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2018 Fiscal Year Annual Research Report

The involvement of amino acid mutations of the capsid ptoteins of enterovirus A71 in viral genetic diversity and neuropathogenesis

Research Project

Project/Area Number 16H05200
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

清水 博之  国立感染症研究所, ウイルス第二部, 室長 (90270644)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
Keywordsエンテロウイルス / エンテロウイルス71 / エンテロウイルスA71 / PSGL-1 / 動物モデル / 受容体 / 手足口病
Outline of Annual Research Achievements

エンテロウイルスA71(EV-A71)は、手足口病の主要な原因ウイルスであるとともに、小児を中心とした致死的EV71脳炎を含む重症中枢神経疾患発症に関与する。しかし、EV-A71感染における重症中枢神経疾患の発症機構は明らかにされておらず、ヒトにおける重篤化を規定するウイルス側・宿主側因子は特定されていない。EV-A71カプシド蛋白質の特定のアミノ酸(VP1-145等)は、分離株間で多様性を有し、①PSGL-1受容体特異性、②マウスモデルにおける病原性、③中和抗原性エピトープ、④ヘパラン硫酸結合性、⑤ヒトEV-A71感染重篤化への関与の可能性等、さまざまなウイルス表現型に関与する。我々は、「宿主におけるエンテロウイルス71カプシド適応変異と受容体特異性・病原性の変化[基盤研究B](平成25年~平成28年)」により、特定のEV-A71カプシドアミノ酸(VP1-145等)は、カニクイザル感染個体内で速やかに変異し、quasi-speciesを生じることを明らかにした。EV-A71感染マウスモデルの改良を図るため、ヒト受容体特異性を反映した機能の異なるEV-A71受容体を発現したノックインマウスの作製を進め、EV-A71感染実験を開始した。さらに、感染動物組織等からEV-A71カプシド遺伝子を直接増幅し、次世代シークエンス解析により感染個体内におけるEV-A71ゲノム変異およびquasi-speciesの出現を網羅的かつ定量的に解析する手法を検討した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

我々は、「宿主におけるエンテロウイルス71カプシド適応変異と受容体特異性・病原性の変化[基盤研究B](平成25年~平成28年)」によるカニクイザル感染実験により、PSGL-1結合性を含む多様なウイルス学的性状および神経病原性を規定する特定のEV-A71カプシドアミノ酸(VP1-145等)は、感染個体内で速やかに変異し、quasi-speciesを生じ、異なる遺伝子型のEV-A71株においてもVP1-145が病原性を規定すること、VP1-145EからVP1-145Gへのアミノ酸変異がカニクイザルにおけるEV-A71弱毒化に関与することを確認した。EV-A71感染マウスモデルの改良を図るため、ヒト受容体特異性を反映した機能の異なる複数のEV-A71受容体を単独あるいは同時に発現するヘテロノックインマウスの交配を進め、ホモノックインマウスの系統を樹立した。これらのマウスを用いてEV-A71感染予備実験を試みたが、重篤な症状は観察されなかった。マウス等感染動物組織等から、培養細胞によるウイルス分離を経ずにEV-A71カプシド遺伝子を増幅し、次世代シークエンス解析により個体内変異およびquasi-speciesの出現を網羅的かつ定量的に解析するための条件検討を進め、ランダムプライマーを用いた非特異的遺伝子増幅、および、高感度カプシド遺伝子増幅法であるECRA法等エンテロウイルス特異的プライマーを用いた方法による次世代シークエンス解析による検出感度や遺伝子解析精度を比較し、検出・解析方法の至適化を図った。

Strategy for Future Research Activity

EV-A71ゲノム分子進化の過程で生じる多様な表現型を示すEV-A71バリアントの個体内・個体間適応戦略の解析を進めることにより、EV-A71による神経病原性発現機構の解明が期待できる。EV-A71感染マウスモデルの改良を図るため、ヒト受容体特異性を反映した機能の異なる複数のEV-A71受容体を単独あるいは同時に発現するヘテロノックインマウスの交配を進め、ホモノックインマウスの系統を樹立した。受容体導入ノックインマウスにEV-A71株を脳内接種し病原性の発現を確認したが、いまのところ、いずれのノックインマウスにおいても、顕著な臨床症状は観察されていない。原因としては、①感染実験に使用したEV-A71株のもつ病原性が元々低かった、②マウス体内でヒト受容体が十分に発現していなかった、③感染に使用したマウスの週齢が適切ではなかった、などが考えられた。今後、マウス組織におけるヒト受容体発現の確認を進めるとともに、種々のEV-A71分離株を用いた感染実験を実施する。さらに、様々な週齢のマウスを用いて感染実験の至適条件を検討する。

