2019 Fiscal Year Annual Research Report
原発性胆汁性胆管炎の発症と重症化機構解明のためのGWASを基盤とした統合解析
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17H04169
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| Research Institution | Department of Clinical Research, National Hospital Organization Nagasaki Medical Center |
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Principal Investigator |
中村 稔 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 客員研究員 (40217906)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川嶋 実苗 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員 (00396706)
人見 祐基 星薬科大学, 薬学部, 特任講師 (10525819)
下田 慎治 九州大学, 大学病院, 准教授 (30279319)
安波 道郎 地方独立行政法人佐賀県医療センター好生館(ライフサイエンス研究所), ライフサイエンス研究所, 部長 (80244127)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 原発性胆汁性胆管炎 / ゲノムワイド関連解析 / トランスクリプトーム / 疾患感受性遺伝子 / 疾患発症経路 / 分子標的 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、“原発性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangitis :PBC)の長期観察研究”を継続して①PBCの疾患活動性、長期予後、病型分類などに関する詳細な臨床情報と患者検体（血清、DNA, 肝生検組織など）の収集を継続するとともに、②ゲノムワイド関連解析(Genome-wide association study: GWAS)の解析症例数を増やして、PBC疾患関連遺伝子の同定、疾患発症経路の解析を行った。③イギリスケンブリッジ大学、イタリアミラノ大学などとの国際PBC-GWAS メタ解析を実施し、世界規模での疾患感受性遺伝子と疾患発症経路の解析を行った。④GWASと肝生検組織のトランスクリプトームの統合解析によるPBCの発症経路の同定、分子標的候補の同定を試みた。
日本人PBC 2049検体とコントロール1985例のGWASから、⑤Chr3q13.33領域に新たなPBC疾患感受性遺伝子POGLUT1が同定され、⑥GWASとトランスクリプトームとの統合解析からは、PBC疾患発症に最も重要な上流因子としてIFNGとCD40Lが同定された。現在、⑥ゲノム編集を用いた責任SNPの機能解析、PBCと他の疾患のトランスクリプトームの比較検討、ゲノム情報解析技術を駆使して国際メタ解析で得られた情報のpost-GWAS解析に取り組んでいる。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(18 results)
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[Journal Article] Role of deleterious single nucleotide variants in the coding regions of TNFAIP3 for Japanese autoimmune hepatitis with cirrhosis2019
Author(s)
Higuchi T, Oka S, Furukawa H, Nakamura M, Komori A, Abiru S, Hashimoto S, Shimada M, Yoshizawa K, Kouno H, Naganuma A, Ario K, Kaneyoshi T, Yamashita H, Takahashi H, Makita F, Yatsuhashi H, Ohira H, Migita K.
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 9(1)
Pages: 7925
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Galectin-9 in autoimmune hepatitis: Correlation between serum levels of galectin-9 and M2BPGi in patients with autoimmune hepatitis2019
Author(s)
Matsuoka N, Kozuru H, Koga T, Abiru S, Yamasaki K, Komori A, Fujita Y, Tenmoku J, Asano T, Sato S, Suzuki E, Furuya M, Kobayashi H, Watanabe H, Naganuma A, Yoshizawa K, Shimada M, Ario K, Yamashita H, Kohno H, Kaneyoshi T, Nakamura M, Furukawa H, Takahashi A, Kawakami A, Ohira H, Yatsuhashi H, Migita K.
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Journal Title
Medicine (Baltimore)
Volume: 98(35)
Pages: e16924
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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