Development of an information-intensive basis for cancer chemotherapy

2009 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17012025
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Japanese Foundation For Cancer Research
• Principal Investigator: YAMORI Takao Japanese Foundation For Cancer Research, 癌化学療法センター・分子薬理部, 部長 (60200854)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): UEHARA Yoshimasa 岩手医科大学, 薬学部, 教授 (50160213) ; YOSHIDA Minoru 独立行政法人理化学研究所, 化学遺伝学研究室, 主任研究員 (80191617) ; IMOTO Masaya 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (60213253) ; SEIMIYA Hiroyuki 財団法人癌研究会, 癌化学療法センター分子生物治療研究部, 部長 (50280623) ; MIZUKAMI Tamio 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 (80367896) ; KAWADA Manabu 財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究センター, ユニット長 (20300808) ; OSADA Hiroyuki 独立行政法人理化学研究所, 抗生物質研究室, 主任研究員 (80160836) ; MATSUURA Masaaki 財団法人癌研究会, 癌研究所がんゲノム研究部, 部長 (40173794) ; FUKAZAWA Hidesuke 国立感染症研究所, 生物活性物質部, 室長 (10218878)
• Project Period (FY): 2005 – 2009
• Keywords: 化合物 / 分子標的 / 阻害剤 / スクリーニング / 研究支援 / データベース / 抗がん剤 / ケミカルバイオロジー

Research Abstract

To support researchers who have new compounds, we evaluated biological activities of their compounds (~1000) by our screening system and provided them the results. Most of the results were published with their consent. We developed "SCADS inhibitor kit", a library including 300 compounds with known mechanisms of action, and distributed it to applicants to encourage their chemical biology studies. We developed another library of 200 new compounds deposited by researchers and distributed it to applicants. We collected information on new molecular targeted anticancer drugs and provided it via web pages.