  • Research Products

    (21 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 12 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results) Book (3 results)

  • [Int'l Joint Research] NIHE(ベトナム)

    • Country Name
      VIET NAM
    • Counterpart Institution
      NIHE
  • [Journal Article] Serial MRI findings of acute flaccid myelitis during an outbreak of enterovirus D68 infection in Japan2019

    • Author(s)
      Okumura Akihisa、Mori Harushi、Fee Chong Pin、Kira Ryutaro、Torisu Hiroyuki、Yasumoto Sawa、Shimizu Hiroyuki、Fujimoto Tsuguto、Tanaka-Taya Keiko
    • Journal Title

      Brain and Development

      Volume: 41 Pages: 443~451

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2018.12.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polio vaccination coverage and seroprevalence of poliovirus antibodies after the introduction of inactivated poliovirus vaccines for routine immunization in Japan2019

    • Author(s)
      Satoh Hiroshi、Tanaka-Taya Keiko、Shimizu Hiroyuki、Goto Akiko、Tanaka Shizuka、Nakano Tsuyoshi、Hotta Chiemi、Okazaki Terue、Itamochi Masae、Ito Miyabi、Okamoto-Nakagawa Reiko、Yamashita Yasutaka、Arai Satoru、Okuno Hideo、Morino Saeko、Oishi Kazunori
    • Journal Title

      Vaccine

      Volume: 37 Pages: 1964~1971

    • DOI

      10.1016/j.vaccine.2019.02.034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Notes from the Field: Circulating Vaccine-Derived Poliovirus Type 1 and Outbreak Response ? Papua New Guinea, 20182019

    • Author(s)
      Bauri Mathias、Wilkinson Amanda L.、Ropa Berry、Feldon Keith、Snider Cynthia J.、Anand Abhijeet、Tallis Graham、Boualam Liliane、Grabovac Varja、Avagyan Tigran、Reza Mohammad S.、Mekonnen Dessie、Zhang Zaixing、Thorley Bruce R.、Shimizu Hiroyuki、Apostol Lea Necitas G.、Takashima Yoshihiro
    • Journal Title

      MMWR. Morbidity and Mortality Weekly Report

      Volume: 68 Pages: 119~120

    • DOI

      10.15585/mmwr.mm6805a6

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular Epidemiology and Clinical Features of Rotavirus Infection Among Pediatric Patients in East Java, Indonesia During 2015?2018: Dynamic Changes in Rotavirus Genotypes From Equine-Like G3 to Typical Human G1/G32019

    • Author(s)
      Athiyyah Alpha Fardah、Utsumi Takako、Wahyuni Rury Mega、et al.
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 10 Pages: in press

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.00940

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular characterization of enterovirus-A71 in children with acute flaccid paralysis in the Philippines2019

    • Author(s)
      Apostol Lea Necitas、Shimizu Hiroyuki、Suzuki Akira、Umami Rifqiyah Nur、Jiao Maria Melissa Ann、Tandoc Amado、Saito Mariko、Lupisan Socorro、Oshitani Hitoshi
    • Journal Title

      BMC Infectious Diseases

      Volume: 19 Pages: in press

    • DOI

      10.1186/s12879-019-3955-x

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Detection of nineteen enteric viruses in raw sewage in Japan2018

    • Author(s)
      Thongprachum Aksara、Fujimoto Tsuguto、Takanashi Sayaka、Saito Hiroyuki、Okitsu Shoko、Shimizu Hiroyuki、Khamrin Pattara、Maneekarn Niwat、Hayakawa Satoshi、Ushijima Hiroshi
    • Journal Title

      Infection, Genetics and Evolution

      Volume: 63 Pages: 17~23

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2018.05.006

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Establishment of the 1st WHO International Standard for anti-EV71 serum (Human)2018

    • Author(s)
      Cooper Gillian、Mao Qunying、Crawt Laura、Wang Yiping、Dougall Thomas、Rigsby Peter、Liang Zhenglun、Xu Miao、Minor Philip、Wang Junzhi、Martin Javier
    • Journal Title

      Biologicals

      Volume: 53 Pages: 39~50

    • DOI

      10.1016/j.biologicals.2018.03.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] VP1 Amino Acid Residue 145 of Enterovirus 71 Is a Key Residue for Its Receptor Attachment and Resistance to Neutralizing Antibody during Cynomolgus Monkey Infection2018

    • Author(s)
      Fujii Ken、Sudaka Yui、Takashino Ayako、Kobayashi Kyousuke、Kataoka Chikako、Suzuki Tadaki、Iwata-Yoshikawa Naoko、Kotani Osamu、Ami Yasushi、Shimizu Hiroyuki、Nagata Noriyo、Mizuta Katsumi、Matsuzaki Yoko、Koike Satoshi
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 92 Pages: in press

