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2018 Fiscal Year Annual Research Report

The Analysis of miRNA-mRNA network related to atherosclerosis.

Research Project

Project/Area Number 16K15438
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

神吉 康晴  東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordssmall RNA / 動脈硬化 / 血管内皮細胞 / 接着因子 / ヒストン脱メチル化酵素 / 染色体構造 / Hi-C
Outline of Annual Research Achievements

高齢化社会を迎えた現在、心筋梗塞、脳梗塞、閉塞性動脈硬化症などの血管の老化に伴う疾患のメカニズムを解明することは急務である。こうした疾患は、血中を流れる単球が血管内皮細胞の壁に接着因子を介して結合するところから病態が発症、進行すると考えられている。申請者はこれまでに、動脈硬化の形成に重要な血管内皮細胞接着因子Vascular Cell Adhesion Molecule-1 (VCAM-1)がInterleukin-4 (IL-4)やTumor Necrosis Factor-alpha (TNF-a)によって持続的に誘導されること、その際に重要な新規エンハンサー領域が存在すること、を報告してきた (Tozawa H, Kanki Y et,al 20 11 MCB、Papantonis A, Kanki Y et al 2012 EMBO J)。本研究では、特定のmiRNAが動脈硬化の発症と関与している仮説を立て、その下流のパスウェイを調べた。最終年度にあたる平成30年度は、この2年間で見出した新規miRNA、その対象となるmRNAであるKDM7A, UTXの機能解析を行った。これら2つの遺伝子はヒストン脱メチル化酵素である。そこで、TNF刺激前後でのヒストン修飾解析をChIP-seqを用いて行ったところ、刺激応答性に抑制系ヒストン修飾が外れていることが分かった。また、同時に行った染色体構造網羅解析手法であるHi-Cの結果から、重要な接着因子であるVCAM1、IL8の遺伝子座では刺激後わずか30分程度で、KDM7AやUTXの結合領域を中心にゲノム3次元構造が変化することが分かった。これらの成果は、3次元ゲノムとmiRNA、3次元ゲノムと慢性疾患、を繋ぐ世界でも例をみない成果であり、エピジェネティクスのみならず臨床医学的にも大きな意義のある研究となった。

  • Research Products

    (11 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 6 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, San Diego/Jackson Laboratory(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, San Diego/Jackson Laboratory
  • [Journal Article] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2018

    • Author(s)
      HIGASHIJIMA Yoshiki、MATSUI Yusuke、SHIMAMURA Teppei、TSUTSUMI Shuichi、NAKAKI Ryo、ABE Yohei、LINK Verena M、YOSHIDA Masayuki、TANAKA Toshihiro、NANGAKU Masaomi、KIMURA Hiroshi、FURUKAWA Tetsushi、ABURATANI Hiroyuki、WADA Youichiro、GLASS Christopher K、KANKI Yasuharu
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: 0 Pages: 0-0

    • DOI

      https://doi.org/10.1101/456491

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Downregulation of ERG and FLI1 expression in endothelial cells triggers endothelial-to-mesenchymal transition2018

    • Author(s)
      Nagai Nao、Ohguchi Hiroto、Nakaki Ryo、Matsumura Yoshihiro、Kanki Yasuharu、Sakai Juro、Aburatani Hiroyuki、Minami Takashi
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 14 Pages: e1007826

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1007826

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2019

    • Author(s)
      神吉康晴
    • Organizer
      第5回日本血管生物医学会若手研究会
    • Invited
  • [Presentation] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2019

    • Author(s)
      Yasuharu Kanki, Yoshiki Higashijima, Yusuke Matsui, Teppei Shimamura, Shuichi Tsutsumi, Yohei Abe, Verena M. Link, Hiroyuki Aburatani , Christopher K. Glass
    • Organizer
      Keystone Symposia 2019 Epigenetics and Human Disease
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡による単粒子解析2018

    • Author(s)
      神吉康晴
    • Organizer
      第14回臨床プロテオゲノミクス研究会
    • Invited
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡による単粒子解析2018

    • Author(s)
      神吉康晴
    • Organizer
      BioExpo 2018
    • Invited
  • [Presentation] microRNA-histone modification network in TNF-α-stimulated inflammatory endothelium2018

    • Author(s)
      Yasuharu Kanki
    • Organizer
      The 16th Korea-Japan Joint Symposium on Vascular Biology(K-J meeting)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A novel epigenetic mechanism revealedtumor associated angiogenesis2018

    • Author(s)
      Yasuharu Kanki
    • Organizer
      第77回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Two histone demethylases KDM7A and UTX synergistically modulate chromatin conformation to control inflammation in human endothelial cells2018

    • Author(s)
      Yasuharu Kanki
    • Organizer
      BIT’s 8th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 炎症性サイトカインによる 染色体構造変化の俯瞰的解析2018

    • Author(s)
      神吉康晴
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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