• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Foundation construction and clinical application of next-generation RNA biomarker

Research Project

Project/Area Number 17H04282
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小関 準  大阪大学, 医学系研究科, 特任助教(常勤) (20616669)
今野 雅允  大阪大学, 医学系研究科, 寄附講座講師 (80618207)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords癌 / 臨床 / 外科 / 核酸 / トランスレーショナルリサーチ
Outline of Annual Research Achievements

平成29年度から令和元年度までの研究期間の内、令和元年度においては、体液中に分泌される小さな非コードRNAの疾患バイオマーカーとしての有用性を確認した。私達は、質量分析法により、マイクロRNA配列上の特定部位のメチル化修飾を計測する新技術を世界で初めて開発した。私達のパイロット研究で、膵癌を含む消化器癌の早期診断において、従来のバイオマーカーを凌駕する高い性能が得られている。マイクロRNAのメチル化は、細胞組織のエピゲノム病態を反映しているため、高精度に得られた計測結果は、早期診断やサブクラス分類にきわめて有用である。本計画ではこの『コア技術』を活用して、消化器癌や他の疾患を含めて幅広く検討し、『データ科学』に基づく次世代医療のバイオマーカーとして確立する研究を実施した。マイクロRNA配列上の特定部位のメチル化修飾を計測する技術とともに、この部位に関する生化学的な重要性を明らかにするために動物モデルを構築し、人における次世代型RNAバイオマーカーの基盤構築と臨床応用を目指して開発研究を行った。現在この研究で得られた知的財産の整備と産学連携導出に向けた活動を展開している。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2020 2019

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] One-carbon metabolism for cancer diagnostic and therapeutic approaches2020

    • Author(s)
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Koseki Jun、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Cancer Letters

      Volume: 470 Pages: 141~148

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.11.023

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Theoretical analyses and experimental validation of the effects caused by the fluorinated substituent modification of DNA2020

    • Author(s)
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Horie Naohiro、Tsunekuni Kenta、Kawamoto Koichi、Obika Satoshi、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 1138

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57899-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Distinct methylation levels of mature microRNAs in gastrointestinal cancers2019

    • Author(s)
      Konno Masamitsu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Yamagata Akira、Shimamura Teppei、Motooka Daisuke、Okuzaki Daisuke、Kawamoto Koichi、Mizushima Tsunekazu、Eguchi Hidetoshi、Takiguchi Shuji、Satoh Taroh、Mimori Koshi、Ochiya Takahiro、Doki Yuichiro、Ofusa Ken、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 3888

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11826-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reproducibility of CRISPR-Cas9 methods for generation of conditional mouse alleles: a multi-center evaluation2019

    • Author(s)
      Gurumurthy Channabasavaiah B.、Ishii Hideshi、Nakashima Kenichi、Obata Yuichi、Ogiwara Sanae、Ouellet Mariette、Oxburgh Leif、Piltz Sandra、Pinz Ilka、Ponnusamy Moorthy P、Burgio Gaetan
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 20 Pages: 171

    • DOI

      10.1186/s13059-019-1776-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CD44/CD133-Positive Colorectal Cancer Stem Cells are Sensitive to Trifluridine Exposure2019

    • Author(s)
      Tsunekuni Kenta、Konno Masamitsu、Haraguchi Naotsugu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Matsuoka Kazuaki、Kobunai Takashi、Takechi Teiji、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 14861

    • DOI

      10.1038/s41598-019-50968-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Application of C. elegans cancer screening test for the detection of pancreatic tumor in genetically engineered mice2019

    • Author(s)
      Ueda Yuji、Kawamoto Koichi、Konno Masamitsu、Noguchi Kozo、Kaifuchi Satoru、Satoh Taroh、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Hirotsu Takaaki、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 10 Pages: 5412~5418

    • DOI

      10.18632/oncotarget.27124

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A Hydrogen Peroxide Activatable Gemcitabine Prodrug for the Selective Treatment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma2019

    • Author(s)
      Matsushita Katsunori、Konno Masamitsu、Kasahara Yuuya、Morihiro Kunihiko、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi、Obika Satoshi
    • Journal Title

      ChemMedChem

      Volume: 14 Pages: 1384~1391

    • DOI

      10.1002/cmdc.201900324

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Significant Epitranscriptomes in Heterogeneous Cancer2019

    • Author(s)
      Konno Masamitsu、Taniguchi Masateru、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 110 Pages: 2318~2327

    • DOI

      10.1111/cas.14095

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Computational analyses for cancer biology based on exhaustive experimental backgrounds2019

    • Author(s)
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Cancer Drug Resistance

      Volume: 2 Pages: 419~427

    • DOI

      10.20517/cdr.2019.33

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] RNA metabolism can be a novel new bio marker for malignant gastrointestinal cancer2019

    • Author(s)
      M. Konno, H. Ishii,
    • Organizer
      Cell Symposia: Regulatory RNAs
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNA 塩基修飾を指標とした早期膵がんの新規バイオマーカー2019

    • Author(s)
      今野 雅允、小関 準、島村 徹平、浅井 歩、石井 秀始
    • Organizer
      第21回日本RNA学会年会
  • [Presentation] 転移とEMT・がん幹細胞2019

    • Author(s)
      石井 秀始
    • Organizer
      第28回 日本がん転移学会学術集会・総会
  • [Presentation] 代謝を利用した診断2019

    • Author(s)
      石井 秀始、曽我 朋義
    • Organizer
      第7回がんと代謝研究会in仙台
  • [Presentation] RNA 代謝ががんの悪性化を生み出す2019

    • Author(s)
      今野雅允、小関 準、島村 徹平、浅井 歩、石井 秀始
    • Organizer
      第7回がんと代謝研究会in仙台
  • [Presentation] がんエピトランスクリプトームを活用した新しい診断と治療2019

    • Author(s)
      石井 秀始
    • Organizer
      第11回日本RNAi研究会(The 11th JARI Annual Meeting)
  • [Presentation] Innovative technology for next generation liquid biopsy 次世代リキッドバイオプシーのための新技術2019

    • Author(s)
      石井 秀始、Chwee Teck Lim
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 消化器がん治療のための理論科学手法と機械学習を駆使した創薬研究2019

    • Author(s)
      小関 準、今野 雅允、土岐 祐一郎、石井 秀始
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] エピトランスクリプトーム ー消化器がんの新規バイオマーカー2019

    • Author(s)
      今野 雅允、石井 秀始
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi