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2016 Fiscal Year Annual Research Report

The mechanism regulating the function of a natural cytotoxin

Research Project

Project/Area Number 15K12740
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

脇本 敏幸  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (70363900)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
KeywordsカリクリンA / 生合成 / 海綿共生微生物
Outline of Annual Research Achievements

海綿動物Discodermia calyxに含まれるcalyculin Aはタンパク質脱リン酸化酵素1および2Aを特異的に阻害し、極めて強力な細胞毒性を示す。我々は海綿メタゲノムよりcalyculin A生合成遺伝子クラスターの取得に成功し、詳細な生合成経路の解析を進めている。その過程で見出したリン酸基転移酵素CalQがcalyculin Aにリン酸基を付与し、ピロリン酸基を含むphosphocalyculin Aを生成することを明らかにした。Phosphocalyculin Aの細胞毒性は約1,000倍低下しており、calyculin Aのprodrug体であることが示唆された。また、遺伝子クラスターの局在を解析することで、calyculin Aは海綿共生微生物Entotheonellaによって生合成されることを突き止めた。これらのことから、海綿共生微生物はより低毒性なphosphocalyculin Aを生産することで、動物であるホスト側への毒性を軽減していることが示唆される。さらにCalyculin Aは抗菌活性を示さないことから、生産者であるEototheonellaに対しての毒性はないものと考えられる。そのため、この巧妙な物質生産機構には共生微生物と海綿動物間のクロストークが伺える。本研究ではphosphocalyculin Aからcalyculin Aへの変換を担う脱リン酸化酵素の同定を試みた。海綿粗酵素液の段階で見出された脱リン酸化活性を指標に硫安分画や各種クロマトグラフィー法を組み合わせ、比活性が粗酵素液よりも約10万倍濃縮した活性画分を得ることに成功した。SDS-PAGEによって活性画分に特異的なバンドが確認できたことから、該当するバンドを切り出し、MS/MS解析に供した。しかしながら、タンパク量が微量であったため、アミノ酸配列の解析には至らなかった。そこで、さらにザイモグラフィーを用いて、ゲルの切り出し、活性試験を繰り返し、該当するバンドの取得を試みた。得られたタンパク質のアミノ酸配列の解析を現在進めている。

  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 12 results,  Acknowledgement Compliant: 11 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Total synthesis of theonellapeptolide Id2017

    • Author(s)
      Kuranaga, T., Enomoto, A., Tan, H., Fujita, K., Wakimoto, T.
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 19 Pages: 1366-1369

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.7b00249

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Toward dark matter of natural products”2017

    • Author(s)
      Wakimoto, T.
    • Journal Title

      Chem. Rec.

      Volume: 17 Pages: in press

    • DOI

      10.1002/tcr.201700009

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Characterization of giant modular PKSs provides insight into genetic mechanism for structural diversification of aminopolyol polyketides2017

    • Author(s)
      Zhang, L., Hashimoto, T., Qin, B., Hashimoto, J., Kozone, I., Kawahara, T., Okada, M., Awakawa, T., Ito, T., Asakawa, Y., Ueki, M., Takahashi, S., Osada, H., Wakimoto, T., Ikeda, H., Shin-ya, K., Abe, I.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 56 Pages: 1740-1745

    • DOI

      10.1002/anie.201611371

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification of pyridinium with three indole moieties as an antimicrobial agent2017

    • Author(s)
      Okada, M., Sugita, T., Wong, C. P., Wakimoto, T., Abe, I.
    • Journal Title

      J. Nat. Prod.

      Volume: 80 Pages: in press

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.6b01152

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nature's way of making the sponge-derived cytotoxin2016

    • Author(s)
      Wakimoto, T., Egami, Y., Abe, I.
    • Journal Title

      Nat. Prod. Rep.,

      Volume: 33 Pages: 751-760

    • DOI

      10.1039/C5NP00123D

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] An unusual chimeric diterpene synthase from Emericella variecolor and its functional conversion to a sesterterpene synthase by domain swapping2016

    • Author(s)
      Qin, B., Matsuda, Y., Mori, T., Okada, M., Quan, Z., Mitsuhashi, T., Wakimoto, T., Abe, I.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 55 Pages: 1658-1661

    • DOI

      10.1002/anie.201509263

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Metagenomic analysis of the sponge Discodermia reveals the production of the cyanobacterial natural product kasumigamide by 'Entotheonella'2016

    • Author(s)
      Nakashima, Y., Egami, Y., Kimura, M., Wakimoto, T., Abe, I.
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 11 Pages: e0164468

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0164468

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Sulfoureido lipopeptides from the marine sponge Discodermia kiiensis2016

    • Author(s)
      Tan, K. C., Wakimoto, T., Abe, I.
    • Journal Title

      J. Nat. Prod.

      Volume: 79 Pages: 2418-2422

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.6b00586

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural diversification of lyngbyatoxin A by host-dependent heterologous expression of the tleABC biosynthetic gene cluster2016

    • Author(s)
      Zhang, L., Hoshino, S., Awakawa, T., Wakimoto, T., Abe, I.
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 17 Pages: 1407-1411

    • DOI

      10.1002/cbic.201600350

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Concise synthesis of anserine: efficient solvent tuning in asymmetric hydrogenation reaction2016

    • Author(s)
      Yamashita, M., Shimizu, K., Koizumi, Y., Wakimoto, T., Hamashima, T., Asakawa, M., Inai, M., Kan, T.
    • Journal Title

      Synlett

      Volume: 27 Pages: 2734-2736

    • DOI

      10.1055/s-0035-1562796

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Syntheses of methylated catechins and theaflavins using 2-nitrobenzenesulfonyl group to protect and deactivate phenol2016

    • Author(s)
      Asakawa, T., Kawabe, A., Yoshida, Y., Aihara, T., Manabe, Y., Hirose, A., Sakurada, M., Inai, Y., Harashima, T., Furuta, T., Wakimoto, T., Kan, T.
    • Journal Title

      J. Antibiot.

      Volume: 69 Pages: 299-312

    • DOI

      10.1038/ja.2016.14

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 海綿共生微生物による生物活性物質の生産2016

    • Author(s)
      江上蓉子, 脇本敏幸, 阿部郁朗
    • Journal Title

      バイオインダストリー

      Volume: 33 Pages: 11-17

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Toward the dark matter of marine natural products2017

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      International Symposium on Marine Natural Products
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2017-02-28
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A Bacterial Symbiont in Japanese Marine Sponges Produces Biologically Active Metabolites2016

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      The 3rd Myanmar-Japan International Symposium
    • Place of Presentation
      Pathein, Myanmar
    • Year and Date
      2016-12-03
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 海綿動物由来生物活性物質の探索と生合成研究2016

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      若手研究者のための有機化学札幌セミナー
    • Place of Presentation
      北海道大学理学部(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-11-29
    • Invited
  • [Presentation] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2016

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      Czech-Japan Joint Workshop
    • Place of Presentation
      Prague, Czech Republic
    • Year and Date
      2016-11-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 「天然物の化学ー魅力と展望ー」上村大輔編, 科学のとびら602016

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Total Pages
      p61-66
    • Publisher
      東京化学同人
  • [Remarks] 北海道大学大学院薬学研究院天然物化学研究室

    • URL

      http://www.pharm.hokudai.ac.jp/tennen/index.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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