    • DOI

      10.1128/JVI.00682-18

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Equine-like G3 rotavirus strains as predominant strains among children in Indonesia in 2015?20162018

    • Author(s)
      Utsumi Takako、Wahyuni Rury Mega、Doan Yen Hai、Dinana Zayyin、Soegijanto Soegeng、Fujii Yoshiki、Juniastuti、Yamani Laura Navika、Matsui Chieko、Deng Lin、Abe Takayuki、Soetjipto、Lusida Maria Inge、Ishii Koji、Shimizu Hiroyuki、Katayama Kazuhiko、Shoji Ikuo
    • Journal Title

      Infection, Genetics and Evolution

      Volume: 61 Pages: 224~228

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2018.03.027

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Epidemic dynamics, interactions and predictability of enteroviruses associated with hand, foot and mouth disease in Japan2018

    • Author(s)
      Takahashi Saki、Metcalf C. Jessica E.、Arima Yuzo、Fujimoto Tsuguto、Shimizu Hiroyuki、Rogier van Doorn H.、Le Van Tan、Chan Yoke-Fun、Farrar Jeremy J.、Oishi Kazunori、Grenfell Bryan T.
    • Journal Title

      Journal of The Royal Society Interface

      Volume: 15 Pages: in press

    • DOI

      10.1098/rsif.2018.0507

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Novel Combination Therapy for Human Oxaliplatin-resistant Colorectal Cancer Using Oxaliplatin and Coxsackievirus A112018

    • Author(s)
      WANG BEIBEI、OGATA HISANOBU、TAKISHIMA YUTO、MIYAMOTO SHOHEI、INOUE HIROYUKI、KURODA MASAKI、YAMADA KAZUNARI、HIJIKATA YASUKI、MURAHASHI MUTSUNORI、SHIMIZU HIROYUKI、OKAZAKI TOSHIHIKO、NAKANISHI YOICHI、TANI KENZABURO
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: 38 Pages: 6121~6126

    • DOI

      10.21873/anticanres.12963

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nationwide Survey of Pediatric Inpatients With Hand, Foot, and Mouth Disease, Herpangina, and Associated Complications During an Epidemic Period in Japan: Estimated Number of Hospitalized Patients and Factors Associated With Severe Cases2018

    • Author(s)
      Takechi Maria、Fukushima Wakaba、Nakano Takashi、Inui Miki、Ohfuji Satoko、Kase Tetsuo、Ito Kazuya、Kondo Kyoko、Maeda Akiko、Shimizu Hiroyuki、Hirota Yoshio
    • Journal Title

      Journal of Epidemiology

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.2188/jea.JE20180060

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] An Outbreak of Enterovirus D68 in August-December 2015 in Japan as an emerging“neurovirulent” enterovirus infection2018

    • Author(s)
      Shimizu H
    • Organizer
      Lessons Learned since 1998 Enterovirus A71 Epidemic in Taiwan Contributions and Implications
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Cis-allosteric regulation of the interaction surfaces of enterovirus A71 capsid protein by the VP1 single amino acid residue at position 1452018

    • Author(s)
      Kotani O, Yokoyama M, Fujii K, Kobayashi K, Nishimura Y, Nagata N, Shimizu H, Koike S, Sato H
    • Organizer
      Europic 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of a flaccid paralysis mouse model after infection with enterovirus D682018

    • Author(s)
      Miyazaki M, Saito H, Shibata C, Yen DH, Arao Y, Iwata-Yoshikawa N, Hasegawa H, Shimizu H, Nagata N
    • Organizer
      Europic 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pathogenicity of recent Coxsackievirus B2 isolates in adult mice2018

    • Author(s)
      Nagata N, Iwata-Yoshikawa N, Doan YH, Shimizu H, Hasegawa H.
    • Organizer
      Europic 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A cluster of cases with acute flaccid myelitis coincident with an enterovirus D68 outbreak in Japan, 2015,A respiratory“neurovirulent”? enterovirus.2018

    • Author(s)
      Shimizu H
    • Organizer
      International Workshop on Laboratory Diagnosis for Enterovirus
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] ウイルス検査法2018

    • Author(s)
      清水博之
    • Total Pages
      382
    • Publisher
      日本臨床ウイルス学会
    • ISBN
      978-4-915698-13-2C3047
  • [Book] ワクチン― 基礎から臨床まで ―2018

    • Author(s)
      中野貴司、清水博之
    • Total Pages
      350
    • Publisher
      日本ワクチン学会
  • [Book] グローバル時代のウイルス感染症2018

    • Author(s)
      清水博之
    • Total Pages
      279
    • Publisher
      日本医事新報社

URL: 

Published: 2019-12-27  

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