2017 Fiscal Year Annual Research Report
Epigenetic dysregulation of noncoding RNAs in gastrointestinal cancer progression
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16K19352
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
新沼 猛 札幌医科大学, 医学部, 助教 (60708113)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 大腸癌 / lncRNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究においてはまず、消化管がん転移に寄与するnoncoding RNAをThe Cancer Geneme Atlas(TCGA)データによるスクリーニングを試みた。TCGAの大腸がんの遺伝子発現データであるCOADREAD exonexpressionを用いて正常大腸より発現が高く、リンパ節転移陽性群で転移陰性群より発現が高いnoncoding RNAのexonを抽出したところ、有意な156 exonが抽出された。その中から複数のexonが存在していた21のnoncoding RNAを解析の対象とした。選択したnoncoding RNAの発現を大腸がん細胞株SW480とそのリンパ節転移より樹立されたSW620正常大腸において解析したところLOC441178とDNAJC3-AS1が正常よりSW480で高く、SW620でさらに発現が上昇しているnoncoding RNA候補として抽出された。その他大腸がん全体で正常より発現が上昇しているnoncoding RNAとしてDUXAP8, DUXAP10が抽出された。大腸癌細胞株を用いてレンチウイルスベクターによりDUXAP10をノックダウンしたところ細胞増殖を有意に抑制し、スクラッチアッセイでは遊走能の抑制が認められた。以上より消化管がん特に大腸がん転移に関与する可能性のあるnoncoding RNAを抽出することができた。cell viability assayならびにwound healing assayの機能解析の結果からDUXAP10は大腸癌において増殖、遊走能に関与するlncRNAと考えられた。DUXAP10については臨床検体での解析やエピゲノム解析中である。DNAJC3AS1などのlncRNAについては順次ノックダウン・過剰発現系による機能解析を行っているところである。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Epigenetic silencing of SMOC1 in traditional serrated adenoma and colorectal cancer.2017
Author(s)
Aoki H, Yamamoto E, Takasawa A, Niinuma T, Yamano HO, Harada T, Matsushita HO, Yoshikawa K, Takagi R, Harada E, Tanaka Y, Yoshida Y, Aoyama T, Eizuka M, Yorozu A, Kitajima H, Kai M, Sawada N, Sugai T, Nakase H, Suzuki H
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 9
Pages: 4707-4721
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Downregulation of miR-186 is associated with metastatic recurrence of gastrointestinal stromal tumors.2017
Author(s)
Niinuma T, Kai M, Kitajima H, Yamamoto E, Harada T, Maruyama R, Nobuoka T, Nishida T, Kanda T, Hasegawa T, Tokino T, Sugai T, Shinomura Y, Nakase H, Suzuki H.
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Journal Title
Oncol Lett.
Volume: 14
Pages: 5703-5710
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Epigenetic silencing of diacylglycerol kinase gamma in colorectal cancer.2017
Author(s)
Kai M, Yamamoto E, Sato A, Yamano HO, Niinuma T, Kitajima H, Harada T, Aoki H, Maruyama R, Toyota M, Hatahira T, Nakase H, Sugai T, Yamashita T, Toyota M, Suzuki H.
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Journal Title
Mol Carcinog.
Volume: 56
Pages: 1743-1752
DOI
Peer Reviewed
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