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2015 Fiscal Year Research-status Report

哺乳類特異的な、RNAサイレンシングと抗ウイルス反応のクロストーク機構の解析

Research Project

Project/Area Number 15K19124
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

高橋 朋子  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (00738792)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
KeywordsRNAサイレンシング / 抗ウイルス反応
Outline of Annual Research Achievements

small interfering RNA (siRNA)、microRNA (miRNA)、PIWI-interacting RNA (piRNA)といった内在性の小分子二本鎖RNAは、RNAサイレンシングという塩基配列特異的な遺伝子発現抑制機構によって、広く多様な遺伝子機能を制御していることが知られている。本研究課題は、哺乳類細胞における、これら内在性の小分子ノンコーディングRNAによるRNAサイレンシング機構と、ウイルスなどの外来性RNAより励起されるインターフェロン応答を伴った免疫応答機構のクロストークを明らかにすることを目的としている。RNA サイレンシング機構とこのようなウイルスなどの外来性RNAに対する免疫応答機構は、共に2本鎖RNAによって駆動される機構であり、両者の間にはクロストークがあると想定されるが、その機構についてはこれまで全く明らかではなかった。
2015年度はマウスノックアウト細胞とルシフェラーゼ遺伝子を用いたレポーターアッセイ系によるRNAサイレンシング活性の測定実験や、リアルタイムPCRによる目的の遺伝子の発現量変化を測定することで、これらの経路に関与する因子の詳細な機能解析を行った。さらに近年開発された、ゲノム編集ツールとして知られるCRISPR/Cas9システムにより目的の遺伝子のノックアウト細胞株を樹立した。2016年度はこれらの細胞株を用いた解析を継続して行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

CRISPR/Cas9システムによるノックアウト細胞株の樹立なども含め、2016年度にむけて順調に解析が進んだため。

Strategy for Future Research Activity

2016年度は2015年度に樹立したノックアウト細胞株を用いて、より詳細な機能解析を行う予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2015 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Control of the localization and function of a miRNA silencing component TNRC6A by Argonaute protein.2015

    • Author(s)
      Nishi K, Takahashi T, Suzawa M, Miyakawa T, Nagasawa T, Ming Y, Tanokura M, Ui-Tei K.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 43 Pages: 9856-9873

    • DOI

      10.1093/nar/gkv1026

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The siRNA Non-Seed Region and its Target Sequences are Auxiliary Determinants of Off-Target Effects.2015

    • Author(s)
      Kamola PJ, Nakano Y, Takahashi T, Wilson PA, Ui-Tei K.
    • Journal Title

      PLoS Comput. Biol.

      Volume: 11 Pages: e1004656

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1004656

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nuclear transport of TNRC6A protein is regulated by the amount of Argonaute protein in the cytoplasm2015

    • Author(s)
      Yvelt Ming, Kenji Nishi, Tomoko Takahashi, Masataka Suzawa, Kumiko Ui-Tei
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
  • [Presentation] アポトーシス誘導によるRNAサイレンシング調節因子TRBPの機能変換2015

    • Author(s)
      高橋朋子、宮川拓也、善野修平、田之倉優、程久美子
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] RNAサイレンシングと抗ウイルス応答のクロストーク機構の解析2015

    • Author(s)
      中野悠子、高橋朋子、尾野本浩司、米山光俊、程久美子
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] 二本鎖RNA結合タンパク質TRBPとHIV-1 TAR RNAおよびmicroRNAとの相互作用2015

    • Author(s)
      小森千晶、高橋朋子、村上文則、程久美子
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] RNAサイレンシングに関わる二本鎖RNA結合タンパク質TRBPが結合するmicroRNAの網羅的解析2015

    • Author(s)
      村上 文則、高橋 朋子、程 久美子
    • Organizer
      新学術領域研究「ゲノム支援」 2015年度拡大班会議 (2015.8.27)
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館アネックスホール(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2015-08-27
  • [Presentation] RNAサイレンシング機構における二本鎖RNA結合タンパク質の機能解析2015

    • Author(s)
      中野悠子、高橋朋子、程久美子
    • Organizer
      第15回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学武田先端知ビル(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2015-06-27
  • [Presentation] Establishment of a target gene-specific and off-target effect-reduced RNAi system using chemical modifications affecting thermodynamics.2015

    • Author(s)
      Kumiko Ui-Tei, Hanna Iribe, Jastina Leo, Tomoko Takahashi
    • Organizer
      新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー:分子標的と活性制御」 第8回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学片平さくらホール(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-06-08
  • [Book] "核酸医薬の創製と応用展開" ノンコーディングRNAの生体機能と医薬応用の現状. 13-20.2015

    • Author(s)
      程久美子、高橋朋子
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Remarks]

    • URL

      http://ui-tei.rnai.jp/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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