2016 Fiscal Year Annual Research Report
Copy number variation analysis of schizophrenia and elucidation of molecular pathogenesis using bioinformatic approach
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15K19720
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
久島 周 名古屋大学, 高等研究院(医), 特任助教 (00732645)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ゲノムコピー数変異 / 統合失調症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1699名の統合失調症患者と824名の健常者を対象に高解像度アレイCGHを用いてゲノムコピー数変異（CNV）解析を実施し、7066個の稀な（<1%）CNVを得た。その中で、発症と関連するCNV（American College of Medical Geneticsの基準で判定）を患者153名（9.0%）、健常者26名（3.2%）で同定した。その上で、次の検討を行った。
１．臨床表現型解析：発症関連CNVをもつ患者108名の臨床表現型を後方視的に調べた結果、42%の患者で先天性疾患や発達上の問題を認めた。また抗精神病薬への治療反応性に関しては、発症関連CNVをもつ患者はそれ以外の患者と比較して、治療抵抗性を示す割合が有意に高いことを明らかにした（36% vs 17%, オッズ比=2.8, p=0.0036）。
２. 遺伝セット解析に基づく生物学的パスウェイの同定
患者と健常者で同定したCNVデータに基づいて、gene ontologyの遺伝子セットを用いて遺伝子セット解析を行い、患者CNVが優位に集積する生物学的パスウェイを探索した。その結果、53の遺伝子セットが有意（FDR q<0.01）になり、とくに31の遺伝子セットは既報の研究で関連が示唆されていた。これら31の遺伝子セットは、9つの機能的カテゴリー（oxidative stress response, genomic integrity, kinase, small GTPase signaling, synapse, cell adhesion等）に分類できた。この結果は統合失調症の分子病態の理解を深めるものである。特に酸化ストレスは既報で多数の報告があるが、本結果はその遺伝的基盤を明らかにした点で重要である。
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[Journal Article] High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan.2017
Author(s)
Kushima I, Aleksic B, Nakatochi M, Shimamura T, Shiino T, Yoshimi A, Kimura H, Takasaki Y, Wang C, Xing J, Ishizuka K, Oya-Ito T, Nakamura Y, Arioka Y, Maeda T, Yamamoto M,
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Journal Title
Mol Psychiatry.
Volume: 22
Pages: 430-440
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Identification of a rare variant in CHD8 that contributes to schizophrenia and autism spectrum disorder susceptibility.2016
Author(s)
Kimura H, Wang C, Ishizuka K, Xing J, Takasaki Y, Kushima I, Aleksic B, Uno Y, Okada T, Ikeda M, Mori D, Inada T, Iwata N, Ozaki N.
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Journal Title
Schizophr Res.
Volume: 178
Pages: 104-106
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Resequencing and Association Analysis of Six PSD-95-Related Genes as Possible Susceptibility Genes for Schizophrenia and Autism Spectrum Disorders.2016
Author(s)
Xing J, Kimura H, Wang C, Ishizuka K, Kushima I, Arioka Y, Yoshimi A, Nakamura Y, Shiino T, Oya-Ito T, Takasaki Y, Uno Y, Okada T, Iidaka T, Aleksic B, Mori D, Ozaki N.
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Journal Title
Sci Rep.
Volume: 6
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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