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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Evolutionary loss of regenerative ability: The role of evolutionary conserved regeneration signal-response enhancer

Research Project

Project/Area Number 16K07362
Research InstitutionYamagata University

Principal Investigator

越智 陽城  山形大学, 医学部, 准教授 (00505787)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横山 仁  弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (90455816)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords遺伝子発現制御 / ゲノム / 非コードDNA領域 / 再生 / 進化プロセス / ネッタイツメガエル / アフリカツメガエル
Outline of Annual Research Achievements

ほ乳類の再生能は魚類や両生類と比べて限られていることから、進化の過程でその能力を失ったという仮説が提唱されてきた。一方で、ゲノムの比較解析と遺伝子の機能の解析からは、発生再生に関わる遺伝子は、その種類、数、機能が、進化的に高度に保存されていることが示されている。ゆえに進化にともない再生能を失ったという仮説の実体は、遺伝子を失ったというよりも、再生に使う遺伝子の発現システムが変容したと予想される。しかしながら、これまでその実体に迫った研究はなかった。本研究は、再生に応答して活性化する両生類のゲノム領域(再生シグナル応答エンハンサー)を足がかりとして、非コードDNA領域に刻まれた再生能を失うまでの進化プロセスの解明を目指すものであった。
両生類の腎尿細管の再生をモデルにして、その再生過程で発現が亢進するlhx1遺伝子に着目した。lhx1の発現を再生中の腎管でオンにするエンハンサーをトランスジェニック・レポーター解析によりスクリーニングしたところ、再生能の高い魚類と両生類間のみで保存されている非コードDNA領域のみならず、ほ乳類でも保存されている非コードDNA領域でも強いエンハンサー活性が見られた。マウスの非コードDNA領域をもつレポータートランスジェニック両生類を作成し、両生類の腎管再生における活性化能を調べたところ、マウスのゲノムにも再生時に遺伝子発現を活性化させる機能があることがわかった。さらに、再生シグナル応答エンハンサーの活性化されるメカニズムを調べたところ、このエンハンサーには転写因子Arid3aが結合すること、これによりArid3aとヒストンH3タンパク質の9番目のリジンのトリメチル化 (H3K9me3)を脱メチル化する酵素Kdm4aを呼び込みエンハンサーのエピゲノム状態を変えること、Arid3aの働きを阻害をすると腎管の再生が起こらないことを発見した。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] rid3a Regulates Nephric Tubule Regeneration via Evolutionarily Conserved Regeneration Signal-Response Enhancers.2019

    • Author(s)
      Suzuki N, Hirano K, Ogino H, Ochi H:
    • Journal Title

      eLife

      Volume: pii: e43186 Pages: pii: e43186

    • DOI

      doi: 10.7554/eLife.43186.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 再生シグナル応答エンハンサー ~活性化メカニズムと進化的保存性の意味~2019

    • Author(s)
      越智陽城
    • Organizer
      動物学会関東支部大会 公開シンポジウム 挑戦する両生類: カエル・イモリを使った研究の最前線 オーガナイザー
    • Invited
  • [Presentation] AT-rich interaction domain 3A regulates the regeneration of the nephric duct through the evolutionary conserved regeneration signal response enhancer2018

    • Author(s)
      Suzuki N, Ogino H, Ochi H
    • Organizer
      17th International Xenopus Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Arid3a regulates the nephric tubule regeneration via the evolutionarily conserved regeneration signal-response enhancer2018

    • Author(s)
      Suzuki N, Hirano K, Ogino H, Ochi H
    • Organizer
      第12回日本ツメガエル研究集会・第4回次世代両生類研究会 合同シンポジウム
  • [Presentation] ツメガエルを用いたゲノム進化研究とリソース事業について2018

    • Author(s)
      荻野肇, 田内幹大, 岩田 唯, 越智陽城, 井川武, 鈴木菜花, 柏木昭彦, 柏木啓子
    • Organizer
      第12回日本ツメガエル研究集会・第4回次世代両生類研究会 合同シンポジウム
  • [Presentation] 局所的なshhの発現誘導によるXenopusの四肢のパターン形成への影響2018

    • Author(s)
      蓮潟里帆, 小林託也, 越智陽城, 田村宏治, 横山仁
    • Organizer
      再生学異分野融合研究会 (第1回)
  • [Presentation] Xenopusの四肢再生における背腹軸形成機構の解析2018

    • Author(s)
      嶋田侑莉, 越智陽城, 横山仁
    • Organizer
      再生学異分野融合研究会 (第1回)
  • [Presentation] The wild-type Xenopus laevis is an asymptomatic carrier of aniridia-like pax6 mutations2018

    • Author(s)
      Iwata Y, Tanouchi M, Igawa T, Sakagami K, Ochi H. Ogino H
    • Organizer
      51h Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
  • [Presentation] The hypomorphic mutations hidden in the allotetraploid genome of Xenopus laevis2018

    • Author(s)
      Tanouchi M , Ochi H, Kawaguchi A, Igawa T, Iwata Y. Sakagami K, Ogino H
    • Organizer
      51h Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists

URL: 

Published: 2019-12-27  

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