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2016 Fiscal Year Annual Research Report

上皮間葉転換(EMT)を指標とした新規腫瘍診断法の構築

Research Project

Project/Area Number 16H05230
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

木村 弥生  横浜市立大学, 先端医科学研究センター, 准教授 (80391936)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大島 貴  横浜市立大学, 医学部, 准教授 (10448665)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsプロテオミクス / 上皮間葉転換 / 診断法 / 癌
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、上皮間葉転換(EMT)誘導に着目し、様々な固形癌で、明確な診断基準となる腫瘍組織・血清を用いた新規診断法を確立することを目指している。そために、本年度は、以下の研究を行った。
1.申請者らが見出したEMTに関係し、早期肺腺癌の予後とも関連がある1種類のタンパク質およびそのリン酸化に着目し、血清中での定量解析技術を検討した。その結果、血清中タンパク質濃度が低く、免疫沈降法とウエスタンブロッティング法を組み合わせた方法でのみ検出可能であることがわかった。また、このタンパク質は様々な翻訳後修飾を受け、複数のタンパク質フォームとして存在していること、健常者においても一部フォームは強く発現していることが明らかになった。また、大腸癌および胃癌組織を用いて、患者毎に癌部と非癌部、予後良好と不良群に分けて検討を行ったが、組織においても複数のフォームが確認され、さらには個人差が大きいことがわかった。
2.申請者らが見出したEMTに関係する2種類のチロシンキナーゼ型レセプターについては、TGFβ刺激によりリガンド量が増加した結果、これらタンパク質のリン酸化が亢進する可能性が示唆された。
3. 質量分析装置を用いたプロテオーム解析により、大腸癌および胃癌患者組織を用いて新たな診断マーカー候補タンパク質の探索を行った。その結果、新たなEMT関連タンパク質を見出すことができた。
4.血清を用いた、新たなプロテオーム解析法の開発を遂行中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では、近年申請者らが見出したEMT誘導に関係し、早期肺腺癌の予後とも関連がある4種類のタンパク質リン酸化に着目した新規腫瘍診断法の確立を目指した研究を遂行している。しかし、様々な検討を行った結果、診断法確立には、当初予定よりも多くの時間を要することがわかった。そこで、これらタンパク質に着目した腫瘍診断法の確立と並行して、各タンパク質およびそのリン酸化が関与するEMT誘導メカニズムを明らかにし、その関連タンパク質群も新たな診断バイオマーカーとして活用する研究に着手した。
また、本研究では、様々な固形癌の患者血清および組織などの、貴重な臨床検体を幅広く収集している。そこで、これら臨床検体を用いて、より明確な腫瘍診断基準となる、新たなEMT関連タンパク質を探索するプロテオーム解析研究にも着手し、EMT誘導との関連性や診断バイオマーカーとしての有用性の検討を開始している。

Strategy for Future Research Activity

研究は、若干の方向転換を余儀なくされているが、申請者らが見出したEMT関連性タンパク質やそのリン酸化に着目した研究では、新たな成果が順調に得られている。また、臨床検体を用いたプロテオーム解析による新たなEMT関連タンパク質探索研究についても順調に進んでおり、現時点で大きな障壁は見られない。

  • Research Products

    (24 results)

All 2016

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 7 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Biological significance of co- and post-translational modifications of the yeast 26S proteasome2016

    • Author(s)
      Hirano Hisashi、Kimura Yayoi、Kimura Ayuko
    • Journal Title

      Journal of Proteomics

      Volume: 134 Pages: 37~46

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.11.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Changes in the Proteome of Xylem Sap in Brassica oleracea in Response to Fusarium oxysporum Stress2016

    • Author(s)
      Pu Zijing、Ino Yoko、Kimura Yayoi、Tago Asumi、Shimizu Motoki、Natsume Satoshi、Sano Yoshitaka、Fujimoto Ryo、Kaneko Kentaro、Shea Daniel J.、Fukai Eigo、Fuji Shin-Ichi、Hirano Hisashi、Okazaki Keiichi
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 7 Pages: 31

