2020 Fiscal Year Annual Research Report
Global landscape genomics of mangrove trees for conservation
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17H01414
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
梶田 忠 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (80301117)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
岩崎 貴也 神奈川大学, 理学部, 助教 (10636179)
津田 吉晃 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (40769270)
高山 浩司 京都大学, 理学研究科, 准教授 (60647478)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 生物多様性保全 / 自然現象観測・予測 / ゲノム解析 / マングローブ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
■サンプル調整・入手・ゲノム解析: 前年度に引き続き入手済のDNAサンプルを精製することで、景観ゲノミクス解析のために必要なサンプルを取得した。ホウガンヒルギについては国立科学博物館の協力を得て、全ゲノム解析を進めた。また、 本研究に関連して応募中のゲノム支援事業が採択されたため、メキシコ自治大学の共同研究者からゲノム決定に必要なAvicennia属植物のサンプルのDNAを準備して、全ゲノム配列の決定を開始した。その他、関連する数種の植物についてもゲノム解析実験を開始した。
■DNA解析実験: 計画調書の記載のサンプリングスキームに基づく集団サンプルについて、ゲノム解析実験を進めた。特に、インド洋・太平洋 地域に分布するホウガンヒルギと、新大陸(特にメキシコ)のマングローブ種について、リシーケンシングデータの解析を継続実施した。。
■データ解析と研究発表: アメリカヒルギのリシーケンシングデータについては景観遺伝学的解析をほぼ完成させることができたので、引き続き論文発表の準備を進めた。また、ホウガンヒルギとその他のマングローブ植物について、系統地理学的解析と景観ゲノム解析を行った。また、マングローブ植物と同様の分布域を持ち、分布拡大・維持機構がマングローブ植物に類似している海流散布植物のゲノム解析についても、データ解析と論文発表を進めた。得られた研究成果について、9月の日本植物学会と12月のマングローブ学会で研究発表を行った。
■国際共同研究: ブラジルの共同研究者らと共に、新大陸のマングローブ植物についてのデータ解析と論文発表を行った。さらに、これまでに国際連携の遅れていた西アフリカ地域について、セネガルの研究者と共同研究体制を構築できたため、西アフリカ地域に分布するマングローブ植物についても、今後の研究用サンプルの入手についての準備が整った。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(11 results)
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[Presentation] ゲノムデータを用いたホウガンヒルギの遺伝的多様性と自然選択の検出2020
Author(s)
Ryosuke Imai,Yoshiaki Tsuda, Takashi Yamamoto,Yuki Tomizawa, Nazre Saleh,Alison K. S. Wee,Koji Takayama,Orlex B. Yllano,Severino Iii Salmo,Sarawood Sungkaew, Bayu Adjie,Erwin Ardli,Monica Suleiman,Nguyen X. Tung, Khinkhin Soe,Kathiresan Kandasamy,Takeshi Asakawa, Yasuyuki Watano,Shigeyuki Baba, Tadashi Kajita
Organizer
日本植物学会第84回大会
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[Presentation] ゲノムデータを用いたホウガンヒルギの遺伝的多様性と自然選択の検出2020
Author(s)
Ryosuke Imai,Yoshiaki Tsuda, Takashi Yamamoto,Yuki Tomizawa, Nazre Saleh,Alison K. S. Wee,Koji Takayama,Orlex B. Yllano,Severino Iii Salmo,Sarawood Sungkaew, Bayu Adjie,Erwin Ardli,Monica Suleiman,Nguyen X. Tung, Khinkhin Soe,Kathiresan Kandasamy,Takeshi Asakawa, Yasuyuki Watano,Shigeyuki Baba, Tadashi Kajita
Organizer
第26回日本マングローブ学会大会
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