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2008 Fiscal Year Annual Research Report

脊椎動物起源の研究

Research Project

Project/Area Number 17018018
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

佐藤 矩行  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 教授 (30025481)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 窪川 かおる  京都大学, 海洋研究所, 教授 (30240740)
西駕 秀俊  首都大学, 東京・大学院・理工学研究科, 教授 (60131918)
和田 洋  筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 准教授 (60303806)
藤原 滋樹  高知大学, 教育研究部・自然科学系, 教授 (40229068)
日下部 岳広  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 准教授 (40280862)
Keywords比較ゲノム / 脊椎動物の起源 / 脊索動物の進化 / ナメクジウオ / カタユウレイボヤ / ギボシムシ / シンテニー / 新口動物
Research Abstract

本研究の目的は脊椎動物の進化に至る道筋を比較ゲノム科学的に明らかにすることである。脊椎動物はホヤなどの尾索動物やナメクジウオの頭索動物とともに脊索動物門を形成する。これら3群は脊索や背側神経管など多くの形質を共有し、約5億年以上昔に共通の祖先から進化してきたものと考えられている。しかしその3群の関係が長く不明瞭であった。本年度はこれまでの研究をさらに進め、頭索動物ナメクジウオ(Branchiostoma floridae)のゲノムを解読し、脊椎動物や尾索動物のゲノムと比較することによって、脊索動物の中で頭索動物が最初に分岐したこと、頭索動物と脊椎動物の間にシンテニーの高度の保存が認められることを明らかにした。このことはこれまで1世紀以上にわたって議論されてきた脊索動物の起源と脊椎動物の進化の道筋に決着をつけるものとなったと考えられ。さらに、この新しい脊索動物進化の道筋をもとに、脊索動物の起源についてはaboral-dorsalization仮説を、また、尾索動物の進化についてはadvanced filter feeder仮説を提唱した。現在これらの3群のゲノム比較から、脊椎動物の基本体制の確立に関係したと思われる遺伝子群の解析を進めている。脊索動物の起源と進化の道筋を比較ゲノム科学的にさらに理解するためには、新口動物群(脊索動物+半索動物+棘皮動物)の中で唯一ゲノムが解読されていない半索動物ギボシムシのドラフトゲノムを解読する必要があり、これについてもすでに着手している。これまでに10万程度のESTと、3×のゲノムデータが得られているので、454とソレクサによるリードを増やして、シーケンスを完成させる予定である。

  • Research Products

    (5 results)

All 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The amphioxus genome and the evolution of the chordate karyotype2008

    • Author(s)
      Putnam NH, Butts T, Ferrier DEK, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T, Robinson-Rechavi M, Shoguchi E, Terry A, Yu Jr-K, Benito-Gutierrez E, Dubchak I, Garcia-Fernandez J, Gibson-Brown JJ, Grigoriev IV, Horton AC, de Jong PJ, Jurka J, Kapitonov VV, Kohara Y, Kuroki Y, Lindquist E, Lucas S, Osoegawa K, Pennacchio LA, Salamov AA, Satou Y, Sauka-Spengler T, Schmutz J, Shin-I T, Toyoda A, Bronner-Fraser M, Fujiyama A, Holland LZ, Holland PWH, Satoh N, Rokhsar DS
    • Journal Title

      Nature 453

      Pages: 1064-1071

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The amphioxus genome illuminates vertebrate origins and cephalochordate biology2008

    • Author(s)
      Holland LZ, Albalat R, Azumi K, Benito-Gutierrez E, Blow MJ, Bronner-Fraser M, Brunet F, Butts T, Candiani S, Dishaw LJ, Ferrier DEK, Garcia-Fernandez J, Gibson-Brown JJ, Gissi C, Godzik A, Hallbook F, Hirose D, Hosomichi K, Ikuta T, Inoko.H, Kasahara M, Kasamatsu J, Kawashima T, Kimuta A, Kobayashi M, Kozmik Z, Kubokawa K, Laudet V, Litman GW, McHardy AC, Meulemans D, Nonaka M, Olinski RP, Pancer Z, Pennacchio LA, Pestarino M, Rast JP, Rigoutsos I, Robinson-Rechavi M, Roch G, Saiga H, Sasakura Y, Satake M, Satou Y, Schubert M, Sherwood N, Shiina T, Takatori N, Tello J, Vopalensky P, Wada S, Xu A, Ye Y, Yoshida K, Yoshizaki F, Yu Jr-K, Zhang Q, Zmasek CM, de Jong PJ, Osoegawa K, Putnam NH, Rokhsar DS, Satoh N, Holland PWH
    • Journal Title

      Genome Research 18

      Pages: 1100-1111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An aboral-dorsalization hypothesis for chordate origin2008

    • Author(s)
      Satoh N
    • Journal Title

      Genesis 46

      Pages: 614-622

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Developmental Genomics of Ciona intestinalis2008

    • Author(s)
      佐藤矩行
    • Organizer
      日本発生生物学会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      2008-05-29
  • [Remarks]

    • URL

      http://ghost.zool.kyoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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