    • DOI

      10.3389/fpls.2016.00031

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Relationship between phosphorylation of sperm-specific antigen and prognosis of lung adenocarcinoma2016

    • Author(s)
      Okayama Akiko、Kimura Yayoi、Miyagi Yohei、Oshima Takashi、Oshita Fumihiro、Ito Hiroyuki、Nakayama Haruhiko、Nagashima Takuya、Rino Yasushi、Masuda Munetaka、Ryo Akihide、Hirano Hisashi
    • Journal Title

      Journal of Proteomics

      Volume: 139 Pages: 60~66

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2016.03.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of glycosylphosphatidylinositol-anchored proteins and ω-sites using TiO2-based affinity purification followed by hydrogen fluoride treatment2016

    • Author(s)
      Masuishi Yusuke、Kimura Yayoi、Arakawa Noriaki、Hirano Hisashi
    • Journal Title

      Journal of Proteomics

      Volume: 139 Pages: 77~83

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2016.03.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Data for identification of GPI-anchored peptides and ω-sites in cancer cell lines2016

    • Author(s)
      Masuishi Yusuke、Kimura Yayoi、Arakawa Noriaki、Hirano Hisashi
    • Journal Title

      Data in Brief

      Volume: 7 Pages: 1302~1305

    • DOI

      10.1016/j.dib.2016.04.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Micro?adhesion rings surrounding TCR microclusters are essential for T cell activation2016

    • Author(s)
      Hashimoto-Tane Akiko、Sakuma Machie、Ike Hiroshi、Yokosuka Tadashi、Kimura Yayoi、Ohara Osamu、Saito Takashi
    • Journal Title

      The Journal of Experimental Medicine

      Volume: 213 Pages: 1609~1625

    • DOI

      10.1084/jem.20151088

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Intrinsically Disordered Protein Atg13 Mediates Supramolecular Assembly of Autophagy Initiation Complexes2016

    • Author(s)
      Yamamoto Hayashi、Fujioka Yuko、Suzuki Sho?W.、Noshiro Daisuke、Suzuki Hironori、Kondo-Kakuta Chika、Kimura Yayoi、Hirano Hisashi、Ando Toshio、Noda Nobuo?N.、Ohsumi Yoshinori
    • Journal Title

      Developmental Cell

      Volume: 38 Pages: 86~99

    • DOI

      10.1016/j.devcel.2016.06.015

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lyn Kinase Suppresses the Transcriptional Activity of IRF5 in the TLR-MyD88 Pathway to Restrain the Development of Autoimmunity2016

    • Author(s)
      Ban Tatsuma、Sato Go R.、Nishiyama Akira、Akiyama Ai、Takasuna Marie、Umehara Marina、Suzuki Shinsuke、Ichino Motohide、Matsunaga Satoko、Kimura Ayuko、Kimura Yayoi、et al.
    • Journal Title

      Immunity

      Volume: 45 Pages: 319~332

    • DOI

      10.1016/j.immuni.2016.07.015

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comprehensive behavioral study and proteomic analyses of CRMP2-deficient mice2016

    • Author(s)
      Nakamura Haruko、Yamashita Naoya、Kimura Ayuko、Kimura Yayoi、Hirano Hisashi、Makihara Hiroko、Kawamoto Yuko、Jitsuki-Takahashi Aoi、Yonezaki Kumiko、Takase Kenkichi、Miyazaki Tomoyuki、Nakamura Fumio、Tanaka Fumiaki、Goshima Yoshio
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 21 Pages: 1059~1079

    • DOI

      10.1111/gtc.12403

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Clinical significance of platelet-derived growth factor receptor-β gene expression in stage II/III gastric cancer with S-1 adjuvant chemotherapy2016

    • Author(s)
      Higuchi Akio、Oshima Takashi、Yoshihara Kazue、Sakamaki Kentaro、Aoyama Toru、Suganuma Nobuyasu、Yamamoto Naoto、Sato Tsutomu、Cho Haruhiko、Shiozawa Manabu、Yoshikawa Takaki、Rino Yasushi、Kunisaki Chikara、Imada Toshio、Masuda Munetaka
    • Journal Title

