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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Development of houndshark nanodoy by combination of wheat cell-free and NGS technologies

Research Project

Project/Area Number 16H04729
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

澤崎 達也  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (50314969)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsタンパク質 / ナノボディ / 無細胞 / 抗体 / サメ / Fukabody / ドチザメ
Outline of Annual Research Achievements

前年度は、Fukabodyの評価系の構築を目指し、ドチザメ科IgNAR遺伝子のクローニングを行った。さらにVenusタンパク質を モデルに、ドチザメの1種で愛媛県沖で入手が容易なエイラクブカのFukabody(愛媛県産サメ抗体の名称)の単離、抗体価評価に成功した。得られた抗VenusFukabodyを用いてFukabodyの評価系の構築を行った。本年度は、次世代シークエンス技術を基盤としたエイラクブカのFukabody遺伝子のクローン化技術の開発を行った。これら一連の実験から、エイラクブカFukabody技術の開発の全容と、企業化に向けた課題も明らかとなった。
III.次世代シークエンス技術を用いたFukabodyのクローン化技術の確立
1) 次世代シークエンス技術を用いたエイラクブカFukabody遺伝子のシークエンス
現時点でサメの抗体産生細胞のハイブリドーマ化は不可能であり、また抗体産生細胞マーカーの存在も未解明であるため、抗体産生細胞の濃縮は困難である。そこで本年度は近年技術革新が目覚ましい次世代シークエンス技術による可変領域Amplicon sequencingデータを用いた。上記のVenusタンパク質を免疫したエイラクブカを用いてファージライブラリーを作成し、抗原を用いたバイオパンニング前と3回までのバイオパンニング後の各ライブラリーを次世代シークエンスにより解析したところ、バイオパンニングごとに濃縮されるFukabody遺伝子が見出され、それらは抗原への結合能を有していた。この結果、次世代シークエンス技術を用いて抗原特異的エイラクブカFukabody遺伝子の単離法が確立できた。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] PIM kinases facilitate lentiviral evasion from SAMHD1 restriction via Vpx phosphorylation2019

    • Author(s)
      Miyakawa Kei、Matsunaga Satoko、Yokoyama Masaru、Nomaguchi Masako、Kimura Yayoi、Nishi Mayuko、Kimura Hirokazu、Sato Hironori、Hirano Hisashi、Tamura Tomohiko、Akari Hirofumi、Miura Tomoyuki、Adachi Akio、Sawasaki Tatsuya、Yamamoto Naoki、Ryo Akihide
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 1844

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09867-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The malaria parasite RhopH protein complex interacts with erythrocyte calmyrin identified from a comprehensive erythrocyte protein library2018

    • Author(s)
      Miura Toyokazu、Takeo Satoru、Ntege Edward H.、Otsuki Hitoshi、Sawasaki Tatsuya、Ishino Tomoko、Takashima Eizo、Tsuboi Takafumi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 500 Pages: 261~267

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.04.056

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Engineered membrane protein antigens successfully induce antibodies against extracellular regions of claudin-52018

    • Author(s)
      Hashimoto Yosuke、Zhou Wei、Hamauchi Kohtaroh、Shirakura Keisuke、Doi Takefumi、Yagi Kiyohito、Sawasaki Tatsuya、Okada Yoshiaki、Kondoh Masuo、Takeda Hiroyuki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 8383

    • DOI

      10.1038/s41598-018-26560-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The ubiquitin ligase RNF38 promotes RUNX1 ubiquitination and enhances RUNX1-mediated suppression of erythroid transcription program2018

    • Author(s)
      Yonezawa Taishi、Takahashi Hirotaka、Shikata Shiori、Sawasaki Tatsuya、Kitamura Toshio、Goyama Susumu
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 505 Pages: 905~909

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.10.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Amyloid β directly interacts with NLRP3 to initiate inflammasome activation: identification of an intrinsic NLRP3 ligand in a cell-free system2018

    • Author(s)
      Nakanishi Ayaka、Kaneko Naoe、Takeda Hiroyuki、Sawasaki Tatsuya、Morikawa Shinnosuke、Zhou Wei、Kurata Mie、Yamamoto Toshihiro、Akbar Sheikh Mohammad Fazle、Zako Tamotsu、Masumoto Junya
    • Journal Title

      Inflammation and Regeneration

      Volume: 38 Pages: 27

    • DOI

      10.1186/s41232-018-0085-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Ring-Type E3 Ubiquitin Ligase JUL1 Targets the VQ-Motif Protein JAV1 to Coordinate Jasmonate Signaling2018

    • Author(s)
      Ali Mohamed R.M.、Uemura Takuya、Ramadan Abdelaziz、Adachi Kyoko、Nemoto Keiichirou、Nozawa Akira、Hoshino Ryosuke、Abe Hiroshi、Sawasaki Tatsuya、Arimura Gen-ichiro
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 179 Pages: 1273~1284

    • DOI

      10.1104/pp.18.00715

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] チロシンリン酸化によるジベレリン応答の新しい制御機構2018

    • Author(s)
      根本圭一郎、澤崎達也
    • Journal Title

      バイオインダストリー

      Volume: 76 Pages: 232~225

  • [Presentation] くすりはタンパク質を狙う2018

    • Author(s)
      澤崎達也
    • Organizer
      第91回日本薬理学会年会/第 18 回国際薬理学・臨床薬理学会議(WCP2018)|市民公開講座
    • Invited
  • [Presentation] コムギ無細胞系を基盤とした薬剤開発技術2018

    • Author(s)
      澤崎達也
    • Organizer
      第18回 日本蛋白質科学会
    • Invited
  • [Presentation] コムギ胚芽無細胞系を用いたヒトデcaspase-3/9とsfApaf-1の合成2018

    • Author(s)
      高岡幸恵、竹田浩之、岩崎隆宏、澤崎達也、千葉和義
    • Organizer
      第41回分子生物学会年会
  • [Presentation] Acceleration of RNA biology-targeting drug discovery in cancer using cell-free technology2018

    • Author(s)
      竹田浩之、澤崎達也
    • Organizer
      第77回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Remarks] 澤崎研のホームページ

    • URL

      http://www.pros.ehime-u.ac.jp/cell-free/index.html

URL: 

Published: 2019-12-27  

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