2019 Fiscal Year Annual Research Report
東アジアを中心としたシャジクモの分布様式と多様性の成立過程解明と適応遺伝子の探索
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16H05764
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| Research Institution | Kobe University |
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Principal Investigator |
坂山 英俊 神戸大学, 理学研究科, 准教授 (60391108)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
西山 智明 金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
土松 隆志 千葉大学, 大学院理学研究院, 准教授 (60740107)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | シャジクモ / 淡水藻類 / 進化 / 種分化 / 遺伝的多様性 / 生態的多型 / 集団構造 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
東アジアにおいて水田と湖沼に適応したシャジクモ（Chara braunii）の生態的多型（水田型と湖沼型）が知られている。本研究では、東アジアを中心とした海外から様々な水環境に生育するシャジクモを採集し、種内のゲノム全体を網羅する遺伝的多型情報を明らかにし、空間的に分かれた集団間の遺伝子流動の有無と系統関係を解明することで、現在の分布様式の成立過程と海外でのシャジクモの多様性の全体像を解明する。さらに、種内において見いだされた生態型/局所集団毎に固定された遺伝子座をゲノムに基づき網羅的に抽出し、同一培養条件下、相互移植実験下などでの生態型/局所集団間の表現型と遺伝子型を比較することで、局所適応の有無を実験的に検証するとともに、生態型の進化過程と適応遺伝子を特定する。
令和元年度から令和３年度は、調査対象地域における海外研究協力者の事情、新型コロナウイルスの感染拡大状況や所属機関の活動制限の方針などを考慮し、調査が可能な時期に国内を中心にシャジクモのサンプルを採集した。平成３０年度までに収集したサンプルも含めて、葉緑体DNA（rbcL遺伝子、atpB-rbcL遺伝子間領域）に基づく分子系統解析、核DNA（マイクロサテライトマーカー、ホールゲノムショットガン解析によるSNP）に基づく遺伝的多型解析を実施し、新たに採集したサンプルの系統的位置づけ、地理的分布パターン、および種内の遺伝的集団構造を解析した。また、新たに採集した系統株について培養株を確立して同一培養条件下で表現型比較解析を実施し、遺伝子型や生育地ごとに表現型に違いが見られるかどうかを調べた。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Morphology, taxonomy and phylogenetic positions of two Spirogyra species (Zygnematophyceae, Streptophyta) with replicate and semi-replicate transverse walls from Japan2022
Author(s)
Takano, T., Ikegaya, H., Ikeda, K., Nozaki, H. and Sakayama, H.
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Journal Title
Phycologia
Volume: in press
Pages: -
Peer Reviewed
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