Research Products

• [Journal Article] TRF1 mediates mitotic abnormalities induced by Aurora-A overexpression (2010)
  • Author(s): Ohishi T, Hirota T, Tsuruo T, Seimiya H.
  • Journal Title: Cancer Res 70(5) Pages: 2041-52
• [Journal Article] Real-time imaging of histone H4 hyperacetylation in living cells (2009)
  • Author(s): Sasaki K, Ito T, Nishino N, Khochbin S, Yoshida M.
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S. A 106(38) Pages: 16257-16262
• [Journal Article] V-ATPase inhibitors overcome Bcl-xL-mediated chemoresistance through restoration of a caspase-independent apoptotic pathway (2009)
  • Author(s): Sasazawa Y, Futamura Y, Tashiro E, Imoto M.
  • Journal Title: Cancer Science 100 Pages: 1460-1467
• [Journal Article] Affinity labeling of the proteasome by a belactosin A derived inhibitor (2008)
  • Author(s): Hasegawa M, Kinoshita K, Nishimura C, Matsumura U, Shionyu M, Ikeda S, Mizukami T.
  • Journal Title: Bioorg Med Chem Lett 18(20) Pages: 5668-71
• [Journal Article] The identification of anosteoclastogenesis inhibitor through the inhibition of glyoxalase I. (2008)
  • Author(s): Kawatani M, Okumura H, Honda K, Kanoh N, Muroi M, Dohmae N, Takami M, Kitagawa M, Futamura Y, Imoto M, Osada H.
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci, USA 105 Pages: 11691-11696
• [Journal Article] Common peak approach by semi-supervised learning using mass spectrometry datasets for predicting effects on anticancer drugs on breast cancer (2007)
  • Author(s): Ushijima M, Miyata S, Eguchi S, Kawakita M, Yoshimoto M, Iwase T, Akiyama F, Sakamoto G, Nagasaki K, Miki Y, Noda T, Hoshikawa Y, Matsuura M.
  • Journal Title: Cancer Informatics 3 Pages: 285-93
• [Journal Article] Antitumor activity of ZSTK474, a new phosphatidylinositol 3-kinase inhibitor (2006)
  • Author(s): Yaguchi S, Fukui Y, Koshimizu I, Yoshimi H, Matsuno T, Gouda H, Hirono S, Yamazaki K, Yamori T.
  • Journal Title: J Natl Cancer Inst 98(8) Pages: 545-56
• [Journal Article] Synthesis and biological evaluation of benzamides and benzamidines as selective inhibitors of VEGFR tyrosine kinases (2006)
  • Author(s): Nakamura H, Sasaki Y, Uno M, Yoshikawa T, Asano T, Ban HS, Fukazawa H, Shibuya M, Uehara Y.
  • Journal Title: Bioorg Med Chem Lett 16 Pages: 5127-5131
• [Journal Article] Ets-1-dependent expression of vascular endothelial growth factor receptors is activated by latency-associated nuclear antigen of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus through interaction with daxx (2006)
  • Author(s): Murakami Y, Yamagoe S, Noguchi K, Takebe Y, Takahashi N, Uehara Y, Fukazawa H.
  • Journal Title: Journal of Biological Chemistry 281 Pages: 28113-28121
• [Journal Article] Insulin-like growth factor-I secreted from prostate stromal cells mediates tumor-stromal cell interactions of the prostate cancer (2006)
  • Author(s): Kawada M, Inoue H, Masuda T, Ikeda D.
  • Journal Title: Cancer Res 66 Pages: 4419-4425
• [Presentation] TRF1 mediates mitotic abnormalities induced by Aurora-A overexpression (2010)
  • Author(s): Seimiya H
  • Organizer: AACR Special Conference on the Role of Telomerase and Telomeres in Cancer Research
  • Place of Presentation: Texas, USA
  • Year and Date: 2010-02-27
• [Presentation] Generation of "Natural Unnatural Product Library" and identification of small molecule XIAP inhibitors (2009)
  • Author(s): Kawamura T, Otaka H, Tashiro E, Imoto M.
  • Organizer: 2009 AACR-NCI-EORTC Molecular Targets and Cancer Therapeutics conference
  • Place of Presentation: Boston, USA
  • Year and Date: 2009-11-16
• [Presentation] クラミドシン骨格を有する新規HDAC阻害剤Ky-2の抗腫瘍活性 (2009)
  • Author(s): 前田里子, 伊藤昭博, 矢守隆夫, 西野憲和, 吉田稔
  • Organizer: 第13回日本がん分子標的治療学会学術集
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2009-06-26
• [Presentation] cis-enone resorcylic acid lactonesによるチロシンキナーゼ阻害 (2009)
  • Author(s): 深澤秀輔
  • Organizer: 第13回日本がん分子標的治療学会学術集
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2009-06-26
• [Presentation] Establishment of novel antitumor drugs screening method by using chemical array (2009)
  • Author(s): Simizu S, Miyazaki I, Osada H.
  • Organizer: AACR-ACS Joint Conference on Chemistry in Cancer Research
  • Place of Presentation: New Orleans, USA
  • Year and Date: 2009-02-09
• [Presentation] 課題と展望-日本発の創薬をめざして (2008)
  • Author(s): 上原至雅
  • Organizer: 第67回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-10-28
• [Presentation] Belactosin Aの細胞内プロテアソームへの結合動態解析 (2008)
  • Author(s): 木下和拓, 西村千佳, 池田俊一, 長谷川慎, 水上民夫
  • Organizer: 第12回がん分子標的治療研究会総会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-06-27
• [Presentation] Identification of candidates for new drug, target and biomarker by mining data sets from a panel of human cancer cell lines: JFCR39 (2007)
