2016 Fiscal Year Research-status Report
エピゲノム制御に関わる疾患アンチセンスRNAの同定とその定量検査法の開発
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16K08984
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
山中 康成 国立研究開発法人理化学研究所, 予防医療・診断技術開発プログラム, マネージャー (90402859)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | アンチセンスRNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
エピゲノム制御に関わる疾患アンチセンスRNAを同定し、そのRNA定量検査法を開発するため、クロマチン関連蛋白質HMGB2と結合するアンチセンスRNAの同定を試みた。
予備実験としてすでに行っていたCross-linking immunoprecipitation(CLIP)ではRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、今後代替策としてRNA immunoprecipitation(RIP)を行う方針とし、現在その沈降条件を検討中である。一方で、脳脊髄液(CSF)ではRNAが安定して存在することに着目し、疾患関連CSFの収集に向けて医療機関と協議を開始した。
今後は、RIPの条件検討を進め、HMGB2と結合するアンチセンスRNAを同定していく。また、臨床検体を確保するため、医療機関との協議をさらに進める。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予備実験としてすでに行っていたCross-linking immunoprecipitation(CLIP)ではRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、今後代替策としてRNA immunoprecipitation(RIP)を行う方針とし、現在その沈降条件を検討中である。一方で、脳脊髄液(CSF)ではRNAが安定して存在することに着目し、疾患関連CSFの収集に向けて医療機関と協議を開始した。
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| Strategy for Future Research Activity |
RIPの条件検討を進め、HMGB2と結合するアンチセンスRNAを同定していく。また、臨床検体を確保するため、医療機関との協議をさらに進める。
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| Causes of Carryover |
CLIPを用いた解析でRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、その代替策の検討に時間を要したため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
今後RIPを用いた解析方法を確立し、臨床検体の収集についてさらに協議を進める。
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