2017 Fiscal Year Research-status Report
診断治療戦略に向けた遺伝子型別肺腺癌のmicroRNA・mRNA統合発現解析
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16K08679
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
稲村 健太郎 公益財団法人がん研究会, がん研究所 病理部, 主任研究員 (40442545)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | マイクロRNA / メッセンジャーRNA / ドライバー遺伝子 / マイクロアレイ / 網羅的遺伝子発現解析 / 肺癌 / 腺癌 / 人体病理学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
・肺癌におけるmicroRNA研究の現状を把握するため、肺癌における最新のmicroRNA研究をまとめた総説をpublishした（Inamura K, Cancers, 2017; Inamura K, Cells, 2017）。
・肺腺癌200例のmicroRNA発現レベルおよびmRNA発現レベルをマイクロアレイにより網羅的に調べた。Unsupervised clustering（教師なしクラスタリング）により、microRNAおよびmRNAそれぞれによって肺腺癌を分類した。microRNA発現およびmRNAによるunsupervised clusteringでは肺腺癌はいずれも3群に分類された。microRNAによって分類された3群およびmRNAによって分類された3群について特徴的な臨床病理学的特徴および分子病理学的特徴を明らかにした。
・microRNAとmRNAが相互作用しうるものに限定して、各遺伝子変異型に特徴的に発現するmicroRNAおよびmRNAを抽出した。EGFR変異を有する肺腺癌と有しない肺腺癌で有意差をもって発現し相互作用しうる3個のmicroRNAと22個のmRNAを同定した。同様の解析によりALK融合遺伝子の有無によって発現が有意に異なり相互作用しうる5個のmicroRNAと71個のmRNAを同定した。ALK融合遺伝子をもたない肺腺癌において特徴的に相互作用するmicroRNAおよびmRNAの中には、肺非小細胞癌において悪性度と相関すると既報告のあるmicroRNAとmRNAが認められた。ALK融合遺伝子を持たない肺腺癌に特徴的に発現するこのmicroRNAは同定されたmRNAを抑制することにより発癌・癌進展に寄与していると考えられる。EGFR変異肺癌とKRAS変異肺癌の間で有意な差をもって発現し相互作用する1個のmicroRNAと1個のmRNAを同定した。同様の解析によりEGFR変異肺癌とALK融合遺伝子肺癌との間において5個のmicroRNAと125個のmRNAを、KRAS変異肺癌とALK融合遺伝子肺癌との間において4個のmicroRNAと18個のmRNAを同定した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
・肺癌におけるmicroRNA研究の現状を把握するため、肺癌における最新のmicroRNA研究をまとめた総説をpublishした（Inamura K. Diagnostic and Therapeutic Potential of MicroRNAs in Lung Cancer. Cancers, 2017; Inamura K. Major Tumor Suppressor and Oncogenic Non-coding RNAs: Clinical Relevance in Lung Cancer. Cells, 2017）。
・対象とする200例の肺腺癌の臨床予後を含む臨床病理学的データベースを作成した。
・肺腺癌200例のmicroRNA発現レベルおよびmRNA発現レベルをマイクロアレイにより網羅的に調べた。
・Unsupervised clustering（教師なしクラスタリング）により、microRNAおよびmRNAそれぞれによって肺腺癌を分類した。
・microRNAとmRNAが相互作用しうるものに限定して、ある遺伝子変異型に特徴的に発現するmicroRNAおよびmRNAを抽出した。
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| Strategy for Future Research Activity |
・microRNAとmRNAが相互作用しうるものに限定して、各遺伝子変異型に特徴的に発現するmicroRNAおよびmRNAを抽出した。
・今後は遺伝子変異型に特徴的な生物学的動態をmicroRNAとmRNAの相互作用の点から明らかにするための解析を行う予定である。microRNAとmRNAの相互作用によって、どのような経路・メカニズムによって発癌・癌進展するか、パスウェイソフトを使用し解析する。同定した特徴的なmicroRNAおよびmRNAについてはリアルタイムPCRによりvalidationする。また抗体により蛋白質発現を調べられるものについては積極的に免疫染色を施行し、蛋白質レベルでの発現について調べる予定である。
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| Causes of Carryover |
（理由）実験物品費が実験計画想定時より安価であったとともに、共用物品を使用することが可能であった。
（使用計画）次年度の実験物品費・論文校正費・論文掲載費・学会発表費に充てる予定である。当初の予定に追加して免疫染色による蛋白質発現の解析も行う予定である。
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[Journal Article] Prognostic Effect of Lymphovascular Invasion on TNM Staging in Stage I Non-Small-cell Lung Cancer.2018
Author(s)
Noma D, Inamura K, Matsuura Y, Hirata Y, Nakajima T, Yamazaki H, Hirai Y, Ichinose J, Nakao M, Ninomiya H, Mun M, Nakagawa K, Masuda M, Ishikawa Y, Okumura S.
