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2016 Fiscal Year Research-status Report

糸状菌エンドファイトの共生確立における分泌タンパク質の機能

Research Project

Project/Area Number 15K07839
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

竹本 愛子 (田中愛子)  名古屋大学, 生命農学研究科, 学振特別研究員(RPD) (90464148)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords共生
Outline of Annual Research Achievements

ProAに直接発現制御を受けるプロモーター配列の同定
先に、ProAタンパク質が直接結合するプロモーター配列をSELEX法を用いて回収し(SELEX DNA)、Miseqを用いて配列解析を行った。非濃縮DNAと比較し、濃縮DNAで特に高頻度で検出される配列について、モチーフ検索を行ったところ、先に同定したProA結合プロモーター配列と類似のモチーフが高頻度で検出された。さらにSELEX DNAに高濃縮で存在するDNA配列をChIP法により分離したDNA(ChIP DNA)を鋳型として増幅したところ、多くの配列がChIP DNAにおいても高頻度で検出され、Epichloe festucae細胞内でProAタンパク質がSELEX DNAの一部に直接結合することが示唆された。

ProAに直接発現制御を受ける遺伝子群の機能解析
SELEX DNAにおいて濃縮されてる配列でさらにChIP DNAにおいても濃縮が確認された配列についてその下流に存在する遺伝子群は、ProAと同様に共生に重要な機能を果たす可能性が考えられた。これらのN末端に分泌シグナルの有無を調査したところ一部の遺伝子群については分泌シグナルが見つかった。そこで、これらの遺伝子破壊ベクターを作成し、野生株の形質転換を行った。10遺伝子について遺伝子破壊株が得られ、それらを宿主ペレニアルライグラスに接種した。今後これら接種植物における破壊株の共生の有無、感染が確認された場合には、宿主の生育への影響、バイオマスについての調査を予定している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

共生に不可欠な転写制御因子のターゲットとなる遺伝子群の機能解析を進めることができ、次年度中に表現形質の評価を完了するための材料を揃えることができた。

Strategy for Future Research Activity

共生に不可欠な転写制御因子のターゲットとなる遺伝子群のうち共生に重要な役割を持つものを接種実験によって特定する。それらのうち、N末端に分泌シグナルを持つものを同定し、宿主植物中での発現部位および分布を明らかにし、E. festucaeと宿主植物との共生を支える分子機構を解明する。

Causes of Carryover

予定していた試薬が実験の進行の都合上必要なくなったため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度の研究計画の中で使用を予定している。

  • Research Products

    (8 results)

All 2017 2016

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Varietal differences in the growth responses of rice to an arbuscular mycorrhizal fungus under natural upland conditions.2017

    • Author(s)
      Sisaphaithong T, Hanai S, Tomioka R, Kobae Y, Tanaka A, Yano K, Takenaka C and Hata S
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 12 Pages: e1274483

    • DOI

      10.1080/15592324.2016.1274483

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SymB and SymC, two membrane associated proteins, are required for Epichloe festucae hyphal cell-cell fusion and maintenance of a mutualistic interaction with Lolium perenne2017

    • Author(s)
      Green K, Becker Y, Tanaka A, Takemoto D, Fitzsimons H, Seiler S, Lalucque H, Silar P, Scott B
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 103 Pages: 657-677

    • DOI

      10.1111/mmi.13580

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Kosakonia sacchari Strain BO-1, an Endophytic Diazotroph, from Sweet Potato.2016

    • Author(s)
      Shinjo R, Uesaka K, Ihara K, Loshakova K, Mizuno Y, Yano K and Tanaka A.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 4 Pages: e00868-16

    • DOI

      10.1128/genomeA.00868-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 擬似有性生殖様の現象を介して作出したepichloaeエンドファイト菌株の諸性質の解析2016

    • Author(s)
      磯部仁美・増中 章・菅原幸哉・多賀正節・佐藤育男・千葉壮太郎・川北一人・田中愛子・竹本大吾
    • Organizer
      第16回 糸状菌分子生物学コンファレンス
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-11-17 – 2016-11-18
  • [Presentation] Isolation and characterization of novel diazotrophic Burkholderia vietnamiensis as an endophytic bacteria in sweet potato tuberous root.2016

    • Author(s)
      Rina Shinjo, Aiko Tanaka, Hisanori Yamakawa, Kazuma Uesaka, Yuichi Fujita, Kunio Ihara, Kondo Motohiko, Yano Katsuya
    • Organizer
      4th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation
    • Place of Presentation
      ペナン、マレーシア
    • Year and Date
      2016-10-16 – 2016-10-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] イネ科植物に共生するEpichloe/Neotyphodium属エンドファイトの産生する抗菌性物質の探索と解析2016

    • Author(s)
      磯部仁美・増中 章・菅原幸哉・多賀正節・佐藤育男・千葉壮太郎・川北一人・田中愛子・竹本大吾
    • Organizer
      平成28年度 日本植物病理学会関西部会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      2016-09-29 – 2016-09-30
  • [Presentation] Epichloae(Epichloe/Neotyphodium属)エンドファイトの雑種菌を用いた擬似有性生殖機構の解明2016

    • Author(s)
      磯部仁美・増中 章・菅原幸哉・多賀正節・佐藤育男・千葉壮太郎・川北一人・田中愛子・竹本大吾
    • Organizer
      平成 28 年度植物感染生理談話会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-08-10 – 2016-08-12
  • [Presentation] Novel nuclear protein, NsiA, and its interacting transcription factor Ste12 and MAP kinase Mak2 mediate balanced symbiotic infection of endophytic fungus Epichoe festucae in perennial ryegrass2016

    • Author(s)
      Kamiya S., Ozaki Y., Okamura A., Kameoka S., Kayano Y., Saikia S., Scott B., Maruyama J., Tanaka A. and Takemoto D.
    • Organizer
      XVII International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
    • Place of Presentation
      Portland, Oregon, USA
    • Year and Date
      2016-07-17 – 2016-07-21
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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