journal Article] Emergence of Biological Homochirality by Irradiation of Polarized Quantum Beams2017

    • Author(s)
      K. Matsuo, Y. Izumi, J. Takahashi, M. Fujimoto, M. Katoh
    • Journal Title

      UVSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 157

  • [Journal Article] Conformation of Membrane-Bound Myelin Basic Protein Characterized by Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism Spectroscopy2017

    • Author(s)
      M. Kumashiro, K. Matsuo, Y. Izumi, H. Namatame, M. Taniguchi
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 108

  • [Journal Article] Vacuum-ultraviolet circular dichroism of locust bean gum2017

    • Author(s)
      Y. Maki, R. Takeda, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 112-113

  • [Journal Article] VUVCD measurements of methylated histone H32017

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 114

  • [Journal Article] Development of a determination method for absolute configuration of chiral allenes by vacuum-ultraviolet circular dichroism2017

    • Author(s)
      T. Nehira, Y. Tokunaga, T, Umezawa, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report

      Volume: - Pages: 117

  • [Presentation] Present status and future prospect of HiSOR-VUVCD spectrophotometer for characterizing biomolecule structures in solution2018

    • Author(s)
      K. Matsuo
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Conformations of Myelin Basic Protein Interacted with Membrane Revealed by Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism2018

    • Author(s)
      M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Secondary structural analysis of XRCC4 protein using HiSOR-VUVCD2018

    • Author(s)
      K. Nishikubo, Y. Izumi, K. Fujii, K. Matsuo, Y. Matsumoto, A. Yokoya
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Beam focusing and Sample-Volume Reduction Using Schwarzschild Objective at VUV-CD Spectrophotometer2018

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural Analysis of Lysine-4 Methylated Histone H3 Using VUV-CD Spectroscopy2018

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Secondary Structural Analysis of Hyaluronan Synthase Interacted with Membrane by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy2018

    • Author(s)
      S. Suenaga, M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterizations of Structural Dynamics and Hydration Structures of D-Glucose using Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism Spectroscopy2018

    • Author(s)
      K. Matsuo, H. Namatame, M. Taniguchi
    • Organizer
      The 22nd Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 真空紫外円二色性分光によるα1-酸性糖タンパク質の生体膜相互作用研究2018

    • Author(s)
      松尾光一,生天目博文,谷口雅樹
    • Organizer
      第31回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 円偏光の照射波長に依存したアミノ酸の光学活性発現2018

    • Author(s)
      松尾光一, 泉雄大, 高橋淳一,小林憲正,藤本將輝,加藤政博
    • Organizer
      第31回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of Biomolecule Structures by Synchrotron-Radiation Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism Spectroscopy2017

    • Author(s)
      K. Matsuo
    • Organizer
      4th International Symposium on Hybrid Materials and Processing
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放射光円二色性法による生体分子の構造解析2017

    • Author(s)
      松尾光一
    • Organizer
      平成29年度結晶学若手の会
    • Invited
  • [Presentation] Structural Characterization of Amyloid Fibrils using Synchrotron-Radiation Circular Dichroism and Circular Dichroism Theory2017

    • Author(s)
      K. Matsuo, R. W. Woody
    • Organizer
      Biochemistry and molecular biology department symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射光真空紫外円二色性による生体膜と相互作用したミエリン塩基性タンパク質の構造解析2017

    • Author(s)
      熊代 宗弘、泉 雄大、松尾 光一
    • Organizer
      第17回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] Probing histone H3 structural alterations induced by lysine-4 methylation2017

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo
    • Organizer
      Chirality 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 放射光真空紫外円二色性分光法

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/koichi/

  • [Remarks] 放射光研究室紹介

    • URL

      http://www.hsrc.hiroshima-u.ac.jp/labo/BL12.htm

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-06-06  

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