2016 Fiscal Year Research-status Report
HBVジェノタイプ特異的免疫抑制反応解析による新規治療法開発
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16K09335
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Research Institution | Nagoya City University |
Principal Investigator |
近藤 泰輝 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 研究員 (70455822)
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Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | エキソソーム / miRNA / HBV |
Outline of Annual Research Achievements |
HBVジェノタイプ特異的に免疫修飾を行う因子としてCX3CL1を同定し、報告済みであるが、今回はHBV複製肝細胞より放出されるエキソソーム内のmiRNAを解析した。 Huh7細胞とHepG2細胞にHBVジェノタイプBとCのプラスミドを導入して培養上清のエキソソームを分離してRNAを抽出した。また、同時にHBV複製肝細胞よりもRNAを抽出した。エキソソームの分離が上手くいっていることを電子顕微鏡にて確認した。また、HBV導入によりエキソソームの絶対量に変化がないことを確認するためにCD63ELISAにて定量を行った。結果、HBVジェノタイプ間やHBV発現によりエキソソームの絶対量が変化しないことを確認した。 この確認の後、エキソソームと肝細胞より抽出したRNAを用いてライブラリーを作成し、Illumina社のHiseq 2500を用いてDeep Sequencing 解析を行った。この解析の結果、約1500万リード/サンプルでデータを得ることが出来た。miRNAの発現解析を行った結果、肝細胞内とエキソソームどちらにおいても、ジェノタイプBとCで統計学的有意に発現が異なるmiRNAとしてmiR34-5pを同定した。このmiR34c-5pは肝細胞内ではジェノタイプCで有意に発現が高いが、エキソソーム内ではジェノタイプBで発現が高いことが分かった。 このmiRNAは免疫細胞のPD-L1発現やアポトーシスに影響を与えることが知られており、次年度にはこの機能解析を施行する。また、以前同定した、CX3CL1について、このSNPが発がんや病態進展に影響を及ぼしうるか検討を行うため、臨床検体の収集を継続している。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
次世代シーケンサを用いた検討であったが、順調にデータを得ることが出来て、HBVジェノタイプ特異的なmiRNAの発現も同定出来たため、おおむね順調に進展していると思われる。
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Strategy for Future Research Activity |
miR34-5pの免疫細胞に与える影響を検討する。特に、PD-L1の発現は免疫抑制細胞の機能に重要であるため、この解析を施行することは重要である。また、アポトーシスも病態において重要であるため、この検討も並行して行う予定である。 以前同定した、液性因子であるCX3CL1のSNPと病態の関係について臨床検体を用いて解析を行う。現在、臨床検体収集中であり、さらに検体収集を進める。
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Causes of Carryover |
HBVジェノタイプ間におけるmiRNA発現解析の網羅的解析に時間を要したため、機能解析に使用する予定であった試薬がまだ購入されていないため、今年度は予定使用額より少なくなった。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
機能解析を平成29年度に集中的に行うため、これらの試薬購入に使用する予定である。
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[Journal Article] Hepatitis C virus has a genetically determined lymphotropism through receptor B7.22017
Author(s)
Chen CL, Huang J,Wang CH, Zhou L, Kondo Y, Schechter J, Su L, Lai MM, Wakita T, Cosset FL, Jung JU, Machida K
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Journal Title
Nature Communications
Volume: 9;8
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Activation of the Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Subunit Pathway in Steatotic Liver Contributes to Formation of Cholesterol Gallstones2017
Author(s)
Asai Y, Yamada T, Tsukita S, Takahashi K, Maekawa M, Honma M, Ikeda M, Murakami K, Munakata Y, Shirai Y, Kodama S, Sugisawa T, Chiba Y, Kondo Y, Kaneko K, Uno K, Sawada S, Imai J, Nakamura Y, Yamaguchi H, Tanaka K, Sasano H, Mano N, Ueno Y, Shimosegawa T
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Journal Title
Gastroenterology
Volume: S0016-5085(17)
Pages: 30012-4
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Global, cancer-specific microRNA cluster hypomethylation was functionally associated with the development of non-B non-C hepatocellular carcinoma.2016
Author(s)
Nojima M, Matsui T, Tamori A, Kubo S, Shirabe K, Kimura K, Shimada M, Utsunomiya T, Kondo Y, Iio E, Naito Y, Ochiya T, Tanaka Y
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Journal Title
Mol Cancer.
Volume: 15(1)
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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