2007 Fiscal Year Annual Research Report
バイオインフォマティックスによる歯根膜幹細胞の分子基盤研究
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17390561
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
山田 聡 Osaka University, 歯学部附属病院, 講師 (40359849)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
野崎 剛徳 大阪大学, 大学院・歯学研究科, 助教 (30263304)
橋川 智子 大阪大学, 大学院・歯学研究科, 助教 (00362682)
柳田 学 大阪大学, 大学院・歯学研究科, 助教 (80379081)
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| Keywords | DNAチップ解析 / 歯根膜幹細胞 / IDI |
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| Research Abstract |
1)新規歯根膜幹細胞遺伝子の検索とその機能解析
昨年度に作成した歯根膜細胞発現遺伝子プロファイルを解析することにより,歯根膜細胞にのみ高い発現を示す新規遺伝子,あるいは歯根膜幹細胞の分化段階で特異的な発現パターンを示す新規遺伝子を抽出を試みた。その結果、分化初期に高い発現を示し分化に伴ってその発現が低下する幹細胞遺伝子、ID1を見いだした。歯根膜細胞において、ID1特異的siRNAにより内在性ID1の発現を抑制することにより、硬組織形成分化に伴って誘導されるALPase活性、石灰化物形成、およびRunx2、Osterix、Osteocalcin、Osteopontin遺伝子発現が抑制された。さらに、ID1と同時に他のIDファミリーであるID2、3、4を発現抑制することにより、BMP-2刺激誘導性のALPase活性、Osterix、Osteocalcin遺伝子の発現が抑制された。
2)データベース情報解析による分子基盤構築
DNAチップによる大規模・網羅的遺伝子発現解析の結果得られた歯根膜細胞発現遺伝子プロファイルを統計解析することにより、歯根膜細胞が歯根膜-セメント質-骨組織複合体形成へと分化する過程において発現が変化する遺伝子のクラスタリング解析を行った。その結果、硬組織形成細胞分化過程において5つのクラスターに分類された。発現上昇の程度で2つのクラスターに、発現減少の程度で2つのクラスターに、また全体としては大きく発現がしない1つのクラスターに分類された。さらにGeneOntology解析することにより、遺伝子パスウェイを解明し、得られた情報を基に、遺伝子発現データベースを構築した。
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