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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Synthesis and characterization of metallo-DNA nanowire with infinite, uninterrupted one-dimensional metal ions array

Research Project

Project/Area Number 17H03033
Research InstitutionKanagawa University

Principal Investigator

小野 晶  神奈川大学, 工学部, 教授 (10183253)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 近藤 次郎  上智大学, 理工学部, 准教授 (10546576)
實吉 尚郎  滋賀医科大学, 医学部, 助教 (10564784)
山田 亮  大阪大学, 基礎工学研究科, 准教授 (20343741)
田中 好幸  徳島文理大学, 薬学部, 教授 (70333797)
鳥越 秀峰  東京理科大学, 理学部第一部応用化学科, 教授 (80227678)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2021-03-31
Keywordsmetallo-DNA/RNA / DNA nanowire / DNA/RNA synthesis / metallo-base pairs / DNA Supermolecule / Crystal structure / Molecule Conductance / DNA/RNA synthesis
Outline of Annual Research Achievements

2020年度の研究目標は、2019年度に引き続き、DNA二重鎖中で無限に金属イオンが連続する超分子錯体(金属-DNAワイヤー)を合成し、その構造と物性を研究することであった。これまでの研究により、Ag(I)-DNAワイヤーを与えるオリゴヌクレオチド、5’-(GGACTBrC GACTCC)-3’ (Nature Chemistry, 2017, 9, 956-960), 及び、5’-d(CGCGCBrUCBrUCGCG)-3’ (論文作成中)を見出した。即ち、これらのオリゴヌクレオチドとAg(I)イオンの溶液からAg(I)-DNAワイヤーの結晶を得た。さらに2019年度はHg(II)とTTTGCの混液から、DNA構造に沿ってHg(II)イオンが連続する、長鎖のHg(II)-DNAワイヤーの結晶を得た(Angew. Chem. Int. Ed., 2019, 58, 16835-16338)。
2020年度は、NMR法を用いてAg(I)-DNAワイヤーの溶液中の構造を研究した結果、結晶構造と同様のワイヤー構造が溶液中で形成されることを確認した。即ち、結晶構造を与えた5’-d(CGCGCBrUCBrUCGCG)-3’と、その3’末端のG(グアニン)残基を取り除いた5’-d(CGCGCBrUCBrUCGC)-3’は、溶液中で連続する11ヶのAg(I)イオンを含む短鎖のAg(I)-DNAワイヤーを与えることが分かった。一方、結晶構造を与えた5’-d(CGCGCBrUCBrUCGCG)-3’のNMRスペクトルが、Ag(I)イオンを添加するにつれてブロードとなったことから、5’-d(CGCGCBrUCBrUCGCG)-3は溶液中で長鎖のAg(I)-DNAワイヤーを与えることが示唆された。即ち、オリゴヌクレオチドとAg(I)イオンから長鎖のAg(I)-DNAワイヤーが形成されるプロセスが明らかとなった。短鎖のAg(I)-DNAワイヤーは、単分子物性研究に有用であると期待される。
チミン-Hg(II)-チミン塩基対を有する短鎖DNA二重鎖の導電性を測定したことは、単分子物性解析の端緒となった。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Electrical conductance measurement of HgII-mediated DNA duplex in buffered aqueous solution2020

    • Author(s)
      Ryo Yamada, Issei Nomura, Yuki Yamaguchi, Yosuke Matsuda, Yoshikazu Hattori, Hirokazu Tada, Akira Ono, Yoshiyuki Tanaka
    • Journal Title

      Nucleosides, Nucleotides, & Nucleic Acids

      Volume: 39 Pages: 1083-1087

    • DOI

      10.1080/15257770.2020.1755044

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 短鎖 Ag-DNAワイヤーの溶液中での形成と結晶構造2021

    • Author(s)
      厚木 隆裕、近藤 次郎、小野 晶
    • Organizer
      日本化学会第101春季年会
  • [Presentation] チオール側鎖を有するオリゴヌクレオチドの合成と高次構造形成2021

    • Author(s)
      三上 智紀、小野 晶
    • Organizer
      日本化学会第101春季年会
  • [Presentation] 塩基部修飾オリゴヌクレオチドの合成と高次構造形成2021

    • Author(s)
      鈴木 海斗、藤原 章司、小野 晶
    • Organizer
      日本化学会第101春季年会

URL: 

Published: 2021-12-27  

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