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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Structural mechanism of the Wnt-receptor interaction

Research Project

Project/Area Number 17H01420
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

高木 淳一  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (90212000)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
KeywordsWntシグナル / X線結晶構造解析 / 受容体 / 蛋白質間相互作用
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、細胞外のWntリガンドが膜受容体に認識され、その情報が細胞膜を横切って伝達されて細胞の挙動を左右する引き金を引くメカニズムを原子分解能の立体構造レベルで明らかにすることを目指し、4つの業務項目に従って研究を進めてきたが、昨年度に得られた結果を踏まえ、2つについては終了とし、残る以下の2項目について実施した。
(項目1)ほ乳類Wnt特異的バインダーの取得とそれらの機能解析:東京大学の菅裕明教授が開発した特殊環状ペプチドスクリーニング法「RaPIDシステム」を応用し、マウスWnt3aに対する環状ペプチドバインダーを合計13種単離することが出来た。これらペプチドのうち一つ(PD04)はWntシグナル伝達阻害活性を持つことが明らかになり、このペプチドの配列の一部をランダム化したライブラリーを用いて改変をおこない、親和性が5倍程度上昇した変異体(PD04r1)を得ることに成功した。この一連の結果を論文投稿し、年度内に受理されて発表することが出来た。
(項目2)Wnt-Fz CRD-2者、およびWnt-Fz-LRP6ec3者複合体(細胞外装置)の構造解析: Wnt-Fz CRD2者複合体の結晶構造(哺乳類Wntの立体構造解析としては世界初)を達成し、この成果をNature Struct Mol Biol誌に発表することができた。3者複合体については、2者複合体の立体構造をヒントにLRP6に結合するWnt3上の領域を予想し、その領域に相当する合成ペプチドを作製して上記の2者複合体結晶へのペプチドソーキングによって3者複合体結晶化を目指した。結晶化と回折データの取得まで果たしたが、残念ながら得られた構造中にはLRP6ペプチドの電子密度は観測されなかった。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (24 results)

All 2020 2019 2017

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 4 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 7 results) Patent(Industrial Property Rights) (4 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] The constitutive high affinity Met binding site in the kringle domain is dispensable for the signaling activity of hepatocyte growth factor.2020

    • Author(s)
      Umitsu M, Sakai K, Tamura-Kawakami K, Matsumoto K, Takagi J.
    • Journal Title

      JOURNAL OF BIOCHEMISTRY

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ラミニン3量体の立体構造解析とインテグリンとの相互作用2019

    • Author(s)
      瀧沢 士、有森貴夫、谿口征雅、高木淳一、関口清俊
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 59(2) Pages: 91-93

    • DOI

      doi:10.2142/biophys/59.091

  • [Journal Article] Advances in domain and subunit localization technology for electron microscopy.2019

    • Author(s)
      Brown ZP, Takagi J
    • Journal Title

      Biophysical reviews

      Volume: 11(2) Pages: 149-155

    • DOI

      10.1007/s12551-019-00513-6

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural Basis of Sarco/Endoplasmic Reticulum Ca<sup>2+</sup>-ATPase 2b Regulation via Transmembrane Helix Interplay.2019

    • Author(s)
      Inoue M, Sakuta N, Watanabe S, Zhang Y, Yoshikaie K, Tanaka Y, Ushioda R, Kato Y, Takagi J, Tsukazaki T, Nagata K, Inaba K
    • Journal Title

      Cell reports

      Volume: 27(4) Pages: 1221-1230

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.03.106

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural basis for oligomerization of the prokaryotic peptide transporter PepTSo22019

    • Author(s)
      Reina Nagamura, Masahiro Fukuda, Akihiro Kawamoto, Kyoko Matoba, Naoshi Dohmae, Ryuichiro Ishitani, Junichi Takagi, Osamu Nureki
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications

      Volume: 75(5) Pages: 348-358

    • DOI

      /10.1107/S2053230X19003546

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of a mammalian Wnt-frizzled complex.2019

    • Author(s)
      Hirai H, Matoba K, Mihara E, Arimori T, Takagi J
    • Journal Title

      Nature structural & molecular biology

      Volume: 26(5) Pages: 372-379

    • DOI

      10.1038/s41594-019-0216-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Macrocyclic peptide-based inhibition and imaging of hepatocyte growth factor.2019

    • Author(s)
      Sakai K, Passioura T, Sato H, Ito K, Furuhashi H, Umitsu M, Takagi J, Kato Y, Mukai H, Warashina S, Zouda M, Watanabe Y, Yano S, Shibata M, Suga H, Matsumoto K
    • Journal Title

