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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Detection of neoantigens by gene-engineered T cells

Research Project

Project/Area Number 15K14403
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

垣見 和宏  東京大学, 医学部附属病院, 特任教授 (80273358)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 隆二  独立行政法人国立病院機構(相模原病院臨床研究センター), 診断・治療研究室, 室長 (70373470)
松下 博和  東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (80597782)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords腫瘍免疫 / T細胞受容体 / がん抗原 / 次世代シーケンサー / ネオアンチゲン
Outline of Annual Research Achievements

我々は、次世代シーケンサーの特性を生かし①in silicoの新生抗原予測法と、②T細胞受容体(TCR)遺伝子解析に基づいた抗原特異的T細胞の同定法を確立し、新生抗原特異的抗腫瘍免疫応答を解明することを目的として本研究を実施した。
平成27年度は、次世代シーケンサーを用いたTCR遺伝子配列の解析技術と、腫瘍特異的新生抗原同定システムの基盤を確立した。
最終年度(平成28年度)は、エクソームシーケンスに加えて、全RNAシーケンスのデータから変異遺伝子の発現量と変異アレルを確認するステップを加えることにより、より正確に新生抗原を予測することが可能になることを明らかにした(Cancer Sci. 2017 Feb;108(2):170-177)。これにより正確に新生抗原ペプチドを合成することが可能になり、新生抗原特異的T細胞の検出の促進が期待された。
さらに最終年度は、次世代シーケンサーを用いたTCR遺伝子解析を応用し、抗原特異的T細胞遺伝子同定システムを構築した。TCR遺伝子配列が既知のpmel-1トランスジェニックマウス由来のT細胞をC57BL/6マウスの脾細胞に0.0001%~1%混入し、抗原ペプチドで72時間刺激培養したのちに、TCR遺伝子解析法とフローサイトメーターによる抗原特異的T細胞の検出を比較した。通常のフローサイトメーターによる測定では、検出限界は0.01%~0.1%であるが、我々が開発したTCR遺伝子解析法では、0.0001~0.001%の抗原特異的T細胞が検出可能であった。
これらの技術を統合して、次世代シーケンサーを活用した新生抗原と特異的T細胞同定システムを構築することができた。これにより、新生抗原を標的とした抗腫瘍免疫応答の研究と治療法の開発か可能になると期待される。

  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 8 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Prediction and prioritization of neoantigens: integration of RNA sequencing data with whole-exome sequencing.2017

    • Author(s)
      Karasaki T, Nagayama K, Kuwano H, Nitadori JI, Sato M, Anraku M, Hosoi A, Matsushita H, Takazawa M, Ohara O, Nakajima J, Kakimi K.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 108 Pages: 170-177

    • DOI

      10.1111/cas.13131.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 腫瘍内免疫応答の評価と個別化がん免疫治療法の開発2017

    • Author(s)
      垣見和宏
    • Organizer
      第16回日本再生医療学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2017-03-09 – 2017-03-09
    • Invited
  • [Presentation] An Immunogram for the Cancer Immunotherapy2017

    • Author(s)
      Kazuhiro Kakimi
    • Organizer
      The 32nd Nagoya International Cancer Treatment Symposium
    • Place of Presentation
      愛知がんセンター(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ネオアンチゲンに対する免疫応答と免疫シグネチャーの解析2017

    • Author(s)
      松下博和、垣見和宏
    • Organizer
      第14回 日本免疫治療学研究会 学術集会
    • Place of Presentation
      伊藤国際学術研究センター(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-11
    • Invited
  • [Presentation] ネオアンチゲンワクチンの有効性の検討2017

    • Author(s)
      長岡孝治、宮井まなみ、飯野環、木村真之介、高橋卓也、細井亮宏、松下博和、垣見和宏
    • Organizer
      第14回日本免疫治療学研究会
    • Place of Presentation
      伊藤国際学術研究センター(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-11
  • [Presentation] 健常人PBMCを用いた癌患者ネオアンチゲン候補ペプチドのスクリーニング2017

    • Author(s)
      小林由香利、長岡孝治、細井亮宏、飯野環、木村真之介、高橋卓也 、泉謙道、藤枝奈緒、大平公亮、神原香織、松下博和、垣見和宏
    • Organizer
      第14回日本免疫治療学研究会学術集会
    • Place of Presentation
      伊藤国際学術研究センター(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-11
  • [Presentation] CTL (Cytotoxic T Lymphocyte)療法2017

    • Author(s)
      垣見和宏
    • Organizer
      第31回Transfusion Medicine Conference
    • Place of Presentation
      IPC生産性センター(神奈川県・三浦郡葉山町)
    • Year and Date
      2017-01-27 – 2017-01-27
    • Invited
  • [Presentation] Immunogram for Cancer-Immunity Cycle towards Personalized Immunotherapy of Lung Cancer2016

    • Author(s)
      Takahiro Karasaki, Kazuhiro Nagayama, Hideki Kuwano, Jun-ichi Nitadori, Masaaki Sato, Masaki Anraku, Akihiro Hosoi, Hirokazu Matsushita, Yasuyuki Morishita, Kosuke Kashiwabara, Masaki Takazawa, Osamu Ohara, Kazuhiro Kakimi, Jun Nakajima
    • Organizer
      IASLC 17th World Conference on Lung Cancer
    • Place of Presentation
      Vienna, Austria
    • Year and Date
      2016-12-07 – 2016-12-07
  • [Presentation] Immunoediting of mutation associated neoantigens in the tumor2016

    • Author(s)
      Hirokazu Matsushita, Kazuhiro Kakimi
    • Organizer
      第45回日本免疫学会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県・宜野湾市)
    • Year and Date
      2016-12-07 – 2016-12-07
    • Invited
  • [Presentation] Personalized Cencer Immunotherapy2016

    • Author(s)
      Kazuhiro Kakimi
    • Organizer
      2016 International Symposiumu for Recent Advances in Cell Therapy
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2016-10-28 – 2016-10-28
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ネオアンチゲンとCancer Immunity Cycle2016

    • Author(s)
      垣見和宏
    • Organizer
      第54回日本癌治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-22 – 2016-10-22
    • Invited
  • [Presentation] 予後・治療効果予測因子としてのネオアンチゲン及び免疫シグネチャーに関する検討2016

    • Author(s)
      垣見和宏
    • Organizer
      第20回日本がん免疫学会
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(大阪府・大阪市)
    • Year and Date
      2016-07-29 – 2016-07-29
    • Invited
  • [Remarks] 東京大学医学部附属病院 免疫細胞治療講座

    • URL

      http://immunoth.umin.jp/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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