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2016 Fiscal Year Annual Research Report

水界面の分子構造とダイナミクスの解明および生体膜界面研究への展開

Research Project

Project/Area Number 16H04095
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

石山 達也  富山大学, 大学院理工学研究部(工学), 准教授 (10421364)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
Keywords水界面 / 分子動力学シミュレーション / 和周波発生スペクトル
Outline of Annual Research Achievements

水界面は,生体反応,大気反応など様々な場において重要な役割を演じているといわれている.その厚さは,分子数層程度の大変薄い領域であるにもかかわらず,反応性や物質透過性がバルクと異なっているため,近年,多くの実験,理論計算が行われてきた.本研究は,主に水界面の分子構造とダイナミクスを分子動力学シミュレーションにより解明することを目的としており,基礎的な空気/水界面の問題から脂質膜のような生体分子/水界面の問題を扱う.特に,界面水構造をプローブする唯一の実験観測量である和周波発生スペクトルを分子シミュレーションにより計算することにより,界面構造やダイナミクスの詳細を議論する.
今年度は,空気/水界面については,水の変角振動の問題,水素結合OH伸縮振動のダイナミクスの問題を理研グループとの共同研究として発表した.これまで,界面振動分光として用いられた和周波発生分光実験では水のOH伸縮振動領域のみ注目されてきたが,今回はHOH変角振動の問題を扱い,後者では比較的バルクの寄与が無視できないことが明らかになった.このことは,今後の変角スペクトルの基礎的知見を与えるものである.さらに,OH伸縮振動のダイナミクスに関しては,これまで界面第一層にある水の水素結合OHの振動緩和が遅いと主張されてきたにもかかわらず,本研究では,バルクと同程度に緩和が速いことが明らかになり,今後の界面反応等を考慮する際の重要な知見を与える成果が得られた.また,氷表面において表面第二層の融解の振る舞いが,マックスプランク研究所との共同研究で明らかになり,表面第二層の氷は250Kくらいの温度で段階的に融解することが明らかになった.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は,水表面については変角振動,振動ダイナミクスという新しい研究領域の開拓に関わる成果が得られた事に加え,氷表面の問題に関しても大変興味深い新たな知見が得られ,研究はおおむね順調に進展しているといえる.

Strategy for Future Research Activity

水界面については,生体膜/水界面における分子構造の問題にも取り組んでいる最中である.これまでは,脂質二重層膜として最も基本的な双性イオン型の1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (POPC)リン脂質/水界面の問題を扱い成果を報告したが,現在は,脂質分子の頭部基が異なる1,2-dipalmitoyl-sn-glycerol-3- phosphatidylethanolamine (DPPE)リン脂質/水界面の問題を扱っている.DPPEの問題では,頭部基にNH結合があり,OH伸縮振動領域と重なっているため慎重な考察が必要である.

  • Research Products

    (27 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] マックスプランク研究所(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      マックスプランク研究所
  • [Journal Article] Experimental and Theoretical Evidence for Bilayer-by-Bilayer Surface Melting of Crystalline Ice2017

    • Author(s)
      M. A. Sanchez , T. Kling , T. Ishiyama , M.-J. van Zadel , P. J Bisson , M. Mezger , M. N. Jochum , J. D. Cyran , W. J. Smit , H. J Bakker , M. J. Shultz , A. Morita , D. Donadio , Y. Nagata , M. Bonn and E. H. G. Backus
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: 114 Pages: 227-232

    • DOI

      www.pnas.org/lookup/suppl/doi:10.1073/pnas.1612893114/-/DCSupplemental.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Theoretical and Experimental Examination on SFG Polarization Analysis at Acetonitrile-Water Solution Surfaces2017

    • Author(s)
      K. Saito, Q. Peng, L. Qiao, L. Wang, T. Joutsuka, T. Ishiyama, S. Ye, and A. Morita
    • Journal Title

      ysical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 19 Pages: 8941-8961

    • DOI

      10.1039/C6CP08856B

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Computational Analysis of Vibrational Sum Frequency Generation Spectroscopy2017

    • Author(s)
      T. Ishiyama and A. Morita
    • Journal Title

      The Annual Review of Physical Chemistry

      Volume: 68 Pages: 1-22

    • DOI

      10.1146/annurev-physchem-052516-044806

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Efficient Spectral Diffusion at the Air/Water Interface Revealed by Femtosecond Time-Resolved Heterodyne-Detected Vibrational Sum Frequency Generation Spectroscopy2016

    • Author(s)
      K. Inoue, T. Ishiyama, S. Nihonyanagi, S. Yamaguchi, A. Morita, and T. Tahara
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 7 Pages: 1811-1815

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.6b00701

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Bend Vibration of Surface Water Investigated by Heterodyne-Detected Sum Frequency Generation and Theoretical Study: Dominant Role of Quadrupole2016

    • Author(s)
      A. Kundu, S. Tanaka, T. Ishiyama, M. Ahmed, K. Inoue, S. Nihonyanagi, H. Sawai, S. Yamaguchi, A. Morita, and T. Tahara
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 7 Pages: 2597-2601

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.6b00657

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 固体高分子中における水の再結晶化メカニズムの解明2016

    • Author(s)
      八十島 亘宏、源明 誠、石山 達也
    • Organizer
      第30回分子シミュレーション討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] 液体表面の分子シミュレーション手法の開発と展開2016