      Nature chemical biology

      Volume: 15(6) Pages: 598-606

    • DOI

      10.1038/s41589-019-0285-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distinct Localization of Mature HGF from its Precursor Form in Developing and Repairing the Stomach.2019

    • Author(s)
      Jangphattananont N, Sato H, Imamura R, Sakai K, Terakado Y, Murakami K, Barker N, Oshima H, Oshima M, Takagi J, Kato Y, Yano S, Matsumoto K
    • Journal Title

      International journal of molecular sciences

      Volume: 20(12) Pages: -

    • DOI

      10.3390/ijms20122955

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Impaired ligand-dependent MET activation caused by an extracellular SEMA domain missense mutation in lung cancer.2019

    • Author(s)
      Miao W, Sakai K, Sato H, Imamura R, Jangphattananont N, Takagi J, Nishita M, Minami Y, Matsumoto K
    • Journal Title

      Cancer science

      Volume: 110(10) Pages: 3340-3349

    • DOI

      10.1111/cas.14142

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural Mechanism of Laminin Recognition by Integrins2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      Gordon Research Conference 2019 -Fibronectin, Integrins and Related Molecules-
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Crystal structure of human Wnt3 reveals its signaling mechanism on cell surface2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      Seminar at Universita Cattolica del Sacro Cuore
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] LassoGraft Technology による新規バイオ医薬品モダリティの創成2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      第5回蛋白質工学研究会ワークショップ『産業展開と構造生物学』
    • Invited
  • [Presentation] Crystal structure of human Wnt3 in complex with mouse Frizzled 82019

    • Author(s)
      高木 淳一、平井秀憲、的場京子、有森貴夫、三原恵美子
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会 Joint Symposium “New perspectives on Wnt signaling, unveiled by structural and cell biology”
    • Invited
  • [Presentation] 抗MAPタグ抗体の結晶構造とMAPタグシステムの新たな応用法2019

    • Author(s)
      有森貴夫,若狭彩美,金子美華,加藤幸成,高木淳一
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
  • [Presentation] Screening of compounds modulating the expression profile of Alzheimer's rist factor, SORL12019

    • Author(s)
      Yu Kitago, Lavoisier Ramos-Espiritu, Rui Wu, Rebecca Cox, J Fraser Glickman, Greg A Petsko, Junichi Takagi
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
  • [Presentation] ダイナミックな運動性をもつマルチドメイン蛋白質HGFの高難度結晶化の試み2019

    • Author(s)
      中村希、岩佐奈実、川上紗代子、有森貴夫、酒井克也、松本邦夫、高木淳一
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
  • [Presentation] Redesigning the small antibody fragment “Fv-clasp” by using heterodimeric SARAH domains2019

    • Author(s)
      Mercy Egrina Adiniko, Takao Arimori, Junichi Takagi
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
  • [Presentation] 理学研究者が行うタンパク質工学~アカデミアが目指すべき技術開発とは?2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      2019年度生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー
    • Invited
  • [Presentation] X線とクライオ電顕で迫るラミニン結合性インテグリンα6β1の構造2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      第二回構造生命科学研究会
    • Invited
  • [Presentation] LassoGraft Technologyによる新規バイオ医薬品モダリティの創成2019

    • Author(s)
      高木 淳一
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会シンポジウム「日本発新バイオ医薬品イノベーションを目指す最先端創薬」
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 歯の再生治療のためのUSAG-1を標的分子とした中和抗体2019

    • Inventor(s)
      高橋克、菅井学、時田義人、高木淳一、三原恵美子
    • Industrial Property Rights Holder
      高橋克、菅井学、時田義人、高木淳一、三原恵美子
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2019-130153
  • [Patent(Industrial Property Rights)] プレキシンの結合調節剤2017

    • Inventor(s)
      菅裕明、バシルディン ナセル、高木淳一、松永幸子
    • Industrial Property Rights Holder
      菅裕明、バシルディン ナセル、高木淳一、松永幸子
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特許第6656661号
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 環状ペプチドをタンパク質構造に提示させる超汎用法2017

    • Inventor(s)
      菅裕明、高木淳一
    • Industrial Property Rights Holder
      菅裕明、高木淳一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      06598344
  • [Patent(Industrial Property Rights)] Fragment Antibody and Method for Crystallizing Protein using Fragment Antibody2017

    • Inventor(s)
      Junichi Takagi
    • Industrial Property Rights Holder
      Junichi Takagi
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      10,513,562
    • Overseas

URL: 

Published: 2021-01-27  

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