2016 Fiscal Year Research-status Report
マイクロバイオーム解析に基づく高齢者肺炎の病態解明と革新的予防法への展開
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15K09572
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
柳原 克紀 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 教授 (40315239)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 肺炎 / マイクロバイオーム / 感染症 / 予防 / 腸内細菌叢 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
高齢者肺炎には様々な原因菌が関与すること、誤嚥する症例が多く、口腔内環境が重要である、全身の免疫低下状態も大きな要因となる。ことから、より包括的で新しいアプローチが必要である。高齢患者は多くの基礎疾患を有し、内服薬も多岐にわたるため、データ解析等が複雑になることが予想される。そのため、高齢者肺炎の本研究に進む前に基礎疾患を有さない群を対象にした予備検討を行うことにした。抗菌薬投与は腸内細菌叢に強い影響を与えることが予想されるため、その解析も実施した。この検討では、長崎大学病院整形外科に入院し、手術療法を受ける患者20名を対象にした。文書により同意を取得した。（長崎大学倫理委員会承認済み）
採取された便を次世代シークエンサーで解析し、 各OTU(operational taxonomic unit)を構成する16Sリード数を測定した。それぞれのOTU（菌種）の割合、つまり細菌叢の菌種構成比を推定できる。相対的に多くのリード数で構成されるOTUsは優占菌種であり、一つのリードからなるOTUはマイナーな菌種になる。
この結果から、界、門、綱、目、科、属、種とレベルにより、類似している点と異なる点があることが明らかになった。これは腸内細菌叢解析を進めるうえで情報であり、高齢者肺炎研究の基礎データとなるものである。これらのデータを平成29年度に実施する臨床検体（舌ぬぐい液、糞便）の解析に活用する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
次世代シークエンサーのセットアップやデータ解析手法の確立が完了した。また、腸内細菌叢に関するknow-how が十分蓄積されてきている。
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| Strategy for Future Research Activity |
長崎市内の老健施設（道ノ尾病院、新里病院、昭和会病院など）において、文書同意を取得後70歳以上の入所者400名からの舌背ぬぐい液および糞便を採取する。尚、担癌患者、自己免疫疾患患者、ステロイドあるいは免疫抑制剤治療中の患者はマイクロバイオームに影響を与える可能性があるため、除外する。
研究計画は下記のように進める。１．高齢者施設入所者400名からの舌背ぬぐい液および糞便の採取、２．検体からのDNA抽出およびメタ16S遺伝子解析による菌種・菌種組成解析、３．2年間の観察を行い、肺炎発症群では検体の採取と臨床評価を実施する。４．肺炎発症群におけるマイクロバイオームの特徴を明らかにする。
肺炎発症群においては、以下の臨床データをカルテベースで登録し、詳細な解析を実施する。同意取得日、性別、体重、生年月日（年齢）、入院・外来区分、基礎疾患・合併症（有無、疾患名・症状名、感染症との関係 ）、アレルギー歴、既往歴、血管内治療の有無、誤嚥の有無、使用抗菌薬（薬剤名、投与期間、）、肺炎の重症度（A-DROP、PORTスコア）、細菌性肺炎と非定型肺炎の鑑別、PS、経管栄養の有無など
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| Causes of Carryover |
29年度から実施予定の高齢者肺炎の研究において、多額の経費が必要である。そのため、予備研究は別予算で賄った。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成29年度は多数の患者検体を解析する必要があり、繰り越し分も含め全額使用する予定である。
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[Presentation] 感染症治療と腸内細菌叢2017
Author(s)
賀来敬仁、柳原克紀
Organizer
第28回日本臨床微生物学会
Place of Presentation
ブリックホール（長崎県・長崎市）
Year and Date
2017-01-20 – 2017-01-22
Invited
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