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Journal Title
Clin Lung Cancer
Volume: 19(1)
Pages: e109-e122
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer.2018
Author(s)
Grasso CS, Giannakis M, Wells DK, Hamada T, Mu XJ, Quist M, Nowak JA, Nishihara R, Qian ZR, Inamura K, Morikawa T, Nosho K, et al.
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Journal Title
Cancer Discov.
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Osteosarcoma arising in fibrous dysplasia, confirmed by mutational analysis of GNAS gene.2018
Author(s)
Sugiura Y, Kanda H, Motoi N, Nomura K, Inamura K, Okada E, Matsumoto H, Shimoji T, Matsumoto S, Nakayama J, Takazawa Y, Ishikawa Y, Machinami R.
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Journal Title
Pathol Res Pract.
Volume: 214(2)
Pages: 318-324
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of tumor TROP2 expression with prognosis varies among lung cancer subtypes.2017
Author(s)
Inamura K, Yokouchi Y, Kobayashi M, Ninomiya H, Sakakibara R, Subat S, Nagano H, Nomura K, Okumura S, Shibutani T, Ishikawa Y.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 8(17)
Pages: 28725-28735
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Tumor B7-H3 (CD276) expression and smoking history in relation to lung adenocarcinoma prognosis.2017
Author(s)
Inamura K, Yokouchi Y, Kobayashi M, Sakakibara R, Ninomiya H, Subat S, Nagano H, Nomura K, Okumura S, Shibutani T, Ishikawa Y.
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Journal Title
Lung Cancer
Volume: 103
Pages: 44-51
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] EBUS-TBNA as a Promising Method for the Evaluation of Tumor PD-L1 Expression in Lung Cancer.2017
Author(s)
Sakakibara R, Inamura K, Tambo Y, Ninomiya H, Kitazono S, Yanagitani N, Horiike A, Ohyanagi F, Matsuura Y, Nakao M, Mun M, Okumura S, Inase N, Nishio M, Motoi N, Ishikawa Y.
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Journal Title
Clin Lung Cancer
Volume: 18(5)
Pages: 527-534.e1
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Tumor PDCD1LG2 (PD-L2) Expression and the Lymphocytic Reaction to Colorectal Cancer.2017
Author(s)
Masugi Y, Nishihara R, Hamada T, Song M, da Silva A, Kosumi K, Gu M, Shi Y, Li W, Liu L, Nevo D, Inamura K, Cao Y, Liao X, Nosho K, Chan AT, Giannakis M, Bass AJ, Hodi FS, Freeman GJ, Rodig SJ, Fuchs CS, Qian ZR, Nowak JA, Ogino S.
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Journal Title
Cancer Immunol Res.
Volume: 5(11)
Pages: 1046-1055
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Association Between Inflammatory Diet Pattern and Risk of Colorectal Carcinoma Subtypes Classified by Immune Responses to Tumor.2017
Author(s)
Liu L, Nishihara R, Qian ZR, Tabung FK, Nevo D, Zhang X, Song M, Cao Y, Mima K, Masugi Y, Shi Y, da Silva A, Twombly T, Gu M, Li W, Hamada T, Kosumi K, Inamura K, Nowak JA, Drew DA, Lochhead P, Nosho K, Wu K, Wang M, Garrett WS, Chan AT, Fuchs CS, Giovannucci EL, Ogino S.
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Journal Title
Gastroenterology.
Volume: 153(6)
Pages: 1517-1530.e14
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Presentation] Sakakibara R, Ninomiya H, Inamura K, Nakashima Y, Okumura S, Ishikawa Y. Update in theDiagnosis of neuroendocrine tumor and its prognostic value.2018
Author(s)
Sakakibara R, Ninomiya H, Inamura K, Nakashima Y, Okumura S, Ishikawa Y.
Organizer
The 5-th Asian-Australasian Pulmonary Pathology Society (AAPPS) annual conference
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