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2005 Fiscal Year Annual Research Report

非コード領域DNAマーカーにおける日本近隣ヒト集団の分子遺伝学的異質性の研究

Research Project

Project/Area Number 17390200
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

山本 敏充  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (50260592)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 勝又 義直  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (30109326)
打樋 利英子  名古屋大学, 大学院医学系研究科, 助手 (20223571)
玉木 啓二  京都大学, 大学院医学研究科, 教授 (90217175)
Keywords集団遺伝学 / 非コード領域 / 日本人 / STR / 遺伝的異質性 / 遺伝的系統関係 / 遺伝プール
Research Abstract

我々は、常染色体上の105STRローカスを用いて、これまで、日本人(名古屋・沖縄)、中国人(北京、陝西、湖南、福建、広東)、タイ人(バンコク)、ミャンマー人(ヤンゴン)の計9つの東・東南アジアの地域ヒト集団における、日本人と中国人の遺伝的系統関係や遺伝子プール構造などについて、系統樹作成、多次元分析、Structure-Distructプログラム等による解析を行ってきた。本年度は、これらを成果としてまとめる(文献参照)とともに、これらの結果から、日本人と中国人の異質性を統計学的に算出可能であろうことが示されたので、日本人のデータベースをさらに大きくして精度を上げるため、秋田及び大分より採取した各32名のDNAを用いて、同様に、105ローカスの型判定を行った。これら日本人の二地域集団から得られた型判定結果から、各ローカスのアレル頻度を算出し、ハーディ・ワインベルグ平衡の検定を行ったところ、ほぼ偏りのないサンプリングであることが示された。これらのデータを加えて、計11集団の東・東南アジアのヒト地域集団で新たに開発されたGenetixソフトウエアを用いて、各個人の105ローカス全てのGenotypeについて、三次元的にドットしたところ、日本人(四地域集団)、中国人(北京)、及びその他の六集団(中国人四集団及び東南アジア二集団)が区別された3つのブロックとして空間的に分布した。これらのことから、さらに日本人と中国人との間での異質性を統計学的に計算できるであろうことが示唆された。現在その統計学的識別方法について検討中である。

  • Research Products

    (5 results)

All 2006 2005

All Journal Article (4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Phylogenetic relationship of the populations within and around Japan using 105 short tandem repeat polymorphic loci2006

    • Author(s)
      S-L.Li
    • Journal Title

      Hum.Genet. 118

      Pages: 695-707

  • [Journal Article] Allele frequency distributions at three pentanucleotide repeat STR in a Japanese population2006

    • Author(s)
      H.Ohtaki
    • Journal Title

      J.Forensic Sci. 51(1)

      Pages: 193-194

  • [Journal Article] 新しいペンタヌクレオチドSTRマルチプレックス・タイピングシステム2005

    • Author(s)
      打樋利英子
    • Journal Title

      DNA多型 13

      Pages: 21-23

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] 日本人で識別力の高い非コード領域のSNPsのアリール特異的PCRマルチプレックス判定法2005

    • Author(s)
      井上知加子
    • Journal Title

      DNA多型 13

      Pages: 24-26

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Book] DNA鑑定-その能力と限界-2005

    • Author(s)
      勝又 義直
    • Total Pages
      305
    • Publisher
      名古屋大学出版会
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より

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Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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