• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

水界面の分子構造とダイナミクスの解明および生体膜界面研究への展開

Research Project

Project/Area Number 16H04095
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

石山 達也  富山大学, 大学院理工学研究部(工学), 准教授 (10421364)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
Keywords分子動力学シミュレーション / 和周波発生分光法 / 界面 / リン脂質膜 / 水 / 2価カチオン
Outline of Annual Research Achievements

本年度は主にPhosphatidylethanolamine(PE)膜について,その単分子膜と水溶液界面での分子構造と和周波分光計算の検討を行った。特に2価カチオンであるCa2+とMg2+の効果について報告する。コリン基をもつDipalmitoylphosphatidylcholine(PC)膜と比べて,アミノ基をもつPE膜は頭部基が比較的小さいので,膜がパッキングしやすいことが知られている。そのため,PE膜頭部基に水が入り込みにくくなり,PC膜界面に比べてPE膜界面で水の配向構造が弱くなり,和周波虚部スペクトルも減少することが計算から明らかになった。次にCa2+の膜への吸着構造を調べるために,1.2M程度の濃度のCaCl2水溶液をPCとPE膜に接触させ,そのイオン分布を計算したところ,以下の知見を得た。DPPC膜は比較的パッキングが弱いため,マイナス電荷を帯びたリン酸基にCa2+が入り込むような構造がみられたが,一方DPPE膜はパッキングが強いためCa2+がリン酸基に入り込む構造は見られなかった。次にMg2+の界面吸着構造を調べたところ,興味深いことにDPPC,DPPE膜共に吸着構造は見られなかった。これは,Mg2+に対する溶媒和自由エネルギーがCa2+と比べて3倍ほど大きく,溶媒和殻がかなり安定であるため,それを壊して膜のリン酸基に吸着することが難しいことに起因すると考えられる。実際に動径分布関数を計算したところ,Ca2+に比べてMg2+のfirst peakがかなり大きくなることが明らかになった。これは,Mg2+のイオン半径がCa2+よりもかなり小さいことによると考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

もともとは,Dipalmitoylphosphatidylcholine(PC)膜の水,あるいは水溶液界面構造の研究に多少時間がかかることを想定していたが,その研究は昨年度に完了し,今年度はPhosphatidylethanolamine(PE)膜の界面イオン分布まで研究を展開できたのは,順調に研究が進展させることができた証拠であると考えている。

Strategy for Future Research Activity

今後の研究の展開としては,Cholesterol単分子膜,あるいはSphingomyelin単分子膜の水構造と和周波スペクトルの理論計算を行い,界面特有の分子構造を議論する予定である。特に,Sphingomyelinはリン脂質のなかで,PCとPEに次ぐ主要成分のひとつであり,分子内に水酸基やアミノ基を有しているので,それらの界面構造への影響について焦点をあてて研究していく予定である。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Molecular structure and vibrational spectra at water/poly(2-methoxyethylacrylate) and water/poly(methyl methacrylate) interfaces: A molecular dynamics simulation study2019

    • Author(s)
      Sho Kishinaka, Akihiro Morita, and Tatsuya Ishiyama
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 150 Pages: 044707

    • DOI

      https://doi.org/10.1063/1.5074144

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Topologically disordered mesophase at the topmost surface layer of crystalline ice between 120 and 200 K2019

    • Author(s)
      Toshiki Sugimoto, Yuji Otsuki, Tatsuya Ishiyama, Akihiro Morita, Kazuya Watanabe, and Yoshiyasu Matsumoto
    • Journal Title

      PHYSICAL REVIEW B

      Volume: 99 Pages: 121402

    • DOI

      https://doi.org/10.1103/PhysRevB.99.121402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stimuli-Responsive Room-Temperature N-Heteroacene Liquid: In Situ Observation of the Self-Assembling Process and Its Multiple Properties2019

    • Author(s)
      Kyosuke Isoda, Tatsuya Ishiyama, Yuichiro Mutoh, and Daisuke Matsukuma
    • Journal Title

      ACS Applied Materials and Interfaces

      Volume: 11 Pages: 12053-12062

    • DOI

      10.1021/acsami.8b21695

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションによるアクリレートポリマー/水界面の分子構造 の解明2018

    • Author(s)
      岸中翔, 森田明弘, 石山達也
    • Organizer
      第12回分子科学討論会
  • [Presentation] アクリレートポリマー/水界面における分子構造と振動和周波スペクトルの分 子動力学シミュレーション2018

    • Author(s)
      岸中翔, 森田明弘, 石山達也
    • Organizer
      第32回分子シミュレーション討論会
  • [Presentation] 分子シミュレーションによるアルコール単分子膜/水溶液界面での酸解離定数 の決定2018

    • Author(s)
      吉田 俊将,森田 明弘,石山 達也
    • Organizer
      第12回分子科学討論会
  • [Presentation] アルコール単分子膜/水溶液界面での酸解離に関する分子動力学シミュレー ション2018

    • Author(s)
      吉田俊将,城塚達也,森田明弘,石山達也
    • Organizer
      第32回分子シミュレーション討論会
  • [Presentation] Structure and Vibrational Spectra at Complex Aqueous Interfaces Revealed by Molecular Dynamics Simulation2018

    • Author(s)
      Tatsuya Ishiyama
    • Organizer
      8th SFG Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 富山大学理工学研究部 計算物理化学研究室

    • URL

      http://www3.u-toyama.ac.jp/comp/

URL: 

Published: 2019-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi