2016 Fiscal Year Research-status Report
EBV感染が誘導するエピゲノム改変・維持に関わる因子の同定とその機能解析
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16K08729
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
松坂 恵介 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (40610150)
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Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | エピジェネティクス / DNAメチル化 / ウイルス / 胃癌 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究は胃癌を対象にEpstein-Barrウイルス(EBV)感染が誘導するゲノムワイドなエピゲノム改変に関わる因子の同定と、EBV感染脱落系を用いたエピゲノム維持機構の解明を目的としている。先行研究により、EBVの潜伏感染を伴う胃癌(EBV陽性胃癌)がゲノムワイドにDNAメチル化の亢進した超高DNAメチル化形質を示し、さらにEBV感染により宿主細胞に新規DNAメチル化が誘導されEBV感染そのものが超高DNAメチル化形質の原因であること証明してきた。胃癌細胞株MKN7と正常胃粘膜上皮由来細胞株GES1において感染早期における新規DNAメチル化形質誘導パターンを経時的に解析した結果、宿主細胞のDNAメチル化誘導に先駆けてウイルスゲノムDNAにメチル化が誘導されることを見いだし、現在論文投稿中である。さらに新規にDNAメチル化が誘導される時相におけるウイルスと宿主細胞両者の遺伝子発現を包括的に解析中であり、DNAメチル化誘導候補因子に対するshRNAの構築を計画中である。一方、変異型EBNA1を用いた実験系によりEBV脱落細胞の作製を遂行中であり、脱落後の細胞に脱メチル化剤やDNMTのknockdown、TETの強制発現系などを作用させることで、EBV感染がDNAメチル化の維持に果たす役割を解析する予定である。このようにウイルスと宿主との間の秩序だった相互作用をより詳細に解析することで、新規DNAメチル化のメカニズムの解明が期待される。これらの成果はより根源的な生命現象の解明にとどまらず、EBV関連疾患の予防と治療に向けた臨床的な応用も幅広く期待されるものである。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
EBV感染脱落効率の検討で多少時間がかかっているが、おおむね順調に進展している。
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Strategy for Future Research Activity |
preliminaryなデータから、EBV感染初期におけるウイルス遺伝子発現は予想よりも多数に及んでいることが予想され、ウイルス遺伝子に対するshRNAによるknockdownの標的はより包括的に展開する必要がある。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Tumor Content Chart-Assisted HER2/CEP17 Digital PCR Analysis of Gastric Cancer Biopsy Specimens.2016
Author(s)
Matsusaka K, Ishikawa S, Nakayama A, Ushiku T, Nishimoto A, Urabe M, Kaneko N, Kunita A, Kaneda A, Aburatani H, Fujishiro M, Seto Y, Fukayama M
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Journal Title
PLoS One
Volume: 11(4)
Pages: e0154430
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Two subtypes of colorectal tumor with distinct molecular features in familial adenomatous polyposis.2016
Author(s)
Takane K, Matsusaka K, Ota S, Fukuyo M, Yue Y, Nishimura M, Sakai E, Matsushita K, Miyauchi H, Aburatani H, Nakatani Y, Takayama T, Matsubara H, Akagi K, Kaneda A
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 7(51)
Pages: 84003-84016
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Coupling CDH17 and CLDN18 Markers for Comprehensive Membrane-targeted Detection of Human Gastric Cancer.2016
Author(s)
Matsusaka K, Ushiku T, Urabe M, Fukuyo M, Abe H, Ishikawa S, Seto Y, Aburatani H, Hamakubo T, Kaneda A, Fukayama M.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 7(39)
Pages: 64168-64181
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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