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2016 Fiscal Year Research-status Report

キノン補酵素形成に関与する新規トリプトファン水酸化酵素の精密反応解析

Research Project

Project/Area Number 15K07391
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

岡島 俊英  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (10247968)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中井 忠志  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (00333344)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsオキシゲナーゼ / FAD / X線結晶構造解析 / 分子内架橋 / チオエーテル架橋
Outline of Annual Research Achievements

キノヘムプロテイン・アミン脱水素酵素(QHNDH)の小サブユニットQhpC上の補酵素生合成に関与するQhpGに関して、構造決定と生化学的な機能解明を進めている。これまでに、アミノ酸配列情報に基づいて、QhpGはFAD結合蛋白質であり、オキシゲナーゼであることが予測されているが、その詳細は全く解明されていなかった。今期の研究成果として、QhpG結晶を水銀化合物でソーキングすることによって、重原子誘導体結晶の調製に成功した。これはパターソンマップ上の明確な異常分散ピークによって明らかとなった。現在、単一重原子同形置換法(SIRAS 法: Single isomorphous replacement plusanomalous scattering)による位相決定を進めている。生化学的な解析では、QhpGが触媒する反応の解析において大きな進展があった。まず基質となる3つのチオエーテル架橋を含有するQhpCの安定的な調製に成功した。MALDI TOF MS測定機によって、QhpCのAsp-N消化産物をMS/MS解析した。その結果、架橋が存在すると、開裂による断片化が起こらないため、架橋領域を明確に同定することができた。さらに、Native電気泳動の結果、架橋形成酵素QhpD, QhpG、およびQhpCは安定な3者複合体を形成することがわかった。この相互作用情報に基づいて、各種の反応条件を検討したところ、架橋形成酵素QhpD存在下、還元的環境下において分子状酸素を添加すると、QhpGによるQhpCの水酸化反応が起きることを見出した。これは、反応産物のAsp-N消化物を質量分析すると、補酵素前駆体Trp残基を含むQhpC架橋断片が質量増加することによって判明した。すなわち、QhpGはQhpC/QhpDの3者複合体となることによって、オキシゲナーゼとして機能発現することがわかった。QhpDは、QhpGの反応の足場としても機能すると推測される。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

QhpGのX線結晶構造の決定に向けて、着実な進展があった。また、QhpG反応系の構築ならびに反応物同定の手法を確立することができ、QhpG反応機構の解析に向けて有益な情報が得られた。

Strategy for Future Research Activity

位相決定とモデリングを進めて、早急にQhpGの立体構造を決定する。また、QhpGの反応解析を進める分光学的な手法についても検討する。構築された反応系によって、ペプチド断片のTrpを水酸化できるかどうか解析し、想定通りの反応が起きた場合には、変異型酵素の解析などを行い、QhpGの詳細な触媒機構解明を行う。加えて、QhpGを用いたペプトド環状化の方法の開発に関しても、研究をすすめる。

Causes of Carryover

原著論文の投稿費用として確保してあったが、より確定的な結果を得るために最終的に次年度に論文発表を繰越すことになったため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

原著論文の発表を含めて、成果の発表を急ぐとともに、適正な予算使用を進める。

  • Research Products

    (10 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] ペプチドを分子内架橋する新規ラジカルSAM酵素2016

    • Author(s)
      中井忠志,谷澤克行,岡島俊英
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 88 Pages: 506-510

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2016.880506

  • [Presentation] キノン補酵素生合成に関わるFAD依存性モノオキシゲナーゼQhpGの分光学的特性と基質タンパク質QhpCとの相互作用2017

    • Author(s)
      大関 俊範、中井 忠志、谷澤 克行、岡島 俊英
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2017-03-17 – 2017-03-20
  • [Presentation] 新規環状ペプチドの開発に向けたラジカルSAM酵素QhpDの基質特異性解析2017

    • Author(s)
      小酒井 一輝、中井 忠志、谷澤 克行、岡島 俊英
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2017-03-17 – 2017-03-20
  • [Presentation] Characterization of FAD-dependent monooxygenase involved in quinone cofactor biosynthesis2016

    • Author(s)
      Toshinori Oozeki, Tadashi Nakai, Katsuyuki Tanizawa, Toshihide Okajima
    • Organizer
      The 20th SANKEN International The 15th SANKEN Nanotechnology Symposium
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      2016-12-12 – 2016-12-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of substrate specificity of intrapeptidyl thioether bond forming radical SAM enzyme QhpD2016

    • Author(s)
      Kazuki Kozakai, Tadashi Nakai, Katsuyuki Tanizawa, Toshihide Okajima
    • Organizer
      The 20th SANKEN International The 15th SANKEN Nanotechnology Symposium
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      2016-12-12 – 2016-12-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reaction mechanism of interpeptidyl thioether cross-links by radical SAM enzyme QhpD2016

    • Author(s)
      Tadashi Nakai, Katsuyuki Tanizawa, Toshihide Okajima
    • Organizer
      The 20th SANKEN International The 15th SANKEN Nanotechnology Symposium
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      2016-12-12 – 2016-12-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ペプチド分子内チオエーテル架橋形成酵素QhpDの基質特異性解析2016

    • Author(s)
      小酒井一輝, 中井忠志, 谷澤克行, 岡島俊英
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] キノン補酵素生合成に関わるFAD依存性モノオキシゲナーゼQhpGの精製と分光学的特性2016

    • Author(s)
      大関俊範, 中井忠志, 谷澤克行, 岡島俊英
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] Mechanism of sequential formation of intrapeptidyl thioether cross-links by the radical SAM enzyme QhpD.2016

    • Author(s)
      T. Nakai, K. Tanizawa, and T. Okajima
    • Organizer
      Fifth International Conference on Cofactors (ICC-05) & Active Enzyme Molecule 2016
    • Place of Presentation
      Kurobe
    • Year and Date
      2016-09-04 – 2016-09-08
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] QHNDH (Quinohemoprotein amine dehydrogenase)

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/smb/QHNDH.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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