2019 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive analysis of gut microbiome and epigenetic changes in esophageal cancer.
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17H04273
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
馬場 祥史 熊本大学, 病院, 非常勤診療医師 (20599708)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
美馬 浩介 熊本大学, 病院, 非常勤診療医師 (00546559)
澤 智裕 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (30284756)
吉田 直矢 熊本大学, 病院, 特任准教授 (60467983)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | LINE-1 / microbiome / 腫瘍免疫 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、食道癌データバンクを用いて、食道癌におけるMicrobiome（ヒト微生物叢）とエピジェネティック変化(LINE-1≒ゲノム全体のメチル化)の関連を網羅的に解析し、革新的なbiomarkerを開発することである。Fusobacteriumは主に口腔内に生息するmicrobiomeの一種で、一般的には歯周病の原因菌として知られている。これまで、Fusobacterium nucleatum陽性食道癌症例は有意に予後不良であり、Fusobacterium nucleatumが食道癌の進展・浸潤に関与していることを報告している。
今回、300例以上のデータバンクを用いた追加解析によってFusobacterium nucleatum 陽性食道癌症例はLINE-1メチル化レベルが有意に低いことが明らかになった。次に、そのメカニズム解析を行うために、まずはLINE-1メチル化とLINE-1増幅・転位との関係を評価した。消化器癌300例以上を解析したところ、LINE-1低メチル化症例では有意にLINE-1増幅が認められた。さらに、次世代シーケンサーを用いたL1Hsの体細胞新規挿入部位解析パイプラインにて、癌特異的なLINE-1転位部位を同定した。
LINE-1と腫瘍免疫との関係についても検討を行っており、癌細胞周囲にリンパ球の浸潤が少ない症例では予後不良であることを報告した(Br J Surgery 2019)。また、LINE-1低メチル化食道癌症例では腫瘍免疫が抑制されていることを明らかにし、世界で初めて報告した(Ann Surg 2019)。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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