      Oncology Letters

      Volume: 13 Pages: 905~911

    • DOI

      10.3892/ol.2016.5494

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Clinical significance of IGF1R gene expression in patients with Stage II/III gastric cancer who receive curative surgery and adjuvant chemotherapy with S-12016

    • Author(s)
      Numata Koji、Oshima Takashi、Sakamaki Kentaro、Yoshihara Kazue、Aoyama Toru、Hayashi Tsutomu、Yamada Takanobu、Sato Tsutomu、Cho Haruhiko、Shiozawa Manabu、Yoshikawa Takaki、Rino Yasushi、Kunisaki Chikara、Akaike Makoto、Imada Toshio、Masuda Munetaka
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 142 Pages: 415~422

    • DOI

      10.1007/s00432-015-2039-6

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 高感度リン酸化プロテオーム解析2016

    • Author(s)
      木村弥生
    • Organizer
      日本プロテオーム学会
    • Invited
  • [Presentation] 各臓器におけるGPIアンカー型タンパク質発現プロファイル2016

    • Author(s)
      増石有佑、木村弥生、荒川憲昭、平野久
    • Organizer
      日本プロテオーム学会
  • [Presentation] TGF-β (β型変異増殖因子)を利用した癌転移メカニズムの解明2016

    • Author(s)
      岡山明子, 木村弥生, 梁明秀, 平野久
    • Organizer
      日本プロテオーム学会
  • [Presentation] 新規バイオマーカー探索に向けた糖ペプチド濃縮法の開発2016

    • Author(s)
      中居佑介、石山 歩、岡山明子、平野 久、木村弥生
    • Organizer
      日本プロテオーム学会
  • [Presentation] H.Glycosylphosphatidylinositol-anchored Proteins Profile in Organs2016

    • Author(s)
      Masuishi, Y., Kimura, Y., Arakawa, N. and Hirano, H.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ModProt: A database for integrating laboratory and literature data concerning protein post-translational modifications2016

    • Author(s)
      Kimura, Y., Hirano, H., and Toda, T.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Proteomic analysis of TGF-β-induced cancer metastasis2016

    • Author(s)
      Okayama, A., Kimura, Y., Ryo, A. and Hirano, H.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phosphate-affinity chromatographic micro-tip technology for enrichment of phosphopeptides towards phosphoproteomic study.2016

    • Author(s)
      Kawaguchi, M., Yuan, E. T., Ino, Y., Kimura, Y., Hirano, H., Kinoshita-Kikuta, E., Kinoshita, E., Koike, T.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effects of co-/post-translational modifications on protein function.2016

    • Author(s)
      Kimura, Y., Kimura, A., Okayama, A., Ino, Y., Kurata, Y., Kagawa, H., Toda, T., Hirano, H.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Determining Post-Translational Modifications of Nuclear Proteins.2016

    • Author(s)
      Ban, R., Akiyama, T., Ino, Y., Nakai, Y., Kagawa, H., Toda, T., Kawasaki, N., Hirano, H., Kimura, Y.
    • Organizer
      HUPO 2016, the 15th Annual World Congress 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 核内構成タンパク質の翻訳後修飾解析2016

    • Author(s)
      伴涼太郎, 秋山知子, 井野洋子, 香川裕之, 川崎ナナ, 平野 久, 木村弥生
    • Organizer
      日本プロテオーム学会
  • [Presentation] 培養がん細胞においてMMP-7がセリンプロテアーゼ様活性を促進する機構の解析2016

    • Author(s)
      石川智弘, 木村弥生, 平野 久, 東 昌市
    • Organizer
      日本生化学会大会
  • [Book] 材料表面の親水・親油の評価と制御設計2016

    • Author(s)
      石井淑夫監修
    • Total Pages
      600
    • Publisher
      テクノシステム

URL: 

Published: 2018-12-17  

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