2016 Fiscal Year Research-status Report
| Project/Area Number |
16K18479
|
|---|
| Research Institution | Kyushu University |
|---|
Principal Investigator |
前原 一満 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教 (90726431)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | ヒストンバリアント / エピゲノム制御 / ヒストンコード / クロマチン |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究計画では、新規ヒストンバリアントを軸にしたクロマチン動態の解析によって、細胞分化にともなう遺伝子選択機能の解明を目的とする。高等生物で特徴的に発達したクロマチンを介する複雑な遺伝子発現制御のメカニズムを解明するためには、生体におけるヌクレオソーム再編成の実態と機能的意義を明らかにする必要がある。我々は2015年に、計算機による遺伝子探索法を開発し、新規14種のマウスおよびヒトのヒストン亜種（バリアント）遺伝子を同定した。遺伝子改変細胞を使った実験から、その一部バリアントのクロマチンへの取り込みが、細胞分化過程における遺伝子発現パターンを変容させることを明らかにした。しかし、わずかなアミノ酸の違いがもたらす分子メカニズムは不明のままであった。そこで本年度は、ヒストンの新規バリアントが果たす固有の機能を中心にして共同研究の成果を発表してきた。ヒストンバリアントの選択性については、精巣特異的ヒストンバリアントH3t（Cell Rep. 2017）、骨格筋特異的ヒストンバリアント(H3mm7)に着目し解析を行った。ヒストン修飾の面からは、新規ヒストン修飾をを発見し論文報告した。一方、ヒストンバリアントは種固有のものが多く、各動物種ごとの解析が欠かせない。そこで、本プロジェクトではヒト固有のバリアントについて、ヌクレオソーム形成能の解析やエピゲノムプロファイリングより、各ヒストン固有のクロマチン構造をゲノムワイドに明らかとし、本成果については論文投稿中である。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
新規マウスH3バリアントがもたらす骨格筋分化に特徴的なクロマチン構造の解析を順調に進めることができている。新規に同定したヒト・マウス新規バリアントについての共同研究成果もあがっており、当初の計画以上に順調に進展している。
|
| Strategy for Future Research Activity |
マウスにおける新規H3バリアントのひとつが、骨格筋分化の過程に伴った遺伝子の発現を調整している可能性を見出しており、当面はさらなるデータ取得と解析の計画を進めながら、最終的な論文発表を目指す。また、当研究の過程で新たに創出してきたトランスクリプトーム解析技術や、ヌクレオソーム解像度のクロマチン構造解析手法についても、論文発表を目指して同時に計画を進める。
|
-
[Journal Article] Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis2017
Author(s)
Ueda, Jun; Harada, Akihito; Urahama, Takashi; Machida, Shinichi; Maehara, Kazumitsu; Hada, Masashi; Makino, Yoshinori; Nogami, Jumpei; Horikoshi, Naoki; Osakabe, Akihisa;
-
Journal Title
Cell reports
Volume: 18
Pages: 593-600
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Identification of Immunoglobulin Gene Sequences from a Small Read Number of mRNA-Seq Using Hybridomas2016
Author(s)
Kuniyoshi, Yuki; Maehara, Kazumitsu; Iwasaki, Takeshi; Hayashi, Masayasu; Semba, Yuichiro; Fujita, Masatoshi; Sato, Yuko; Kimura, Hiroshi; Harada, Akihito; Ohkawa, Yasuyuki;
-
Journal Title
PLoS One
Volume: 11
Pages: e0165473
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Histone H4 lysine 20 acetylation is associated with gene repression in human cells2016
Author(s)
Kaimori, Jun-Ya; Maehara, Kazumitsu; Hayashi-Takanaka, Yoko; Harada, Akihito; Fukuda, Masafumi; Yamamoto, Satoko; Ichimaru, Naotsugu; Umehara, Takashi; Yokoyama, Shigeyuki; Matsuda, Ryo;
-
Journal Title
Scientific reports
Volume: 6
Pages: 24318
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