  • Author(s): Yamori T.
  • Organizer: MBI Chemogenomics Workshop
  • Place of Presentation: Ohio, USA
  • Year and Date: 2007-05-10
• [Presentation] Insulin-like growth factor-I secreted from prostate stromal cells mediates tumor-stromal cell interactions of prostate cancer (2006)
  • Author(s): Kawada M, Inoe H, Masuda T, Momose I. Ikeda D.
  • Organizer: 18th EORTC-NCI-AACR Symposium on "Molecular Targets and Cancer Therapeutics"
  • Place of Presentation: Prague, Czech
  • Year and Date: 2006-11-09
• [Presentation] メディカルインフォマティクスの進展と副作用・治療効果予測システムの構築シンポジウム「ゲノミクス・プロテオミクスによる大規模解析とその臨床応用」 (2006)
  • Author(s): 松浦正明
  • Organizer: 第65回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2006-09-30
• [Book] 癌と化学療法(特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績「化学療法基盤情報支援班」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第13報-, 37) (2010)
  • Author(s): 矢守隆夫, 上原至雅, 吉田稔, 井本正哉, 清宮啓之, 水上民夫, 川田学, 長田裕之, 松浦正明, 深澤秀輔
  • Total Pages: 1-158
• [Book] がん分子標的治療研究実践マニュアル(日本がん分子標的治療学会編集、曽根三郎/鶴尾隆編集代表, 足場非依存性細胞増殖測定法および併用効果評価法) (2009)
  • Author(s): 西谷直之, 上原至雅
  • Total Pages: 340
  • Publisher: 金芳堂
• [Book] 実験医学(岡野栄之・岩坪威・佐谷秀行編, ケミカルバイオロジーに基づく創薬研究, 分子標的薬開発の新たなる挑戦) (2009)
  • Author(s): 河村達郎, 田代悦, 井本正哉
  • Total Pages: 233
• [Book] Telomeres and Telomerase in Cancer(Keiko Hiyama 編, telomere binding proteins, and inhibitors.) (2009)
  • Author(s): Seimiya H, Tsuruo T. Tankyrase 1
  • Total Pages: 380
  • Publisher: Humana Press
• [Book] Protein Targeting with Small Molecules: Chemical Biology Techniques and Applications(Hiroyuki Osada 編, Chemical biology based on small molecule-protein interaction) (2009)
  • Author(s): Osada H.
  • Total Pages: 297
  • Publisher: Wiley
• [Book] 新臨床腫瘍学:がん薬物療法専門医のために(日本臨床腫瘍学会編集, バイオインフォマティクス, 改訂第2版) (2009)
  • Author(s): 松浦正明
  • Total Pages: 921
  • Publisher: 南江堂
• [Book] がんの分子標的治療(鶴尾隆編, プロテアソーム阻害剤) (2008)
  • Author(s): 長谷川慎, 水上民夫
  • Total Pages: 441
  • Publisher: 南山堂
• [Book] 癌と化学療法(特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績 「化学療法基盤情報支援班」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第12報-, 34) (2007)
  • Author(s): 矢守隆夫, 上原至雅, 吉田稔, 井本正哉, 清宮啓之, 水上民夫, 川田学, 長田裕之, 松浦正明
  • Total Pages: 112-44
• [Book] 癌と化学療法(特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績 「新しい戦略による抗がん剤のスクリーニングのための委員会」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第11報-, 34) (2007)
  • Author(s): 矢守隆夫, 安藤俊夫, 上原至雅, 小野眞弓, 河野通明, 済木育夫, 内藤幹彦, 早川洋一, 鶴尾隆, 吉田稔, 杉本芳一, 馬島哲夫
  • Total Pages: 1-111
• [Book] 蛋白質核酸酵素(Cancer Cell Informaticsとケミカルバイオロジー, 52(13)) (2007)
  • Author(s): 矢守隆夫
  • Total Pages: 1690-5
• [Book] 蛋白質核酸酵素(ケミカルバイオロジー, 52(13)) (2007)
  • Author(s): 吉田稔
  • Total Pages: 1788-9
• [Book] 化学工業(プロテインキナーゼ阻害物質の探索, 58) (2007)
  • Author(s): 深澤秀輔
  • Total Pages: 295-299
• [Remarks]
  • URL: http://gantoku-shien.jfcr.or.jp/
• [Patent(Industrial Property Rights)] ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤およびその製造方法 (2010)
  • Inventor(s): 吉田稔、西野憲和
  • Industrial Property Rights Holder: 理化学研究所
  • Industrial Property Number: 特許・1640380 (EP)
  • Acquisition Date: 20100000
• [Patent(Industrial Property Rights)] 網羅的ゲノムワイドSNP情報に基づくエピスタシス効果の探索アルゴリズム (2009)
  • Inventor(s): 松浦正明、牛嶋大、磯村実、三木義男、奥泉盛司
  • Industrial Property Rights Holder: 財団法人癌研究会・NECソフト株式会社
  • Industrial Property Number: 特許・特願2009-070753
  • Filing Date: 2009-03-23
• [Patent(Industrial Property Rights)] 解析エンジン交換型システム及びデータ解析プログラム (2009)
  • Inventor(s): 安藤正貴、斎藤彰、石橋雄一、松浦正明、宮田敏、牛嶋大、中村親民、三木義男、野田哲生
  • Industrial Property Rights Holder: 日本電気株式会社、財団法人癌研究会、社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
  • Industrial Property Number: 特許・特許第4421971号
  • Acquisition Date: 2009-12-11
• [Patent(Industrial Property Rights)] 新規化合物セラミダスチン、その製造方法及びその用途 (2008)
  • Inventor(s): 井上裕幸、川田学、池田大四郎
  • Industrial Property Rights Holder: 財団法人微生物化学研究会
  • Industrial Property Number: 特許・特願2008-224606
  • Filing Date: 2008-09-02
• [Patent(Industrial Property Rights)] ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する化合物とそれを有効成分とする医薬(ヒストン脱アセチル化酵素の阻害剤およびその製造方法) (2007)
  • Inventor(s): 西野憲和、吉田稔、中川純一
  • Industrial Property Rights Holder: 九州工業大学、理化学研究所、大正製薬株式会社
  • Industrial Property Number: 特許・PCT/JP2007/064873
  • Filing Date: 2007-07-31
• [Patent(Industrial Property Rights)] 被験物質に対するプローブの結合親和性を測定する方法及びその利用 (2007)
  • Inventor(s): 長谷川慎、川畑隆司、川瀬千晶、伊藤正恵、水上民夫
  • Industrial Property Rights Holder: 学校法人関西文理総合学園
  • Industrial Property Number: 特許・特願2007-089821
  • Filing Date: 2007-03-29
• [Patent(Industrial Property Rights)] PI3キナーゼ阻害剤の効果判定法 (2006)
  • Inventor(s): 旦慎吾、矢守隆夫
  • Industrial Property Rights Holder: 財団法人癌研究会
  • Industrial Property Number: 特許・特願2006-229568
  • Filing Date: 2006-08-25