2018 Fiscal Year Annual Research Report
Stratification of gastric cancer and identification of molecular mechanism of gastric tumorigenesis based on aberrant DNA methylation profile
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16H05412
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
金田 篤志 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (10313024)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | がん / エピゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
（1）「標本採取およびDNAメチル化網羅的解析」。昨年度までで、胃癌、食道胃接合部癌標本の収集およびDNA網羅的解析を順調に終了していたが、本年度は癌症例を詳細に層別化し、胃癌を異なるDNAメチル化サブタイプに分類した。胃癌各群に対し、EBVの有無、胃粘膜の炎症・萎縮、ピロリ菌感染の有無などを含め背景・病理学的因子との相関を明らかにした。
（2）「エクソン変異の網羅的解析」。昨年度までにHaloPlexキャプチャーシーケンスにてドライバー変異125遺伝子のエクソン変異解析を終了していたが、EBV陽性超高メチル化胃癌、MSI高メチル化胃癌、低メチル化胃癌、それぞれの各サブタイプに特徴的にみられる遺伝子変異と、(1)のDNAメチル化による不活化との相乗効果による発癌機構について、(4)で解析した。
（3）「DNA異常メチル化の獲得機構の解明」。EBV陽性胃癌におけるゲノム広範囲の異常メチル化は、他のメチル化群のメチル化標的遺伝子を包含するが、EBVを正常胃上皮細胞にin vitro感染するモデルを用い、EBV感染が正常胃上皮にDNAメチル化を誘導する際に、初年度にはTET2の低下がDNAメチル化獲得に貢献することを報告し、昨年度はヒストン活性化マークの消失がDNAメチル化部位と相関することを報告していた。本年度はTET2低下がDNAメチル化獲得だけでなくヒストン活性化の消失などエピゲノム異常誘導に貢献する機能を解析した。
（4）「発癌分子機構の解明」。shRNAライブラリーを用いた網羅的ノックダウンを行い、エクソン変異解析で認める遺伝子変異やDNAメチル化による遺伝子不活化が相乗効果で発癌に貢献する分子機構について、層別化した胃癌症例各群において明らかにした。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(45 results)
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[Presentation] Frequent promoter hypermethylation correlates with better prognosis in pharyngeal cancer.2018
Author(s)
Nakagawa T, Matsusaka K, Misawa K, Takane K, Fukuyo M, Rahmutulla B, Shinohara K, Ota S, Kunii N, Sakurai D, Hanazawa T, Nakatani Y, Okamoto Y, Kaneda A.
Organizer
AACR Annual meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] lassification of HPV-associated oropharyngeal cancer by definition of DNA methylation epigenotypes.2018
Author(s)
Takuya Nakagawa, Keisuke Matsusaka, Kiyoshi Misawa, Masaki Fukuyo, Bahityar Rahmutulla, Satoshi Ota, Naoki Kunii, Daiju Sakurai, Toyoyuki Hanawzawa, Yoshitaka Okamoto, Atsushi Kaneda.
Organizer
The 77th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
Int'l Joint Research
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[Presentation] Identification of genetic/epigenetic alterations based on wild-type TP53 in high methylation gastric cancer.2018
Author(s)
Keisuke Matsusaka, Yasunobu Mano, Masaki Fukuyo, Masayuki Urabe, Rahmutulla Bahityar, Eriko Ikeda, Kazuko Kita, Hiroyuki Abe, Tetsuhiro Nemoto, Yasuyuki Seto, Masashi Fukayama, Atsushi Kaneda.
Organizer
The 77th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
Int'l Joint Research
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[Presentation] 抗がん活性を有する新規化学合成化合物の詳細解析2018
Author(s)
池田英里子, 喜多和子, 井上貴登, 松田和暁, 宮崎柊子, 竹野有加里, 新宅 敬彦, 依田夏美, 福世真樹, 篠原憲一, 松坂恵介, 根本哲宏, 金田篤志
Organizer
第41回分子生物学会年会
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