    • Author(s)
      石山達也
    • Organizer
      第30回分子シミュレーション討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • Invited
  • [Presentation] 固体高分子中の水の再結晶化メカニズムに関する分子シミュレーション2016

    • Author(s)
      八十島 亘宏、源明 誠、石山 達也
    • Organizer
      平成28年度日本化学会北陸地区講演会
    • Place of Presentation
      福井工業大学
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-25
  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションによる双性イオン膜に接する水の水素結合構造比較2016

    • Author(s)
      寺田 大地,石山 達也
    • Organizer
      平成28年度日本化学会北陸地区講演会
    • Place of Presentation
      福井工業大学
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-25
  • [Presentation] 固体高分子中の水の再結晶化現象に関する分子動力学研究2016

    • Author(s)
      八十島 亘宏、源明 誠、石山 達也
    • Organizer
      平成28年高分子学会北陸支部研究発表会
    • Place of Presentation
      福井大学
    • Year and Date
      2016-11-12 – 2016-11-13
  • [Presentation] Molecular dynamics simulation of time-resolved vibrational spectroscopy at air/water interface2016

    • Author(s)
      Tatsuya Ishiyama
    • Organizer
      The 4th International Conference on Molecular Simulation ( ICMS-2016)
    • Place of Presentation
      Shanghai
    • Year and Date
      2016-10-23 – 2016-10-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular dynamics study onrecrystallization of water in solid polymer2016

    • Author(s)
      Nobuhiro Yasoshima, Tatsuya Ishiyama
    • Organizer
      The 4th International Conference on Molecular Simulation ( ICMS-2016)
    • Place of Presentation
      Shanghai
    • Year and Date
      2016-10-23 – 2016-10-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Hydrogen bonding structures ofwater near lipid andsurfactant monolayerinterfaces revealed bymolecular dynamics simulation2016

    • Author(s)
      Terada Daichi, Tatsuya Ishiyama
    • Organizer
      The 4th International Conference on Molecular Simulation ( ICMS-2016)
    • Place of Presentation
      Shanghai
    • Year and Date
      2016-10-23 – 2016-10-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 異なる双性イオン膜/水界面における水の水素結合構造比較2016

    • Author(s)
      寺田 大地,石山 達也,森田 明弘
    • Organizer
      第10回分子科学討論会2016
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [Presentation] 和周波発生振動分光による結晶氷表面の水素結合構造の解明2016

    • Author(s)
      杉本 敏樹,大槻 友志,石山 達也,森田 明弘,渡邊 一也,松本 吉泰
    • Organizer
      第10回分子科学討論会2016
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [Presentation] 赤外-可視和周波発生振動分光法と分子動力学計算を用いたイオン液体/アルコール界面構造の研究2016

    • Author(s)
      岩橋 崇,石山 達也,森田 明弘,Kim Doseok,大内 幸雄
    • Organizer
      第10回分子科学討論会2016
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [Presentation] 固体高分子中の水の再結晶化に関する分子動力学研究2016

    • Author(s)
      八十島 亘宏、源明 誠、石山 達也
    • Organizer
      第10回分子科学討論会2016
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [Presentation] 水/アセトニトリル溶液の界面配向構造解析に関する理論的および実験的研究2016

    • Author(s)
      齋藤 健吾,王 琳,城塚 達也,石山 達也,彭 奇齢,叶 深,森田 明弘
    • Organizer
      第10回分子科学討論会2016
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [Presentation] Molecular structure and vibrational spectroscopic response of water at interfaces: A molecular dynamics study2016

    • Author(s)
      Tatsuya Ishiyama
    • Organizer
      第7回SFG研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular Dynamics Study on Diffusion Behavior of Water in Solid Polymer2016

    • Author(s)
      Nobuhiro YASOSHIMA, Makoto GEMMEI-IDE, and Tatsuya ISHIYAMA
    • Organizer
      第7回SFG研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-11
  • [Presentation] コンピューターシミュレーションで探る水界面の分子構造2016

    • Author(s)
      石山 達也
    • Organizer
      イブニング技術交流サロン
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-06-03 – 2016-06-03
  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションによる双性イオンリン脂質膜近傍における水の水素結合構造と振動分光解析2016

    • Author(s)
      寺田 大地、石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      第65回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-05-25 – 2016-05-27
  • [Presentation] 赤外分光法および分子動力学法を用いたポリアクリレート中の水の再結晶化挙動に関する研究2016

    • Author(s)
      福岡 瑞希、八十島 亘宏、加賀谷 重浩、北野 博巳、石山 達也、源明 誠
    • Organizer
      第65回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-05-25 – 2016-05-27
  • [Presentation] 固体高分子中の水の拡散挙動に関する分子動力学研究2016

    • Author(s)
      八十島 亘宏、福岡 瑞希、加賀谷 重浩、北野 博巳、源明 誠、石山 達也
    • Organizer
      第65回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-05-25 – 2016-05-27
  • [Presentation] 空気/水界面における二次元和周波スペクトルの分子動力学計算2016

    • Author(s)
      石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      第19回 理論化学討論会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-05-23 – 2016-05-25
  • [Remarks]

    • URL

      http://www3.u-toyama.ac.jp/comp/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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