2019 Fiscal Year Annual Research Report
Single cell analysis of autoimmune liver diseases
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17H04058
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
原田 憲一 金沢大学, 医学系, 教授 (30283112)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
橋本 真一 和歌山県立医科大学, 和歌山県立医科大学 先端医学研究所, 教授 (00313099)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 病理 / 原発性胆汁性胆管炎 / 1細胞遺伝子解析 / 肝疾患 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、原発性胆汁性胆管炎 (PBC)２症例から得られたシングルセルデータに加えオープンアクセスとして近年公表されたシングルセルトランスクリプトームデータ（GSE: gene expression omnibus series, no.115460, 124395, 125449, 130473, 136103）5セットを用いて統合的解析を行った。具体的には、PBC肝における構成細胞種を同定・比較し、疾患特異的な細胞動態の解析、さらに肝のシングルセルのメタデータとしても利用し、胆管細胞や肝細胞の性質、また疾患を特徴付けるマーカー遺伝子について解析し下記の結果を得た。
１. 疾患特異的病態：疾患・サンプル間を越えて共通の性質を持つ細胞型とその亜型が見られた。特に制御性T細胞がPBC肝で増加していること、またPBCの１症例でマクロファージ由来のケモカイン(CCL8など)産生が強かった。
２. メタデータとして標的分子および各細胞型の解析：シングルセルレベルにおいても肝臓を構成する肝細胞のゾーネーションが確認された。また胆管細胞には４種類タイプが同定された。すなわち①粘液を産生する成熟胆管細胞の他、前駆細胞マーカーを発現する細胞ので②肝細胞マーカーの発現が弱く胆管細胞マーカーの発現がやや強いもの③肝細胞マーカーの発現が強く胆管細胞マーカーの発現が弱いもの④どちらも弱いが前駆細胞マーカーの発現がやや強いものに分けられた。さらに胆管細胞癌においても類似の層別化ができ、正常胆管細胞と類似した細胞分化の違いが示唆された。また、遺伝子レベルでは胆管細胞は全般的にvimentinを発現しており、相関解析では特に間葉系関連のマーカー遺伝子群との関連が示唆された。最後にKRT7陽性肝細胞では胆管細胞のマーカー遺伝子の発現が強い傾向にあり、胆管への形質転換を示唆する肝細胞集団であることが示唆された。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(24 results)
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[Journal Article] Serum C16:1n7/C16:0 ratio as a diagnostic marker for nonalcoholic steatohepatitis2019
Author(s)
Kazutoshi Yamada, Eishiro Mizukoshi, Takuya Seike, Rika Horii, Takeshi Terashima, Noriho Iida, Masaaki Kitahara, Hajime Sunagozaka, Kuniaki Arai, Tatsuya Yamashita, Masao Honda, Toshinari Takamura, Kenichi Harada and Shuichi Kaneko
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Journal Title
Journal of Gastroenterology and Hepatology
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] EFFICACY AND SAFETY OF E6011,ANTI-HUMAN FRACTALKINE MONOCLONAL ANTIBODY, INPATIENTS WITH PRIMARY BILIARY CHOLANGITIS WITH AN INCOMPLETE RESPONSE TO URSODEOXYCHOLIC ACID:A PLACEBO-CONTROLLED DOUBLE-BLIND COMPARISON PHESE 2 STUDY2019
Author(s)
Atsushi Tanaka, Masabiru Abe, Tadashi Namisaki, Shinji Shimoda, Mikiko Zeniya, Akio Ido, Hitoshi Yoshiji, Hiromasa Ohira, Kenichi Harada, Yuko Kakuda, Atsushi Umeda, Yuki Kamiya, Yukari Higasine, Seiichiro Hojo, Toshio Imai, Tetsu Kawano, Yasuni Nakanuma, Hirohito Tsubouchi.
Organizer
AASLD The Liver Meeting 2019
Int'l Joint Research
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